本发明公开了一种基于FBG应变传感器的分布式机翼孔径天线主梁结构动态形变在线测量方法及系统，该方法包括：根据构建的九自由度位移场确定机翼主梁表面任意一点应变，得到本构关系；根据本构关系确定插值形函数阶次，建立机翼主梁逆单元位移场插值函数；基于FBG应变传感器检测的测量应变确定机翼主梁中性轴应变函数，得到机翼主梁任意一点的测量中性轴应变函数；然后构建机翼主梁形变在线评估模型，通过机翼主梁形变在线评估模型，得到机翼主梁未知的节点自由度；本发明通过考虑机翼主梁的面内畸变和面外翘曲变形对机载平台天线单元空间位姿的影响，保障了测量结果更加准确，实现基于FBG应变在线测量的机翼主梁的九自由度在线感知。