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公开(公告)号：CN218811749U
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202222424150.8
申请日：2022-09-14
申请人： 无锡泛生子生物科技有限公司
发明人： 王思振
摘要： 本实用新型公开了一种检测肿瘤突变负荷及遗传特征的预测模型设备，属于肿瘤检测设备技术领域，包括检测柜和冷藏箱，所述检测柜内部底端设置有所述冷藏箱，所述冷藏箱内安装有储物屉，所述检测柜一侧壁上设置有制冷机，所述制冷机上连接有导气管；本实用新型通过设计一个由冷藏箱、储物屉、制冷机、导气管以及温度探头组成的临时储存冷藏机构，在检测过程中，冷藏箱可将需要待检测的肿瘤组织进行临时储存，同时制冷机通过导气管对其进行冷藏，并且温度探头可实时检测冷藏的温度，进而保证处于最佳温度，可使工作人员随拿随测，保证装置的检测效率，无需工作人员来回跑动，减小工作人员工作强度，提高装置实用性。
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公开(公告)号：CN209822284U
公开(公告)日：2019-12-20
申请号：CN201920042460.9
申请日：2019-01-10
申请人： 南昌大学
IPC分类号： G16B30/00
摘要： 本实用新型公开一种智能采样的少分子数遗传序列检测装置，属于遗传信息载体脱氧核糖核酸检测领域，一种智能采样的少分子数遗传序列检测装置，包括微晶颗粒双层结构模块、遗传信息载体脱氧核糖核酸分子动力模块、单电子读出模块、系统响应矩阵模块、以及遗传信息载体脱氧核糖核酸序列估计模块。本实用新型的智能采样的少分子数遗传序列检测装置具有更好的应用适应性和输入灵敏度、降低系统成本，并且具有良好的模块化特征。(ESM)同样的发明创造已同日申请发明专利
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公开(公告)号：CN119091961A
公开(公告)日：2024-12-06
申请号：CN202411012439.6
申请日：2024-07-26
申请人： 温氏食品集团股份有限公司 , 广州明领基因科技有限公司
摘要： 本申请公开了一种低深度全基因组测序数据的基因型填充计算方法，通过获取待填充的二倍体低深度测序样本；根据预设的远祖单倍体数目和栅格数目，采用隐马尔可夫模型的前向后向算法，建立隐马尔可夫模型；根据所述隐马尔可夫模型，对所述待填充的测序样本进行填充，即推测待填充样本中缺失位点处的基因型。本申请实施例中对二倍体低深度群体基因型填充算法中的马尔科夫链前向后向算法进行优化，从而对待填充的测序基因序列进行快速准确的填充，以减少运算量及运行内存空间需求。
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公开(公告)号：CN119082278A
公开(公告)日：2024-12-06
申请号：CN202411095524.3
申请日：2024-08-09
申请人： 赛福解码(北京)基因科技有限公司
摘要： 本发明涉及分子生物学与基因检测技术领域，具体涉及病毒整合位点的检测方法、装置、存储介质和电子设备。本发明提供了病毒整合位点的检测方法，针对所有慢病毒，逆转录病毒和腺相关病毒载体整合边界序列批量设计探针后，可以用于上述所有载体类型的整合位点鉴定，可以同时对多个样本进行整合位点的捕获和鉴定，从而可以明显减少实验成本和周期，提升检测样本通量和准确性。
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公开(公告)号：CN114267410B
公开(公告)日：2024-12-06
申请号：CN202210125429.8
申请日：2022-02-10
申请人： 阅尔基因技术(苏州)有限公司 , 上海阅尔基因技术有限公司
IPC分类号： G16B20/50 , G16B30/00 , C12Q1/6869 , C12Q1/6886
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公开(公告)号：CN119068997A
公开(公告)日：2024-12-03
申请号：CN202411079363.9
申请日：2024-08-07
申请人： 中科育成(天津)科技发展有限公司
IPC分类号： G16B40/00 , G16B30/00 , G06F18/25 , G06F18/213 , G06F18/214 , G06F18/10 , G06N3/045 , G06N3/0464 , G06N3/0442 , G06N3/084 , G06N3/096
摘要： 本发明提供了一种融合多肽理化性质、序列特征及词向量嵌入的多肽免疫活性预测和生成方法，属于生物信息学领域。本发明考虑了多肽在不同方面的可利用的特征，将多肽的理化信息、词向量嵌入信息以及多肽序列特征融合在一起，增加了多肽特征提取的有效性。而且本发明利用ResNet网络模型对多肽序列及词向量嵌入和理化性质特征建模，有效地学习了多肽的多方面特征，采用多特征权重特征融合的方式得到预测结果，因此预测和生成模型都具较好的效果。本发明使用不同的策略获得多肽的特征表示，并分别进行特征提取，包含了多肽序列信息和理化性质，序列中局部关键信息和整体依赖关系，更好地提高了多肽免疫活性预测的准确率以及生成具有免疫活性的多肽。
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公开(公告)号：CN118687953B
公开(公告)日：2024-12-03
申请号：CN202411147069.7
申请日：2024-08-20
申请人： 杭州广科安德生物科技有限公司
IPC分类号： G01N1/28 , G01N33/68 , G16H50/20 , G16H50/30 , G16H50/70 , G16B30/00 , G16B40/00 , G16B50/30
摘要： 本发明提供一种用于进展期腺瘤检测的生物标志物及其应用，利用蛋白组学的方法，分析结直肠癌肿瘤进程（炎症性疾病‑良性息肉‑进展期腺瘤‑结直肠癌）中不同时期的患者以及健康对照人群血液中丰度水平显著差异的蛋白，筛选出多个可用于进展期腺瘤风险预测的蛋白标志物。一方面采用二分类算法，基于随机森林构建模型，在进展期腺瘤与健康对照的区分中展现出良好性能，AUC值达0.807，具有较高诊断价值；进一步采用六分类算法，通过梯度提升构建模型，能有效区分进展期腺瘤、早期结直肠癌、良性息肉、炎症性肠病、其他癌症和健康人群，模型准确性为0.78，一致性为0.729，对进展期腺瘤的诊断灵敏度为73.4%，特异性为94.7%；为进展期腺瘤诊断提供新途径。
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公开(公告)号：CN117831620B
公开(公告)日：2024-12-03
申请号：CN202311866237.3
申请日：2023-12-30
申请人： 北京诺禾致源科技股份有限公司
摘要： 本发明提供了一种基因融合位点的检测方法和电子装置。该检测方法包括：a)比对样本测序数据与参考基因组，获得预测基因融合位点；b)提取比对文件中的信息，获得软剪切序列集；c)根据预测基因融合位点的信息对软剪切序列集中的软剪切序列进行聚类，分别获得对应的软剪切序列集；d)根据第一和第二预测基因融合位点分别获取对应的基因融合位点参考基因组序列；e)将不同的软剪切序列集与其来源不同的参考基因组序列进行比对，过滤假阳性基因融合位点，获得基因融合位点。能够解决现有技术中对于基因融合位点的检测结果中假阳性率高的问题，适用于基因融合位点的检测领域。
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公开(公告)号：CN119046711A
公开(公告)日：2024-11-29
申请号：CN202411095961.5
申请日：2024-08-12
申请人： 山东大学
IPC分类号： G06F18/232 , G16B30/00
摘要： 本发明属于生物信息技术领域，具体涉及一种对转录组长readsRNA‑seq数据进行高效聚类的方法。所述方法包括S1:将需要聚类的所有reads进行预筛选，生成伪参考序列集合，所述伪参考序列集合中的每个伪参考序列对应一个单独的基因序列；S2:将测序reads与所述伪参考序列进行比对，根据比对结果，将来自相同基因的测序reads聚为一类，得到测序reads的名与类。本发明提供的方法避免了两两比对，节省了大量的计算资源，提高计算效率，同时还能够得到较为精确的最终结果。本发明提供的方法能够充分发挥长度长测序的优势，使三代转录组测序的大规模应用成为可能。
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