公开(公告)号：KR100666099B1

公开(公告)日：2007-01-10

申请号：KR1020040028926

申请日：2004-04-27

Applicant: 국립암센터

Inventor： 박재갑 ,  김일진 ,  강효정 ,  박재현

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2600/156

Abstract: 본 발명은 K-
ras 유전자의 돌연변이 집중코돈 부위 (hot-spot areas)에서 발생가능한 다양한 돌연변이를 검색할 수 있도록 고안된 올리고뉴클레오티드들이 고형 기판의 표면에 고정되어 있는 K-
ras 올리고뉴클레오티드 마이크로어레이, 상기 마이크로어레이의 제조방법 및 이를 이용하여 경쟁적 DNA 혼성화 (competitive DNA hybridization, CDH) 방법에 의해 K-
ras 유전자의 돌연변이를 검사하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 K-
ras 올리고뉴클레오티드 마이크로어레이는 K-
ras 유전자의 특정 돌연변이 집중코돈 부위에 대해 선택적으로 고안된 올리고뉴클레오티드를 포함하고, 이를 이용한 본 발명의 검사방법은 경쟁적 DNA 혼성화 방법을 적용하여 정확성과 효율성을 증가시킴으로써 K-
ras 유전자의 돌연변이 검색 및 K-
ras 유전자와 관련된 신호전달 체계의 연구나 암 기전 연구에 유용하게 사용될 수 있다.

公开(公告)号：KR1020040064007A

公开(公告)日：2004-07-16

申请号：KR1020030000987

申请日：2003-01-08

Applicant: 국립암센터

Inventor： 박재갑 ,  김일진 ,  강효정 ,  박재현

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2600/156

Abstract: PURPOSE: A beta-catenin oligonucleotide microchip and a method for detecting beta-catenin mutations using the same are provided, thereby improving the time, costs and accuracy for detecting beta-catenin mutations by using oligonucleotides arrayed on the surface of a small solid substrate. CONSTITUTION: The beta-catenin oligonucleotide microchip is prepared by arraying oligonucleotides capable of detecting mutations generated at the codon sites, 29, 31, 32, 33, 34, 35, 37, 38, 41, 45 and 48 where the mutations of beta-catenin gene are concentrated on the surface of the solid substrate, wherein the oligonucleotides comprise 9 oligonucleotides for detecting mutations for each codon of 29, 31, 32, 33, 34, 35, 37, 38, 41, 45 and 48, an oligonucleotide for detecting deletion mutation in an open reading frame; and a wild type oligonucleotide for detecting normal nucleotide sequence. The method for manufacturing the beta-catenin oligonucleotide microchip comprises the steps of: (1) adding oligonucleotides into a spotting solution and spotting the mixture on a well plate; (2) arraying the oligonucleotides on the surface of a solid substrate; (3) storing the substrate at room temperature to fix the oligonucleotides and washing the substrate; (4) inserting the substrate into the boiled water and transferring the substrate into a sodium borohydride solution; and (5) washing and drying the substrate.

Abstract translation: 目的：提供β-连环蛋白寡核苷酸微芯片和使用其的β-连环蛋白突变检测方法，从而通过使用排列在小固体底物表面上的寡核苷酸来改善检测β-连环蛋白突变的时间，成本和准确性。 构成：通过排列能够检测在密码子位点29,31,32,33,34,35,37,38,41,45和48处产生的突变的寡核苷酸制备β-连环蛋白寡核苷酸微芯片，其中β- 将连环蛋白基因浓缩在固体底物的表面上，其中寡核苷酸包含9个寡核苷酸，用于检测29,31,32,33,34,35,37,38,41,45和48的每个密码子的突变， 检测开放阅读框中的缺失突变; 和用于检测正常核苷酸序列的野生型寡核苷酸。 制备β-连环蛋白寡核苷酸微芯片的方法包括以下步骤：（1）将寡核苷酸加入点样溶液中并将该混合物点在孔板上; （2）将寡核苷酸排列在固体基质的表面上; （3）在室温下储存基质以固定寡核苷酸并洗涤底物; （4）将基板插入开水中并将基板转移到硼氢化钠溶液中; 和（5）洗涤和干燥基材。

公开(公告)号：KR100451864B1

公开(公告)日：2004-10-08

申请号：KR1020010071774

申请日：2001-11-19

Applicant: 국립암센터

Inventor： 박재갑 ,  김일진 ,  강효정 ,  박재현

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6883 ,  C12Q2600/156

Abstract: The present invention relates to an RET oligonucleotide microchip for detecting mutation in the mutational hot spot regions of RET gene, a manufacturing process thereof and a method for detecting hereditary cancer employing same, wherein specific oligonucleotides are selectively designed to detect various missense mutations at the mutational hot spots of RET gene.

Abstract translation: 本发明涉及用于检测RET基因的突变热点区域中的突变的RET寡核苷酸微芯片，其制造方法和用于检测使用其的遗传性癌症的方法，其中特异性寡核苷酸被选择性地设计以检测突变时的各种错义突变 RET基因的热点。

公开(公告)号：KR1020050103657A

公开(公告)日：2005-11-01

申请号：KR1020040028926

申请日：2004-04-27

Applicant: 국립암센터

Inventor： 박재갑 ,  김일진 ,  강효정 ,  박재현

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2563/107

Abstract: 본 발명은 K-
ras 유전자의 돌연변이 집중코돈 부위 (hot-spot areas)에서 발생가능한 다양한 돌연변이를 검색할 수 있도록 고안된 올리고뉴클레오티드들이 고형 기판의 표면에 고정되어 있는 K-
ras 올리고뉴클레오티드 마이크로어레이, 상기 마이크로어레이의 제조방법 및 이를 이용하여 경쟁적 DNA 혼성화 (competitive DNA hybridization, CDH) 방법에 의해 K-
ras 유전자의 돌연변이를 검사하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 K-
ras 올리고뉴클레오티드 마이크로어레이는 K-
ras 유전자의 특정 돌연변이 집중코돈 부위에 대해 선택적으로 고안된 올리고뉴클레오티드를 포함하고, 이를 이용한 본 발명의 검사방법은 경쟁적 DNA 혼성화 방법을 적용하여 정확성과 효율성을 증가시킴으로써 K-
ras 유전자의 돌연변이 검색 및 K-
ras 유전자와 관련된 신호전달 체계의 연구나 암 기전 연구에 유용하게 사용될 수 있다.

公开(公告)号：KR100508815B1

公开(公告)日：2005-08-19

申请号：KR1020030000987

申请日：2003-01-08

Applicant: 국립암센터

Inventor： 박재갑 ,  김일진 ,  강효정 ,  박재현

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2600/156

Abstract: 본 발명은 β-카테닌 (β-catenin) 유전자의 돌연변이 집중코돈 부위 (hot-spot areas)에서 발생가능한 다양한 돌연변이를 검색할 수 있도록 고안된 올리고뉴클레오티드들을 자동화된 미세배열기를 이용하여 고형 기판의 표면에 고정시켜 β-카테닌 유전자의 돌연변이를 검색할 수 있는 β-카테닌 올리고뉴클레오티드 마이크로칩, 상기 마이크로칩의 제조방법 및 이를 이용하여 β-카테닌 유전자의 돌연변이를 검사하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 β-카테닌 올리고뉴클레오티드 마이크로칩은 기존의 일반적인 올리고뉴클레오티드 칩과는 달리 β-카테닌 유전자의 특정 돌연변이 집중코돈 부위에 대한 올리고뉴클레오티드를 선택적으로 고안함으로써 정확성과 경제성이 뛰어나 β-카테닌 유전자의 돌연변이 검색 및 β-카테닌 유전자와 관련된 신호전달 체계의 연구나 암 기전 연구에 유용하게 사용될 수 있다.

公开(公告)号：KR1020030041045A

公开(公告)日：2003-05-23

申请号：KR1020010071774

申请日：2001-11-19

Applicant: 국립암센터

Inventor： 박재갑 ,  김일진 ,  강효정 ,  박재현

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6883 ,  C12Q2600/156

Abstract: PURPOSE: Provided are a RET oligonucleotide microchip and a method for detecting hereditary cancer employing the same, thereby accurately and economically detecting mutation of RET gene and studying a signal delivery system or cancer mechanism related to RET gene. CONSTITUTION: A RET oligonucleotide microchip is characteristically manufactured by fixing to a solid base plate various kinds of oligonucleotides which are capable of detecting mutation codons(609, 611, 618, 620, 634, 768, 804 and 918) of RET gene and missense mutation using a microarrayer.

Abstract translation: 目的：提供一种RET寡核苷酸微芯片和一种用于检测遗传性癌症的方法，从而准确经济地检测RET基因的突变并研究与RET基因有关的信号传递系统或癌症机制。 构成：RET寡核苷酸微芯片特征性地通过固定在固体基板上制备能够检测到RET基因的突变密码子（609,611,618,620,634,768,804和918）的各种寡核苷酸和错义突变 使用微阵列。