本发明公开了一种特种装备关重件故障预测方法及其故障预测系统，包括以下步骤：首先通过环境模拟设备模拟复杂的工作环境，再利用信息收集装置进行复杂环境下多参数并行测试；接着要对采集到的原始数据进行预处理，再针对复杂环境下原始的故障特征数据构建原始的故障特征全集，然后计算原始特征集中所有特征量的互信息，分别找到满足规则下的特征，选取最优加权特征子集，最后将得到的有用信息与历史数据进行比对融合，交由回归模型进行处理，得到包含故障特征的诊断信号，供决策系统调度；本发明针对复杂环境下关重件状态监控未知特性和多元性，将关重件故障问题的产生过程利用数据进行分析、建模和管理，从解决可见的问题到避免可见的问题。