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公开(公告)号：CN119108006A
公开(公告)日：2024-12-10
申请号：CN202310626433.7
申请日：2023-05-30
申请人： 深圳华大生命科学研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
摘要： 本申请涉及一种蛋白质功能识别方法、装置、计算机设备和存储介质。所述方法包括：获取待测蛋白质的结构特征序列；基于结构特征序列中的各个子结构的相对排列关系确定结构特征序列中每个子结构对应的结构排列信息，并基于结构排列信息生成每个子结构对应的结构特征向量；将基于各个子结构的结构特征向量所确定的待测输入数据，输入至蛋白质功能识别模型，输出蛋白质功能特征向量；根据蛋白质功能特征向量中各元素排列信息，确定待测蛋白质对应的功能属性。采用本方法能够有效提高蛋白质功能识别的效率。
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公开(公告)号：CN119072545A
公开(公告)日：2024-12-03
申请号：CN202280094043.3
申请日：2022-03-23
申请人： 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： C12N15/10 , C12N15/66 , C12Q1/689 , C12Q1/6895
摘要： 提供了基因组片段组装方法，特别涉及噬菌体基因组片段的表达元件组合、表达载体、宿主、应用及组装方法。在大肠杆菌体内实现噬菌体基因组大片段直接组装，利用该技术可以一步实现噬菌体基因组的改造、组装、激活，极大缩短实验周期、提高改造人造噬菌体的效率。该方法也适用于其他情景下的大片段和/或小片段组装，可用于常规分子克隆实验。
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公开(公告)号：CN119028456A
公开(公告)日：2024-11-26
申请号：CN202310587343.1
申请日：2023-05-23
申请人： 深圳华大生命科学研究院 , 三亚华大生命科学研究院
IPC分类号： G16B40/30 , G16B30/00 , G06F18/2135 , G06F18/23213
摘要： 本申请涉及一种基于测序数据降维的分析方法及装置，所述方法包括：获取多个样本在多个预定位点的测序结果；针对所述多个预定位点的至少一部分，分别基于各所述样本之间的测序结果差异，以便获得多个初始亲缘关系矩阵；和基于所述多个初始亲缘关系矩阵，确定所述多个样本之间的亲缘关系；和/或基于所述样本间亲缘关系，对所述测序结果进行主成分分析、聚类分析的至少之一。本发明所述方法可有效对海量数据进行降维分析，可显著降低内存占有量，减少用户等待运算的时间。
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公开(公告)号：CN119013420A
公开(公告)日：2024-11-22
申请号：CN202280094276.3
申请日：2022-09-30
申请人： 深圳华大生命科学研究院
摘要： 一种生物芯片的自动化控制方法及其自动化控制系统，自动化控制方法包括通过移液机构携带抽吸部件吸取试剂、通过移液机构携带已吸取试剂的抽吸部件向生物芯片加入试剂的操作，还提供了采用生物芯片的自动化控制方法的生物芯片自动化控制系统，生物芯片的自动化控制方法和系统可以对多张生物芯片自动调度与控制，从而完成对组织内生物信息的标记和捕获，并能对捕获产物执行整体收集，满足对生物芯片的高利用率高自动程度的处理要求。
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公开(公告)号：CN118931817A
公开(公告)日：2024-11-12
申请号：CN202410610952.9
申请日：2024-05-16
申请人： 深圳华大生命科学研究院
发明人： 蔡志明
IPC分类号： C12N5/071 , C12N5/0775
摘要： 本发明公开了一种胰岛细胞体外活性维持方法，涉及生物细胞技术领域。本发明，包括以下步骤：步骤一：细胞的准备，选择要共培养的胰岛细胞和其他辅助细胞；步骤二：将胰岛细胞和其他辅助细胞分别接种到无菌的培养皿或培养板中，确保细胞分布的均匀性；步骤三：将胰岛细胞和其他辅助细胞放置在同一个培养皿或培养板中，确保它们之间有适当的接触或间隔。本发明细胞共培养方法通过将胰岛细胞与其他类型的细胞共同培养，模拟体内的微环境，为胰岛细胞提供所需的营养和支持，可以将胰岛细胞与睾丸支持细胞、骨髓间充质干细胞或内皮细胞等共同培养，这些细胞能够分泌生长因子和细胞因子等，促进胰岛细胞的生长和分化。
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公开(公告)号：CN118726443A
公开(公告)日：2024-10-01
申请号：CN202310292523.7
申请日：2023-03-20
申请人： 深圳华大生命科学研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC分类号： C12N15/82 , C07K14/415 , C12N15/29 , A01H6/20 , A01H5/00
摘要： 本发明提出了一种ARR5蛋白或ARR5基因在调控植物或植物组织从头再生中的用途。在本发明中，通过控制ARR5蛋白或ARR5基因在植物中的表达，可有效调控植物组织从头再生。因此，调控ARR5蛋白及其编码基因等调控因子来提高植物的再生效率，可为再生效率低的物种的遗传转化提供了新的解决途径；并且，ARR5基因可作为植物再生进程中的重要分子机制，为在植物基因组合成和植物定制化改造的研究和应用领域提供了基础。
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公开(公告)号：CN118703457A
公开(公告)日：2024-09-27
申请号：CN202410973291.6
申请日：2021-04-01
申请人： 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： C12N9/02 , C12N15/53 , C12N15/70 , C12N15/85 , C12N1/21 , C12N5/10 , C12Q1/26 , C12Q1/66 , C12R1/19
摘要： 本发明公开了一种刺虾荧光素酶Nluc的突变体及其应用。所述突变体与如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列相比在第19位、第20位、第27位以及第28位中的一位或多位发生突变。本发明提供的新型刺虾荧光素酶Nluc提升了现有的刺虾荧光素酶发光亮度，且仪器不能检测到其催化高斯荧光素酶Gluc底物腔肠素的发光，其解决了现有的刺虾荧光素酶Nluc底物特异性宽泛的问题，有利于将来在生物监测等领域Nluc与Gluc两种荧光素酶的联合使用。
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公开(公告)号：CN118629496A
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202410757021.1
申请日：2024-06-12
申请人： 首都医科大学附属北京天坛医院 , 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： G16B20/30 , G16B40/00 , G06F18/23213 , G06F18/2135
摘要： 本发明公开一种髓母细胞瘤患者分子分型方法、设备、计算机可读存储介质及产品，涉及髓母细胞瘤分型领域，方法包括获取全基因组测序数据；全基因组测序数据包括：正常小脑组织全基因组测序数据和髓母细胞瘤患者肿瘤组织的全基因组测序数据；对全基因组测序数据的全基因组胞嘧啶报告文件进行差异甲基化区域DMR分析；对DMR分析结果进行筛选、主成分分析以及t‑SNE分析；对t‑SNE结果矩阵采用kmeans聚类方法进行聚类；根据聚类结果，采用拷贝数变异CNV进行注释，得到髓母细胞瘤患者的分子分型结果。本发明能够对髓母细胞瘤患者进行精准分型。
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公开(公告)号：CN118562712A
公开(公告)日：2024-08-30
申请号：CN202410603328.6
申请日：2024-05-15
申请人： 深圳华大生命科学研究院
发明人： 蔡志明
IPC分类号： C12N5/071
摘要： 本发明公开了一种胰岛细胞体外增殖方法，涉及细胞培养技术领域。本发明包括如下步骤：准备培养基和生长因子：选择合适的培养基并向培养基中添加生长因子；准备胰岛细胞样本：获取胰岛细胞并对胰岛细胞进行计数；培养胰岛细胞：向培养基中接种胰岛细胞，进行定期观察；细胞分裂和增殖：监测细胞增殖情况，并根据增殖情况刺激细胞分裂；细胞稳定性维持：对培养的胰岛细胞进行功能评估，并对细胞进行保护和处理；免疫调节：根据实验需要进行体外诱导免疫耐受或使用免疫抑制剂。从准备培养基和生长因子到细胞分裂和增殖环节均有明确的操作要求，降低了技术人员的操作难度，有助于确保胰岛细胞的高效增殖，并能够在体外环境中得到良好的控制。
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公开(公告)号：CN118556076A
公开(公告)日：2024-08-27
申请号：CN202280088735.7
申请日：2022-01-17
申请人： 深圳华大生命科学研究院
摘要： 本发明提出了获取特异性识别抗原的纳米抗体信息的方法，包括：从受试者的外周血淋巴细胞中富集B细胞；利用微流控液滴生成芯片，将含有抗原和信号检测试剂的溶液与单个B细胞包裹在单个液滴内；将生成的单个液滴进行孵育，以使B细胞分泌纳米抗体以及抗原与纳米抗体发生特异性结合；利用液滴分选芯片对孵育后的液滴进行分选，对收集的可检测信号进行分析，以便分选出可分泌目标纳米抗体的目标细胞，收集包含目标细胞的阳性液滴；对目标细胞进行单细胞测序，以便获取目标纳米抗体信息。
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