本发明公开了一种激光微织构加工方法，包括如下步骤：建立机床三维运动模型，将机床直线轴和旋转轴的实时位置转换为加工机床坐标；移动待加工工件至加工位置，将其设为加工原点，并更新机床坐标系；读取加工位置参数，计算获得激光加工位置坐标；根据坐标计算生成加工示意图，对加工效果进行模拟仿真；根据坐标生成G代码，用于加工中运动平台的路径规划；控制器根据G代码控制加工机床运动，将已获得的激光加工坐标与加工过程中实时读取的加工机床坐标相比较，当两者一致时，则认为工件运动到指定位置，从而控制激光器出光，进行激光微织构加工。本发明能够实现高精度加工，提高激光器与机床运动的控制同步性，有效改善激光微织构形貌观测难度。