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公开(公告)号:KR1020070098043A
公开(公告)日:2007-10-05
申请号:KR1020060029194
申请日:2006-03-30
Applicant: 재단법인서울대학교산학협력재단 , (주)지노첵 , 주식회사 이즈텍 , (주)신원사이언스
Inventor: 황승용 , 정진욱 , 오문주 , 김승준 , 연종필 , 김준섭 , 김용현 , 이창현 , 윤현규 , 염혜정 , 김지훈 , 강경선 , 이영순 , 박준석 , 황재웅 , 김양석 , 이완선 , 전기선 , 엄찬휘 , 강종수 , 이경재 , 송복수 , 전금진 , 여찬동
CPC classification number: G01N33/5302 , C12Q1/6876 , C12Q2563/107 , C12Q2600/158 , G01N33/5014 , G01N33/5308
Abstract: A DNA chip for determining a pharmaceutical drug with hepatotoxicity is provided to improve rapidness and accuracy of determination by specifically detecting changes of gene expression patterns upon administration of a pharmaceutical drug with hepatotoxicity. A DNA chip for determining a pharmaceutical drug with hepatotoxicity comprises (i) a gene probe capable of specifically binding to a gene of which expression pattern is changed when a pharmaceutical drug with hepatotoxicity is administered, (ii) a linker containing oligo(dT)15, -(CH2)6- and amine group, sequentially and being linked to the 5'-terminal of the gene probe through the thymine site, and (iii) a solid substrate having an aldehyde group on the surface and being linked to the linker through Schiff's base binding between an amine group of linker and aldehyde group of the substrate, wherein the gene probe has the nucleotide sequence selected from SEQ ID NO:1 to SEQ ID NO:54.
Abstract translation: 提供用于测定具有肝毒性的药物的DNA芯片,以通过特异性地检测在施用具有肝毒性的药物的基础表达模式的变化来提高测定的快速性和准确性。 用于测定具有肝毒性的药物的DNA芯片包括(i)当施用具有肝毒性的药物时,能够特异性结合表达模式改变的基因的基因探针,(ii)含有寡核苷酸(dT)15 , - (CH2)6-和胺基,并通过胸腺嘧啶位点连接到基因探针的5'末端,和(iii)在表面上具有醛基并与连接体连接的固体底物 通过基团的连接基团和底物的醛基之间的希夫碱基结合,其中基因探针具有选自SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:54的核苷酸序列。
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公开(公告)号:KR1020050100803A
公开(公告)日:2005-10-20
申请号:KR1020040025897
申请日:2004-04-14
Applicant: 재단법인서울대학교산학협력재단
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6876 , C12Q1/6834 , C12Q1/6837 , C12Q2563/107
Abstract: 본 발명은 갭 결합을 통한 세포간 신호전달 억제제의 투여시 발현되는 유전자와 특이적으로 결합할 수 있는 유전자 탐침을 포함하는 DNA 칩, 전기 DNA 칩의 제조방법, 전기 DNA 칩을 포함하는 갭 결합을 통한 세포간 신호전달 억제제 선별용 키트 및 전기 키트를 사용하여 갭 결합을 통한 세포간 신호전달 억제제를 선별하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 갭 결합을 통한 세포간 신호전달 억제제 선별용 DNA 칩은 216 내지 477개의 뉴클레오티드로 구성되고, 갭 결합을 통한 세포간 신호전달 억제제에 의해 발현유도되는 유전자와 특이적으로 결합할 수 있는 유전자 탐침; 올리고(dT)
15 , -(CH
2 )
6 - 및 아민(amine)기를 순차적으로 포함하고, 전기 유전자 탐침의 5' 말단이 올리고(dT)
15 의 3'말단부위에 연결된 링커; 및, 표면에 알데히드가 부착되고, 전기 링커의 아민기가 표면의 알데히드기와 시프염기(Schiff's base) 반응을 통해 연결된 고체기판을 포함한다. 본 발명의 갭 결합을 통한 세포간 신호전달 억제제 선별용 키트는 세포를 손상시키거나 또는 유전적으로 변형시킬 가능성이 있는 물질을 사전에 선별할 수 있으므로, 여러가지 물질의 안전성 검사에 널리 활용될 수 있을 것이다.-
公开(公告)号:KR100885711B1
公开(公告)日:2009-04-10
申请号:KR1020067022611
申请日:2004-04-13
Applicant: (주)지노첵 , 재단법인서울대학교산학협력재단 , 주식회사 이즈텍 , (주)신원사이언스
Inventor: 황승용 , 정진욱 , 오문주 , 김승준 , 연종필 , 김준섭 , 김용현 , 이창현 , 윤현규 , 염혜정 , 강경선 , 이영순 , 박준석 , 황재웅 , 김양석 , 이완선 , 전기선 , 엄찬휘 , 강종수 , 이경재 , 송복수 , 전금진 , 여찬동
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q2600/158
Abstract: The present invention relates to a DNA chip which comprises probes hybridizable to genes expressed when individuals are dosed with peroxisome proliferator, a process for preparing the DNA chip, a screening kit comprising the said DNA chip, and a method for screening of peroxisome proliferator by using the said kit. The DNA chip for screening of peroxisome proliferator comprises: a probe of 121 to 587 nucleotides hybridizable to a gene expressed when individuals are dosed with peroxisome proliferator; a linker consisting of oligo(dT)
15 , -(CH
2 )
6 - and amine residue in a sequential order, whose 5' end is bonded to the 3' end of the said oligo(dT)
15 ; and, a solid substrate attached to aldehyde residue which is bonded to the amine residue of the linker via Schiff's base reaction. The screening kit of the invention can be readily used for the selection of peroxisome proliferators which show peroxisome proliferating activity to induce abnormal cellular responses, which makes possible its practical application in the safety test of various materials.-
公开(公告)号:KR1020070011417A
公开(公告)日:2007-01-24
申请号:KR1020067022611
申请日:2004-04-13
Applicant: (주)지노첵 , 재단법인서울대학교산학협력재단 , 주식회사 이즈텍 , (주)신원사이언스
Inventor: 황승용 , 정진욱 , 오문주 , 김승준 , 연종필 , 김준섭 , 김용현 , 이창현 , 윤현규 , 염혜정 , 강경선 , 이영순 , 박준석 , 황재웅 , 김양석 , 이완선 , 전기선 , 엄찬휘 , 강종수 , 이경재 , 송복수 , 전금진 , 여찬동
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q2600/158 , C12Q1/6837
Abstract: A DNA chip and a kit for screening substances showing activity as a peroxisome proliferator are provided to be able to rapidly and accurately screen the peroxisome proliferator inducing abnormal cell reaction in vivo, thereby being widely applied to safety test of various materials. The DNA chip for screening of peroxisome proliferator comprises: a probe consisting of 121 to 587 nucleotides, capable of binding specifically to a gene whose expression is induced by a peroxisome proliferators; a linker including oligo (dT)15, -(CH2)6- and amine group in sequence, whose 3'-terminal of oligo (dT)15 is linked to 5'-terminal of the probe; and a solid substrate, whose surface is coated with aldehyde group, connecting with amine group of the linker via Schiff's base reaction. In the DNA chip, the probe is at least one gene selected from SEQ ID Nos: 1 to 12. The kit for screening of peroxisome proliferator comprises the DNA chip and a fluorescence-labeled deoxynucleotide to be used for labeling cDNA synthesized from RNA isolated from a sample. The method for screening peroxisome proliferator using the kit comprises the steps of: (a) administering a peroxisome proliferator candidate chemical to an animal; (b) isolating RNA from the animal; (c) synthesizing fluorescence-labeled cDNA from the isolated RNA using fluorescence-labeled deoxynucleotide in the kit; (d) applying the synthesized cDNA to a DNA chip for screening peroxisome proliferator in the kit to allow hybridization; and (e) after washing the hybridized DNA chip, examining the hybridized probe in the DNA chip by using a scanner.
Abstract translation: 提供了用于筛选显示出作为过氧化物酶体增殖物活性的物质的DNA芯片和试剂盒,以能够快速且准确地筛选在体内诱导异常细胞反应的过氧化物酶体增殖物,从而广泛应用于各种材料的安全性试验。 用于筛选过氧化物酶体增殖物的DNA芯片包括:由121至587个核苷酸组成的探针,能够特异性结合其表达由过氧化物酶体增殖物诱导的基因; 包含寡核苷酸(dT)15, - (CH2)6-和胺基的接头,其寡核苷酸(dT)15的3'-末端连接到探针的5'-末端; 和表面用醛基涂覆的固体基质,通过Schiff碱反应与连接体的胺基连接。 在DNA芯片中,探针是选自SEQ ID NO:1〜12的至少一种基因。用于筛选过氧化物酶体增殖物的试剂盒包含DNA芯片和荧光标记的脱氧核苷酸,用于标记从分离自 一个样品。 使用试剂盒筛选过氧化物酶体增殖物的方法包括以下步骤:(a)向动物施用过氧化物酶体增殖物候选化学品; (b)从动物中分离RNA; (c)使用试剂盒中荧光标记的脱氧核苷酸从分离的RNA合成荧光标记的cDNA; (d)将合成的cDNA应用于DNA芯片,用于筛选试剂盒中的过氧化物酶体增殖物以进行杂交; 和(e)在洗涤杂交的DNA芯片之后,通过使用扫描仪检查DNA芯片中的杂交探针。
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公开(公告)号:KR100796701B1
公开(公告)日:2008-01-21
申请号:KR1020060029194
申请日:2006-03-30
Applicant: 재단법인서울대학교산학협력재단 , (주)지노첵 , 주식회사 이즈텍 , (주)신원사이언스
Inventor: 황승용 , 정진욱 , 오문주 , 김승준 , 연종필 , 김준섭 , 김용현 , 이창현 , 윤현규 , 염혜정 , 김지훈 , 강경선 , 이영순 , 박준석 , 황재웅 , 김양석 , 이완선 , 전기선 , 엄찬휘 , 강종수 , 이경재 , 송복수 , 전금진 , 여찬동
Abstract: 본 발명은 간독성을 나타내는 의약의 투여시 발현양상이 변화되는 유전자와 특이적으로 결합할 수 있는 유전자 탐침을 포함하는 DNA 칩, 전기 DNA 칩의 제조방법, 전기 DNA 칩을 포함하는 간독성을 나타내는 의약 선별용 키트 및 전기 키트를 사용하여 간독성을 나타내는 의약을 판별하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 간독성을 나타내는 의약 선별용 DNA 칩은 간독성을 나타내는 의약의 투여시 발현양상이 변화하는 유전자와 특이적으로 결합할 수 있는 유전자 탐침; 올리고 (dT)
15 , -(CH
2 )
6 - 및 아민(amine)기를 순차적으로 포함하고, 전기 유전자 탐침의 5′말단이 티민부위에 연결된 링커; 및, 표면에 알데히드가 부착되고, 전기 링커의 아민기가 표면의 알데히드기와 시프염기반응을 통해 연결된 고체기판을 포함한다. 본 발명의 키트를 이용하면, 간독성을 나타내는 의약을 신속하고 정확하게 판별할 수 있으므로, 보다 안전한 질병의 치료에 널리 활용될 수 있을 것이다.
간독성, DNA 칩-
公开(公告)号:KR1020050100804A
公开(公告)日:2005-10-20
申请号:KR1020040025898
申请日:2004-04-14
Applicant: 재단법인서울대학교산학협력재단
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6837 , C12Q2563/107 , C12Q2600/136
Abstract: 본 발명은 간독성을 나타내는 안지오텐신 Ⅱ 수용체 길항제의 투여시 발현양상이 변화되는 유전자와 특이적으로 결합할 수 있는 유전자 탐침을 포함하는 DNA 칩, 전기 DNA 칩의 제조방법, 전기 DNA 칩을 포함하는 간독성을 나타내는 안지오텐신 Ⅱ 수용체 길항제 선별용 키트 및 전기 키트를 사용하여 간독성을 나타내는 안지오텐신 Ⅱ 수용체 길항제로서 작용할 수 있는 약물을 선별하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 간독성을 나타내는 안지오텐신 II 수용체 길항제 선별용 DNA 칩은 136 내지 597개의 뉴클레오티드로 구성되고, 간독성을 나타내는 안지오텐신 II 수용체 길항제의 투여시 발현양상이 변화하는 유전자와 특이적으로 결합할 수 있는 유전자 탐침; 올리고 (dT)
15 , -(CH
2 )
6 - 및 아민(amine)기를 순차적으로 포함하고, 전기 유전자 탐침의 5′말단이 티민부위에 연결된 링커; 및, 표면에 알데히드가 부착되고, 전기 링커의 아민기가 표면의 알데히드기와 시프염기반응을 통해 연결된 고체기판을 포함한다. 본 발명의 키트를 이용하면, 간독성을 나타내는 안지오텐신 II 수용체 길항제를 신속하고 정확하게 선별할 수 있으므로, 본 발명의 키트는 안지오텐신 II 수용체 길항제의 간독성 검사에 널리 활용될 수 있을 것이다.
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