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公开(公告)号：KR101171384B1
公开(公告)日：2012-08-10
申请号：KR1020060054869
申请日：2006-06-19
Applicant: 한국과학기술원
Abstract: 본 발명은 유전자의 단계적 발현 네트워크 및 이를 이용한 세포 표식방법에 관한 것으로, 구체적으로 전사조절인자나 유전자에 상보적인 RNA를 이용하여 유전자가 순차적으로 발현되게 하는 유전자의 단계적 발현 네트워크 및 이를 이용하여 형광 단백질을 발현시켜 시간에 따라 발현되는 단백질의 종류를 달리함으로써 세포를 표식하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 발현 네트워크는 유전자 발현의 조절을 시간에 따라 가능케 하여 특정 시간에 단백질이 발현되게 하거나, 시간차를 두고 서로 다른 단백질이 발현되게 함으로써 유전자 치료나, 생물 공학 분야에 이용될 수 있고 세포 표식방법은 세포칩 및 제반기기 없이 대량의 세포 실험(high-throughput cell-based assay)을 수행하는데 이용될 수 있다.
유전자 네트워크, 세포 표식, 순차적 단백질 발현, 유전자 치료, 생물공학, 세포칩-
公开(公告)号：KR100984644B1
公开(公告)日：2010-10-01
申请号：KR1020080006138
申请日：2008-01-21
Applicant: 한국과학기술원
Abstract: 본 발명은 세포 내 목적 단백질의 유도 진화가 가능한 방법에 관한 것으로, 구체적으로 파지 복제기점 및 목적 단백질을 암호화하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 운반체 플라스미드 및 상기 목적 단백질에 의해 작동이 조절되는 프로모터 및 리포터 유전자를 포함하는 선택 플라스미드가 도입된 대장균에 돌연변이 유발물질을 처리하여 목적 단백질의 유전자 서열에 돌연변이를 유도한 후, 하이브리드 헬퍼 파지를 감염시켜 돌연변이 운반체 파지를 수득하고 이를 선택 플라스미드로 형질전환된 대장균에 다시 형질 전환시킨 후 유도 진화된 목적 단백질을 생산하는 형질전환체를 선별하고, 다시 돌연변이 유발물질 처리 후, 배양 및 선별 과정을 반복하는 것을 특징으로 하는 재조합 대장균 세포 내 목적 단백질의 유도 진화 시스템에 관한 것이다. 본 발명의 시스템은 상기 형질전환된 대장균에 반복적으로 돌연변이 유발물질 처리, 배양 및 선별에 의해 신속하고 간단하게 목적 단백질의 유도 진화를 수행할 수 있다.
목적 단백질 유도 진화, 자동화, 헬퍼 파지, 돌연변이, 선별-
公开(公告)号：KR1020100102321A
公开(公告)日：2010-09-24
申请号：KR1020090020639
申请日：2009-03-11
Applicant: 한국과학기술원
CPC classification number: G06F19/28 , C12Q1/6869
Abstract: PURPOSE: A system for making customized gene sequence based on gene translation efficiency is provided to quantitatively predict expression level. CONSTITUTION: A system for making customized gene sequence based on gene translation efficiency comprises: an information input unit(110) for receiving gene sequence and information; a gene sequence generator(120) for generating gene sequence based on efficiency level at translation initiation stage; as reasoning unit(130) for efficiency at translation initiation stage; an information output unit(140) which outputs efficiency at translation initiation stage; and a verification unit(150) for checking real expression level of the gene sequence through the information output unit.
Abstract translation: 目的：提供基于基因翻译效率制作定制基因序列的系统，以定量预测表达水平。 构成：基于基因翻译效率制作定制基因序列的系统包括：用于接收基因序列和信息的信息输入单元（110） 用于基于翻译起始阶段的效率水平产生基因序列的基因序列发生器（120）; 作为推理单元（130），用于翻译起始阶段的效率; 在翻译起始阶段输出效率的信息输出单元（140） 以及用于通过信息输出单元检查基因序列的实际表达水平的验证单元（150）。
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公开(公告)号：KR1020090080266A
公开(公告)日：2009-07-24
申请号：KR1020080006138
申请日：2008-01-21
Applicant: 한국과학기술원
Abstract: A method for directed evolution of target protein in a cell is provided to perform treatment, culture and screening of repetitive mutant-inducing agent. A hybrid helper phage has a fusion genome which comprises: a genome DNA of the first phage of which origin of replication is removed; and a genome DNA of the second phage having an origin of replication which is different from the first phage. A directed evolution method of target protein in a cell comprises: a step of preparing carrier plasmid which contains the origin of replication and polynucleotide encoding target protein; a step of selection plasmid containing an antibiotics-resistance gene and promoter; a step of preparing a first transformant and a second transformant; a step of infecting a hybrid helper phage into the second transformant; a step of producing mutant carrier phage; a step of collecting the mutant carrier phage; a step of preparing a third transformant; a step of infecting the mutant carrier phage in the third transformant; a step of culturing the third transformant; and a step of screening single colony.
Abstract translation: 提供了一种靶细胞定向进化的方法，用于进行重复突变诱导剂的治疗，培养和筛选。 混合辅助噬菌体具有融合基因组，其包含：去除其起始点的第一噬菌体的基因组DNA; 和具有不同于第一噬菌体的复制起点的第二噬菌体的基因组DNA。 靶蛋白在细胞中的定向进化方法包括：制备含有复制起点的载体质粒和编码靶蛋白的多核苷酸的步骤; 含有抗生素抗性基因和启动子的选择质粒的步骤; 制备第一转化体和第二转化体的步骤; 将混合辅助噬菌体感染入第二转化体的步骤; 生产突变体载体噬菌体的步骤; 收集突变载体噬菌体的步骤; 制备第三转化体的步骤; 在第三转化体中感染突变载体噬菌体的步骤; 培养第三转化子的步骤; 并筛选单个殖民地的步骤。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：KR101842681B1
公开(公告)日：2018-03-28
申请号：KR1020150086904
申请日：2015-06-18
Applicant: 재단법인 전통천연물기반 유전자동의보감 사업단 , 한국과학기술원
IPC: G06F19/26
Abstract: 본발명은대규모생물학적네트워크를자동적으로시각화하는방법및 장치에관한것이다. 구체적으로는복수개의노드및 각노드를연결하는복수개의에지를포함하는생물학적네트워크의시각화방법및 장치에있어서, 사용자가입력한에지목록정보에기초하여상기노드의연결상태를파악하는단계(S100), 사용자가입력한노드목록정보에기초하여상기노드의생물학적특성을파악하는단계(S200), 상기노드의생물학적특성에기초하여상기노드간의생물학적유사성을계산하는단계(S300), 상기노드의연결상태및 상기노드간의생물학적유사성에기초하여상기노드의좌표정보를산출하는단계(S400) 및상기좌표정보에기초하여생물학적네트워크를시각화하는단계(S500)를포함한다.
Abstract translation: 本发明涉及用于自动显现大规模生物网络的方法和设备。 的特别是在多个节点和多个生物网络的可视化的方法和装置的包括是否连接每个节点，边缘列表的基础上，由用户输入的信息了解的节点的连接状态（S100）euroneun的步骤中， （S200），基于用户输入的节点列表信息来识别节点的生物学特性，基于节点的生物学特性计算（S300）节点之间的生物学相似性（S300） 基于节点之间的生物相似性计算节点的坐标信息（S400），并且基于坐标信息使生物网络可视化（S500）。
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公开(公告)号：KR1020170141317A
公开(公告)日：2017-12-26
申请号：KR1020160073969
申请日：2016-06-14
Applicant: 재단법인 전통천연물기반 유전자동의보감 사업단 , 한국과학기술원
Abstract: 본발명의일 실시예에따른신약재창출방법은복수개의유전자정보를포함하는생물학적네트워크를이용한신약재창출방법에관한것으로써, 상기생물학적네트워크에검증하고자하는약물의정보를입력하는단계; 상기생물학적네트워크상에서상기약물의작용유전자및 목표질병과관련된질병유전자사이의최단경로를추출하는단계; 공개된유전체데이터를이용하여상기작용유전자의질병에서의변화상태를측정하는단계; 상기작용유전자, 상기최단경로상에배열된적어도하나의중간유전자및 상기질병유전자의상기약물의전달에따른활성/억제여부를파악하는단계; 및상기최단경로및 상기활성/억제여부에기초하여상기약물및 상기목표질병유전자와의상관관계를수치화하여스코어를산출하는단계;를포함한다.
Abstract translation: 根据本发明实施例的生成新药物的方法涉及使用包括多个基因信息的生物网络生成药物的方法，所述方法包括：输入要在生物网络中验证的药物的信息; 在生物网络上提取药物的作用基因和与目标疾病相关的疾病基因之间的最短路径; 使用公开的基因组数据测量疾病中功能基因的变化状态; 确定活性基因，至少一个排列在最短路径上的中间基因，以及疾病基因是否通过转移药物而被激活/抑制; 并且通过基于最短路径和活性/抑制来量化药物与目标疾病基因之间的相关性来计算分数。
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公开(公告)号：KR101783689B1
公开(公告)日：2017-10-10
申请号：KR1020150086898
申请日：2015-06-18
Applicant: 재단법인 전통천연물기반 유전자동의보감 사업단 , 한국과학기술원
IPC: G06F19/00
Abstract: 본발명은질병및 약물특이적임상변수의상보성을활용한신약재창출기법및 장치에관한것이다. 구체적으로제 1저장부(100)에임상학적변수들의상태를나타내는질병특이적임상학적특징벡터(10)가저장되는단계(S100); 제 2저장부(200)에약물투여시나타나는임상학적변수들의상태를나타내는약물특이적임상학적효과벡터(20)가저장되는단계(S200); 비교부(300)가상기질병특이적임상학적특징벡터(10)와약물특이적임상학적효과벡터(20)의임상학적변수가가지는방향성을비교하는단계(S300); 비교부(300)의결과에기초하여상기약물이상기질병에대해약효가있는지여부를판단하는단계(S400);를포함한다.
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公开(公告)号：KR101757047B1
公开(公告)日：2017-07-12
申请号：KR1020150086897
申请日：2015-06-18
Applicant: 재단법인 전통천연물기반 유전자동의보감 사업단 , 한국과학기술원
Abstract: 본발명에따른단어공기협력병렬검색방법은, 대상텍스트파일을메인서버의분석파일정보에등록하는 (a)단계, 검색하고자하는단어쌍 리스트의각 단어쌍을상기메인서버에미리작업된단어쌍에서검색하는 (b)단계, 상기 (b)단계에서검색된단어쌍을사용자단말기의결과데이터베이스에저장하는 (c)단계, 상기 (b)단계에서검색되지않은단어쌍을개별적으로상기메인서버에서확인하고, 확인결과에따른작업을수행하는 (d)단계및 상기 (d)단계에서검색된단어쌍을사용자단말기의결과데이터베이스에저장하고, 상기메인서버의미리작업된단어쌍으로저장하는 (e)단계를포함하며, 상기 (d)단계는복수의사용자단말기간의작업분산에의해이루어진다.
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公开(公告)号：KR101741800B1
公开(公告)日：2017-05-30
申请号：KR1020150094351
申请日：2015-07-01
Applicant: 재단법인 전통천연물기반 유전자동의보감 사업단 , 한국과학기술원
IPC: G06F19/00
Abstract: 본발명에따른천연물효능분석을위한네트워크분석방법은, 약재정보를수집하여데이터풀을구축하는 (a)단계, 상기데이터풀을구성하는약재정보를기반으로복수의레이어를형성하여다중네트워크를구성하는 (b)단계, 상기다중네트워크중 포함관계를가지는이분네트워크를선택하는 (c)단계, 상기이분네트워크중 하위레이어를구성하는하위노드에가중치를부여하는 (d)단계, 서로관련된복수의하위노드로구성된복수의하위노드군에대해, 개별하위노드의가중치를이용하여하위노드쌍에가중치를부여하는 (e)단계및 하위노드쌍의가중치합이설정기준이상인하위노드군을추출하는 (f)단계를포함한다.
Abstract translation: 网络分析的方法，以形成多个基于构成收集药信息来构建数据池的步骤（a）的药物信息层，所述数据池是根据本发明配置的天然产品功效分析多个网络 （C）选择多个网络中具有覆盖关系的多个子网中的一个子网，（d）为构成网络下层的子节点分配权重， 用于多个由子节点的组子节点的，使用子节点的权重的个体分配一个权重的子节点对步骤（e）和该子节点对的加权和被设置以提取下节点组或多个准则（ 它包括F）阶段。
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