公开(公告)号：KR1020080030142A

公开(公告)日：2008-04-04

申请号：KR1020060095827

申请日：2006-09-29

Applicant: 고려대학교 산학협력단

Inventor： 이재원 ,  김철민 ,  전명식 ,  송석헌 ,  이정복 ,  손인석 ,  박미라

IPC: G06F17/50 ,  G06F9/455

CPC classification number: G06F19/20 ,  G06F19/24

Abstract: A method of an integrated analysis of a micro-array is provided to implement a systematical statistic analysis about micro-array scanning data by sharing a database and to improve research result reliability by applying an optimized statistic analysis method according to each experiment situation. Items of a menu are outputted on a screen, wherein the items are composed of experiment design, standardization, estimation and verification, association analysis and classification(210). If the experiment design item is selected(221), design parameters are designated according to parameter input of a user(231). An ANOVA design matrix is created by using the inputted design parameters(232). If the standardization item is selected(222), slide information is inputted, and a result of the standardization is created by performing single slide standardization, single location standardization and multi slide standardization sequentially(242). The standardization result is stored as a file so as to be read during estimation, verification, association analysis and classification procedures(243). If the estimation and verification item is selected(223), the standardization result is read out(251). A gene is selected by performing the predetermined estimation and verification methods about the standardization result(252). If the association analysis item is selected(224), the standardization result is read out(261), the association analysis is performed, and the result of the association analysis is displayed as a graph(262). And if the classification item is selected, the standardization result is read out(271).

Abstract translation: 提供了一种微阵列集成分析方法，通过共享数据库实现对微阵列扫描数据的系统统计分析，并通过根据实验情况采用优化的统计分析方法，提高研究结果的可靠性。 菜单项目在屏幕上输出，其中项目由实验设计，标准化，估计和验证，关联分析和分类组成（210）。 如果选择实验设计项目（221），则根据用户的参数输入（231）指定设计参数。 使用输入的设计参数（232）创建ANOVA设计矩阵。 如果选择标准化项目（222），则输入幻灯片信息，依次执行单张幻灯片标准化，单位标准化和多幻灯片标准化，创建标准化结果（242）。 标准化结果存储为文件，以便在估计，验证，关联分析和分类过程中进行读取（243）。 如果选择了估计和验证项目（223），则读出标准化结果（251）。 通过执行关于标准化结果的预定的估计和验证方法来选择基因（252）。 如果选择关联分析项目（224），则读出标准化结果（261），执行关联分析，并将关联分析的结果显示为图（262）。 如果选择分类项目，则读出标准化结果（271）。

公开(公告)号：KR100839221B1

公开(公告)日：2008-06-19

申请号：KR1020060095827

申请日：2006-09-29

Applicant: 고려대학교 산학협력단

Inventor： 이재원 ,  김철민 ,  전명식 ,  송석헌 ,  이정복 ,  손인석 ,  박미라

IPC: G06F17/50 ,  G06F9/455

Abstract: 마이크로어레이 통합 분석 방법이 개시된다.
본 발명은 실험 설계, 표준화, 추정과 검정, 군집 분석 및 분류로 구성된 상위 메뉴의 아이템에 대하여, 상기 아이템 중 상기 실험 설계가 선택되면, 염료 교환, 기준설계 또는 루프설계 중 어느 하나의 실험 디자인을 선택하는 인터페이스와 상기 선택된 실험 디자인에 사용될 설계 파라미터를 입력하는 인터페이스를 디스플레이하고, 상기 입력된 설계 파라미터를 이용하여 상기 선택된 실험 디자인에 대한 아노바 설계 매트릭스를 생성하는 단계, 상기 아이템 중 상기 표준화가 선택되면, 입력된 슬라이드 정보를 이용한 단일 슬라이드 표준화, 단일 배치 표준화 및 다중 슬라이드 표준화를 순차적으로 수행하여 표준화 결과를 생성하는 단계, 상기 아이템 중 상기 추정과 검정이 선택되면, 상기 표준화 결과에 대해, 소정의 추정과 검정 방법을 수행하여 마이크로어레이 실험에서 유의한 유전자를 선택하는 단계, 상기 아이템 중 상기 군집 분석이 선택되면, 상기 표준화 결과를 이용하여 소정의 군집 분석을 수행하여 생성된 군집 분석 결과를 그래프로 디스플레이하는 단계 및 상기 아이템 중 상기 분류가 선택되면, 상기 표준화 결과 및 처리군 간의 변동과 처리군 내에서의 변동의 비를 이용하여 후보 유전자를 선정하고,상기 후보 유전자에 대해 소정의 분류를 수행하여 상기 설계 파라미터에 의한 관심 대상 그룹을 예측하며, 오분류율을 출력하는 단계를 포함한다.
본 발명에 의하면, 하나의 통합시스템에서 마이크로어레이 자료 분석의 전 과정을 처리함으로써, 데이터베이스를 공유하여 마이크로어레이 스캐닝 이미지 자료에 대한 체계적인 통계분석을 수행할 수 있고, 각 실험의 상황에 따른 최적의 통계분석법을 적용함으로써 부적절한 방법의 적용으로 인한 위양성 및 위음성 오류율을 최소화하고 연구결과의 신뢰성을 높일 수 있으며, 편리하고 사용자 친화적인 인터페이스를 제공하여 분석이 용이하다.