本发明提出了一种鉴定红螯螯虾遗传性别的SNP标记及其所用引物对和应用。本发明SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，SNP标记的核苷酸序列中第229bp碱基位置表现为TG杂合的是雌性个体，SNP标记的核苷酸序列中第229bp碱基位置表现为TT纯合的是雄性个体；本发明还给出了上述SNP标记所用的引物对，并给出了上述SNP标记在鉴定红螯螯虾遗传性别中的应用。本发明的SNP标记是与遗传性别相关的SNP标记，通过SNP标记可以成功鉴定红螯螯虾的遗传性别，SNP标记在鉴定雄性红螯螯虾时的成功率超过90％，在鉴定雌性红螯螯虾时的成功率超过80％，从而指导红螯螯虾的育种和养殖，提高经济收益。