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公开(公告)号:BR112017016935A2
公开(公告)日:2018-04-03
申请号:BR112017016935
申请日:2016-02-05
Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP
Inventor: JACOB FREUDENTHAL , JEFFREY MARKS , YONG CHU
Abstract: é descrito um método implantado por computador (500) para calibrar um corante fluorescente. o método (500) compreende imagear um suporte de amostra, carregado em um instrumento, em mais de um canal. o suporte de amostra compreende uma pluralidade de locais de reação e mais de um tipo de corante, sendo que cada corante ocupa mais de um local de reação. o método compreende adicionalmente identificar um canal de pico para cada corante no suporte de amostra (508), normalizar cada canal para o canal de pico para cada corante (510) e produzir uma matriz de corante (518), que compreende um conjunto de valores de referência de corante.
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公开(公告)号:BR112015010437A2
公开(公告)日:2017-07-11
申请号:BR112015010437
申请日:2013-11-07
Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP
Inventor: DAVID HOARD , HARRISON LEONG , JEFFREY MARKS , KEVIN BODNER , NIVEDITA SUMI MAJUMDAR , RYAN TALBOT , THEODORE STRAUB
IPC: G16B45/00
Abstract: resumo ferramentas de visualização para dados de pcr digital é apresentado um método para gerar uma visualização de dados. o método inclui a exibição de uma representação de uma parte dos dados detectados de um substrato para um usuário. o método inclui ainda a geração de um valor de qualida-de de dados para a parte dos dados detectados e a exibição, juntamente com a re-presentação da parte dos dados detectados, de uma indicação do valor de qualidade de dados para a parte de dados detectados. o método inclui ainda a seleção, pelo usuário, de um limite de valor de qualidade e a exibição de uma indicação ajustada do valor de qualidade de dados para uma parte dos dados detectados que atendem ao limite do valor de qualidade.
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公开(公告)号:BR112017016814B1
公开(公告)日:2021-04-20
申请号:BR112017016814
申请日:2016-02-05
Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP
Inventor: DAVID WOO , JACOB FREUDENTHAL , JEFFREY MARKS , THOMAS WESSEL , YONG CHU
Abstract: em uma modalidade exemplificadora, é fornecido um método para calibração de um instrumento. o instrumento inclui um sistema óptico capaz de imagear a emissão de fluorescência a partir de uma pluralidade de locais de reação. o método inclui a realização de uma calibração da região de interesse (roi) para determinar as posições do local de reação em uma imagem. o método inclui ainda a realização de uma calibração com corante puro para determinar a contribuição de um corante fluorescente utilizado em cada local de reação comparando um espectro bruto do corante fluorescente com um dado de calibração do espectro puro do corante fluorescente. o método inclui ainda a realização de uma calibração de normalização de instrumento para determinar um fator de normalização de filtro. o método inclui a realização de uma validação de rnase p para validar se o instrumento é capaz de distinguir entre duas quantidades diferentes de amostra.
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公开(公告)号:BR112017016906A2
公开(公告)日:2018-03-27
申请号:BR112017016906
申请日:2016-02-05
Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP
Inventor: CHIN YONG KOO , DAVID WOO , HON SIU SHIN , HUEI STEVEN YEO , JACOB FREUDENTHAL , JEFFREY MARKS , KOK SIONG TEO , KUAN MOON BOO , LIAN SENG LOH , LIK SENG LAU , MAURO AGUANNO , MICHAEL UY , MINGSONG CHEN , SOO YONG LAU , THOMAS WESSEL , TIONG HAN TOH , WAY XUANG LEE , WEI FUH TEO , XIN MATHERS , YONG CHU , ZENG WEI CHU , ZEQI TAN
Abstract: um sistema de análise biológica é fornecido. o sistema compreende uma unidade de bloco de amostra. a unidade de bloco de amostra compreende um bloco de amostra configurado para acomodar um suporte de amostra, o suporte de amos-tra configurado para receber uma pluralidade de amostras. o sistema também com-preende um sistema de controle configurado para circular a pluralidade de amostras através de uma série de temperaturas. o sistema compreende ainda uma bandeja automatizada compreendendo uma unidade deslizante, a bandeja configurada para deslizar reversivelmente a unidade de bloco de amostra a partir de uma posição fe-chada para uma posição aberta para permitir o acesso do usuário à pluralidade de suportes de amostra.
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公开(公告)号:BR112015005702A2
公开(公告)日:2017-07-04
申请号:BR112015005702
申请日:2013-09-13
Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP
Inventor: DANIEL WESSEL , DAVID C WOO , GORDON JANAWAY , JEFFREY MARKS , JOANNA LANKESTER , MARCIN SIKORA , NIVEDITA SUMI MAJUMDAR , SHWETA RAIZADA , THOMAS WESSEL
IPC: G06F19/24
Abstract: resumo métodos e sistemas para um projetor de experimento de pcr digital é fornecido um método implementado em computador para projetar um ex-perimente de pcr digital (dpcr). o método inclui receber de um usuário, uma sele-ção do tipo de otimização. o tipo de otimização pode ser maximizar a abrangência dinâmica, minimizando o número de substratos, incluindo locais de reação necessários para o experimento, determinar um fator de diluição, ou determinar o limite inferior de detecção, por exemplo. o método mais inclui receber do usuário, uma medida de precisão para um experimento e uma concentração mínima de um alvo em um local de reação para o experimento. o método também inclui a determinação de um conjunto de fatores de projeto de experimento de dpcr para o experimento com base no tipo de otimização. o conjunto de fatores de projeto de experimento de dpcr é exibido para o usuário.
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公开(公告)号:BR112017016935B1
公开(公告)日:2021-04-20
申请号:BR112017016935
申请日:2016-02-05
Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP
Inventor: JACOB FREUDENTHAL , JEFFREY MARKS , YONG CHU
Abstract: é descrito um método implantado por computador (500) para calibrar um corante fluorescente. o método (500) compreende imagear um suporte de amostra, carregado em um instrumento, em mais de um canal. o suporte de amostra compreende uma pluralidade de locais de reação e mais de um tipo de corante, sendo que cada corante ocupa mais de um local de reação. o método compreende adicionalmente identificar um canal de pico para cada corante no suporte de amostra (508), normalizar cada canal para o canal de pico para cada corante (510) e produzir uma matriz de corante (518), que compreende um conjunto de valores de referência de corante.
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公开(公告)号:BR112017016792A2
公开(公告)日:2018-04-17
申请号:BR112017016792
申请日:2016-02-05
Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP
Inventor: JEFFREY MARKS
IPC: G01N21/27
Abstract: os presentes ensinamentos se referem a um método e sistema para normalizar espectros através de múltiplos instrumentos. o método (800) compreende pelo menos um instrumento de referência e um instrumento de teste. cada instrumento compreende pelo menos um filtro de excitação e pelo menos um filtro de emissão dispostos em pares. cada instrumento compreende adicionalmente uma placa de corante puro que compreende uma pluralidade de poços. cada poço contém uma pluralidade de corantes, sendo que cada corante compreende um componente fluorescente. espectros fluorescentes são obtidos a partir de cada instrumento (805, 820) para cada corante através de múltiplas combinações de filtro para contribuir para uma matriz de corante puro mref para o instrumento de referência e matriz de corante puro m para o instrumento de teste. os espectros de corante puro podem ser, então, multiplicados por fatores de correção (840) para cada par de filtros para obter espectros de corante puro corrigidos, depois podem ser normalizados (845) e os dados de multicomponente podem ser extraídos (850).
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公开(公告)号:BR112017016814A2
公开(公告)日:2018-04-03
申请号:BR112017016814
申请日:2016-02-05
Applicant: LIFE TECHNOLOGIES CORP
Inventor: DAVID WOO , JACOB FREUDENTHAL , JEFFREY MARKS , THOMAS WESSEL , YONG CHU
Abstract: em uma modalidade exemplificadora, é fornecido um método para calibração de um instrumento. o instrumento inclui um sistema óptico capaz de imagear a emissão de fluorescência a partir de uma pluralidade de locais de reação. o método inclui a realização de uma calibração da região de interesse (roi) para determinar as posições do local de reação em uma imagem. o método inclui ainda a realização de uma calibração com corante puro para determinar a contribuição de um corante fluorescente utilizado em cada local de reação comparando um espectro bruto do corante fluorescente com um dado de calibração do espectro puro do corante fluorescente. o método inclui ainda a realização de uma calibração de normalização de instrumento para determinar um fator de normalização de filtro. o método inclui a realização de uma validação de rnase p para validar se o instrumento é capaz de distinguir entre duas quantidades diferentes de amostra.
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