本发明公开了基于境内外数据中心实现跨境数据同步的方法，包括以下步骤：在本地服务器设置本地服务器数据库；在目标服务器设置目标服务器数据库；在境内选取服务器作为中转服务器，并在中转服务器设置中转服务器数据库；所述本地服务器设置于境内；所述目标服务器设置于境外；当本地服务器数据库数据发生变化时，生成数据变化量文件，并在数据变化量文件内设置标记；所述标记采用本地服务器时间。本发明基于境内外数据中心实现跨境数据同步的方法，通过设置上述步骤，实现了在境内外通讯发送中断并恢复后，境外数据可以快速的实现同步，从而降低通关风险和通关时间，减少包裹积压。