公开(公告)号：CN119541645A

公开(公告)日：2025-02-28

申请号：CN202510101408.6

申请日：2025-01-22

Applicant: 吉林大学

Inventor： 张艺博 ,  刘云 ,  刘富 ,  侯涛 ,  康冰 ,  段继鲁 ,  曹晓聪

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00 ,  G06F18/214 ,  G06F18/243 ,  G06N20/20

Abstract: 本发明公开了一种宏基因组质粒识别方法、系统、终端及存储介质，涉及生物信息学DNA数据挖掘领域，所述方法包括：获取目标基因组重叠群，根据基因预测工具进行编码，得到输入特征向量，基于比对工具和预先构建的比对库，进行比对，得到基因组特征；将所述输入特征向量输入到改进的Transformer模型中，输出第一分类分数；将所述基因组特征输入到随机森林模型中，得到第二分类分数；根据基于注意力机制的分类模型，分别对所述第一分类分数和所述第二分类分数进行聚合，得到第一矩阵和第二矩阵，根据所述第一矩阵和所述第二矩阵，得到质粒识别分数。本发明通过两种模型的识别，并将对应的结果进行融合，从而可以准确识别质粒。

公开(公告)号：CN119541645B

公开(公告)日：2025-05-16

申请号：CN202510101408.6

申请日：2025-01-22

Applicant: 吉林大学

Inventor： 张艺博 ,  刘云 ,  刘富 ,  侯涛 ,  康冰 ,  段继鲁 ,  曹晓聪

IPC: G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00 ,  G06F18/214 ,  G06F18/243 ,  G06N20/20

Abstract: 本发明公开了一种宏基因组质粒识别方法、系统、终端及存储介质，涉及生物信息学DNA数据挖掘领域，所述方法包括：获取目标基因组重叠群，根据基因预测工具进行编码，得到输入特征向量，基于比对工具和预先构建的比对库，进行比对，得到基因组特征；将所述输入特征向量输入到改进的Transformer模型中，输出第一分类分数；将所述基因组特征输入到随机森林模型中，得到第二分类分数；根据基于注意力机制的分类模型，分别对所述第一分类分数和所述第二分类分数进行聚合，得到第一矩阵和第二矩阵，根据所述第一矩阵和所述第二矩阵，得到质粒识别分数。本发明通过两种模型的识别，并将对应的结果进行融合，从而可以准确识别质粒。