本发明涉及胶囊生产技术领域。一种胶囊壳药分离机构，包括机架、托环、壳药分离筛和转动连接在机架上的竖转轴，竖转轴上设有胶囊排队定位柱，所述胶囊排队定位柱设有若干沿胶囊排队定位柱周向分布轴向延伸的供胶囊以竖置方式进行排队的胶囊储存通孔，胶囊排队定位柱的周面上若干沿胶囊排队定位柱周向延伸轴向分布的环形进刀槽，托环同机架连接在一起且套设在所述竖转轴上并阻挡在同托环对齐的胶囊储存通孔的下端，所述托环设有胶囊下料缺口，所述机架上还设有若干一一对应地穿设在进刀槽内将胶囊储存通孔内的胶囊割断的刀片。本发明提供一种胶囊壳药分离机构，解决了通过人工剪胶囊和筛来进行药壳分离费力的问题。