一种标志基因识别的系统和方法

    公开(公告)号:CN114913921A

    公开(公告)日:2022-08-16

    申请号:CN202210491212.9

    申请日:2022-05-07

    Applicant: 厦门大学

    Inventor: 王颖 林仁豪

    Abstract: 本发明公开了一种基于聚类网络模型解释的标志基因识别系统,包括:数据提取和预处理单元,配置用于数据提取和预处理,获取基因表达矩阵原数据;聚类网络模型单元,配置用于通过聚类网络模型获得所述基因表达矩阵的低维表达向量并聚类成簇;模型解释单元,配置用于通过模型解释算法解释所述聚类网络模型,获得特征贡献度,所述特征贡献度为基因表达数据特征对所述聚类网络模型的聚类结果的影响程度;标志基因识别单元,配置用于根据所述特征贡献度,识别标志基因。该系统能够依据特征贡献度对基因表达矩阵数据的去冗余,与常规的聚类模型相比,有较强的可解释性与可信度。

    一种标志基因识别的系统和方法

    公开(公告)号:CN114913921B

    公开(公告)日:2024-07-09

    申请号:CN202210491212.9

    申请日:2022-05-07

    Applicant: 厦门大学

    Inventor: 王颖 林仁豪

    Abstract: 本发明公开了一种基于聚类网络模型解释的标志基因识别系统,包括:数据提取和预处理单元,配置用于数据提取和预处理,获取基因表达矩阵原数据;聚类网络模型单元,配置用于通过聚类网络模型获得所述基因表达矩阵的低维表达向量并聚类成簇;模型解释单元,配置用于通过模型解释算法解释所述聚类网络模型,获得特征贡献度,所述特征贡献度为基因表达数据特征对所述聚类网络模型的聚类结果的影响程度;标志基因识别单元,配置用于根据所述特征贡献度,识别标志基因。该系统能够依据特征贡献度对基因表达矩阵数据的去冗余,与常规的聚类模型相比,有较强的可解释性与可信度。

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