本发明公开了一种立体巴士路段道路交通组织设计及交叉口道路交通组织设计系统；其立体巴士路段道路交通组织设计系统包括立体巴士专用轨道、中央隔离带、限高龙门架、可升降分隔栏、立体巴士下方小汽车车道、路侧车道、立体巴士检测装置、汇入车道、车道信号灯；立体巴士交叉口道路交通组织设计系统包括立体巴士交叉口进口道渠化区域、可升降分隔栏、预信号灯、主信号灯、停靠站、限高龙门架和交叉口出口道区域。本发明在尽量减少对于现有道路设计的改变的基础上，与单独设立公交专用道相比节省了道路空间，同时还利用道路上方空间开行立体巴士，结合站台进行交叉口道路交通组织设计，提高了公共交通的运营服务水平。