本发明属于液压冲击器能耗分析技术领域，公开了一种高频液压冲击活塞副的能耗分析方法及系统，以高频液压冲击器冲击活塞副为分析对象，采用具有圆形微织构的冲击活塞结构，通过解析冲击活塞副能耗产生的物理力学机制，引入活塞副能耗评价指标，建立冲击活塞副的能耗分析模型；结合Reynolds方程进行数值求解，获得微织构参数对活塞副能耗的关系。本发明的冲击活塞副能耗占总损失能量的29.77％，而采用圆形微织构表面活塞副的能耗相比较于未采用时明显降低。微织构不同面积率能降低能耗且最优面积率在0.64～0.70，不同的微织构深度比也能降低活塞副能耗且最优深度比在1～1.1。