本申请涉及一种燃料电池的保护方法、装置、电子设备及存储介质，其中，燃料电池的保护方法包括：在第N次采样时，获取燃料电池在当前电流条件下的输出电压与输出功率；其中，N为正整数；根据燃料电池对应的标准输出模型对输出电压与输出功率进行处理，确定燃料电池在当前电流条件下的电压偏差值与功率偏差值；根据电压偏差值与功率偏差值确定燃料电池的工作状态，工作状态包括燃料不足状态；在将燃料电池的工作状态确定为燃料不足状态的情况下，控制燃料电池进入保护停机模式。通过上述方法，在不添加氢气压力传感器的情况下，及时识别燃料电池供氢压力不足的问题，为燃料电池提供可靠的保护。