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公开(公告)号:KR101765999B1
公开(公告)日:2017-08-08
申请号:KR1020150009686
申请日:2015-01-21
Applicant: 서울대학교산학협력단
Abstract: 본발명의일실시예에따른암 바이오마커의성능평가장치는, 공개 DB로부터암 발현데이트세트를수집하여전처리하는전처리모듈과, 상기전처리된암 발현데이트세트를재배열하여새로운암 정보 DB를구축하는데이터베이스모듈과, 상기구축된새로운암 정보 DB를이용하여암 유형별로암 바이오마커의성능을평가하는성능평가모듈을포함으로써, 임의의선별된테스팅데이터세트에서저장된예측모델을이용한평가가가능하고, 선별된데이터세트를이용한리브-원-아웃교차-검증(LOOCV)의평가가가능하며, 사용자-제공의트레이닝데이터세트및 선별된테스팅데이터세트를이용한평가가가능하며, 그리고선별된트레이닝및 테스팅데이터세트를이용한다중마커의평가가가능하다.
Abstract translation: 在根据本发明的一个实施方案中癌症生物标志物的评价装置包括一个预处理模块通过收集癌症表达的日期从公共DB设定,重新排列所述预治疗的癌症表达日期组构建新的癌症信息DB的预先处理 以及性能评估模块,用于使用建立的新的癌症信息DB根据癌症的类型评估癌症生物标志物的性能,从而可以使用所存储的预测模型在任何选择的测试数据集中进行评估 ,可以使用选定的数据集评估rib-one-out交叉验证(LOOCV),用用户提供的训练数据集和选定的测试数据集进行评估,并执行选定的培训和测试 可以使用数据集评估中间标记。
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公开(公告)号:KR1020160089981A
公开(公告)日:2016-07-29
申请号:KR1020150009686
申请日:2015-01-21
Applicant: 서울대학교산학협력단
Abstract: 본발명의일실시예에따른암 바이오마커의성능평가장치는, 공개 DB로부터암 발현데이트세트를수집하여전처리하는전처리모듈과, 상기전처리된암 발현데이트세트를재배열하여새로운암 정보 DB를구축하는데이터베이스모듈과, 상기구축된새로운암 정보 DB를이용하여암 유형별로암 바이오마커의성능을평가하는성능평가모듈을포함으로써, 임의의선별된테스팅데이터세트에서저장된예측모델을이용한평가가가능하고, 선별된데이터세트를이용한리브-원-아웃교차-검증(LOOCV)의평가가가능하며, 사용자-제공의트레이닝데이터세트및 선별된테스팅데이터세트를이용한평가가가능하며, 그리고선별된트레이닝및 테스팅데이터세트를이용한다중마커의평가가가능하다.
Abstract translation: 根据本发明的实施例,用于评估癌症生物标志物的性能的装置包括:预处理模块,从公共DB收集癌症表达数据集并对其进行预处理; 重新排列预处理癌症表达数据集以构建新的癌症信息DB的数据库模块; 以及通过使用构建的新的癌症信息DB来评估每种癌症类型的癌症生物标志物的性能的性能评价模块。 因此,设备可以使用任何选定的测试数据集使用存储的预测模型执行评估,并且可以执行使用所选择的数据集的离开交叉验证(LOOCV)评估。 此外,设备可以使用用户提供的训练数据集和选定的测试数据集执行评估,并使用所选的训练和测试数据集评估多标记。
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