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公开(公告)号:WO2018074865A2
公开(公告)日:2018-04-26
申请号:PCT/KR2017/011606
申请日:2017-10-19
Applicant: 서울대학교병원 , 서울대학교산학협력단 , 주식회사 셀레믹스
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/68
Abstract: 유방암 예후 예측을 위한 유전자의 발현 수준을 측정하기 위한 제제를 포함하는, 유방암의 예후 예측용 조성물, 상기 조성물을 포함하는 유방암의 예후 예측용 키트, 및 상기 유전자의 발현 수준을 측정하여 유방암의 예후 예측을 위한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다.
Abstract translation:
乳腺癌预后,用于乳腺癌的预后预测包括用于测量基因预测的表达水平的制剂的组合物,用于乳腺癌预测的包含所述组合物的预后的试剂盒,且所述基因的表达 并为预测乳腺癌预后提供信息。 P>
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公开(公告)号:WO2018074865A3
公开(公告)日:2018-04-26
申请号:PCT/KR2017/011606
申请日:2017-10-19
Applicant: 서울대학교병원 , 서울대학교산학협력단 , 주식회사 셀레믹스
IPC: C12Q1/68
Abstract: 유방암 예후 예측을 위한 유전자의 발현 수준을 측정하기 위한 제제를 포함하는, 유방암의 예후 예측용 조성물, 상기 조성물을 포함하는 유방암의 예후 예측용 키트, 및 상기 유전자의 발현 수준을 측정하여 유방암의 예후 예측을 위한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다.
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公开(公告)号:WO2017078484A1
公开(公告)日:2017-05-11
申请号:PCT/KR2016/012699
申请日:2016-11-04
Applicant: 주식회사 셀레믹스
Abstract: 분자클론들이 형성된 기판을 제공하는 단계; 상기 분자클론들 중 원하는 분자클론에 비접촉식으로 에너지를 인가하여 상기 원하는 분자클론을 상기 기판으로부터 추출하는 단계; 상기 추출한 분자클론의 염기서열과 DNA 바코드를 화학적으로 연결하는 단계; 및 상기 DNA 바코드가 연결된 염기서열을 병렬적 염기서열 분석방법으로 분석하는 단계를 포함하는 분자클론 추출 및 확인 방법이 제공된다.
Abstract translation: 提供其上形成分子克隆的底物; 以非接触方式在分子克隆间接触所需的分子克隆以从基底中提取所需的分子克隆; 将提取的分子克隆的碱基序列与DNA条形码化学连接; 并通过平行碱基序列分析方法分析DNA条形码所连接的碱基序列。
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4.
公开(公告)号:WO2017204572A1
公开(公告)日:2017-11-30
申请号:PCT/KR2017/005455
申请日:2017-05-25
Applicant: 주식회사 셀레믹스
Abstract: 2 이상의 이중가닥 핵산분자를 제공하는 단계; 상기 각 핵산분자의 양 말단에 어댑터를 부착하는 단계; 상기 각 핵산분자를 증폭하기 위한 프라이머 쌍을 제공하는 단계로서, 상기 프라이머 쌍을 이루는 프라이머 각각은 i) 상기 어댑터에 상보적인 뉴클레오티드 서열을 갖는 3'-말단 부위; ii) 초병렬 시퀀싱을 위한 공통 프라이머 서열을 갖는 5'-말단 부위; 및 iii) 상기 3'-말단 부위와 5'-말단 부위 사이에 위치하는 인덱스 서열 부위를 포함하고, 상기 프라이머 쌍 중 하나의 인덱스 서열은 각 핵산분자에 대해 고유한 분자 고유 서열이고 나머지 하나의 인덱스 서열은 핵산분자가 유래된 시료를 표시하는 시료 표시 서열인 것인 단계; 및 상기 프라이머 쌍을 이용하여 증폭반응을 수행하여, 분자 고유 서열 및 시료 표시 서열을 포함하는 상기 각 핵산분자의 증폭산물을 생성하는 단계를 포함하는, 초병렬 시퀀싱을 위한 라이브러리를 제조하는 방법이 제공된다.
Abstract translation: 提供两个或更多个双链核酸分子; 将接头连接到每个核酸分子的两端; 提供用于扩增每个核酸分子的一对引物,其中形成所述一对引物的每个引物对包含:i)具有与所述衔接子互补的核苷酸序列的3'末端区域; ii)具有用于超平行测序的共同引物序列的5'-末端区域; 并且iii)位于3'末端区域和5'末端区域之间的索引序列区域,其中引物对之一的索引序列是每个核酸分子的独特分子序列, 其中序列是代表衍生核酸分子的样品的样品展示序列; 并且使用引物对进行扩增反应以产生包含分子特异性序列和样品展示序列的每个核酸分子的扩增产物,以及用于产生超平行测序文库的方法 P>
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公开(公告)号:WO2019212138A1
公开(公告)日:2019-11-07
申请号:PCT/KR2019/002634
申请日:2019-03-07
Applicant: 주식회사 셀레믹스
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6848
Abstract: 본 발명은 차세대 염기서열 분석 시료 간 교차 오염 탐색용 올리고뉴클레오티드를 포함하는 재조합 벡터, 및 상기 재조합 벡터를 이용하여 차세대 염기서열 분석 시료 간 교차 오염을 탐색할 수 있는, 차세대 염기 서열분석법에 관한 것이다.
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公开(公告)号:KR101888868B1
公开(公告)日:2018-08-16
申请号:KR1020160147000
申请日:2016-11-04
Applicant: 주식회사 셀레믹스 , 서울대학교산학협력단
Abstract: 분자클론들이형성된기판을제공하는단계; 상기분자클론들중 원하는분자클론에비접촉식으로에너지를인가하여상기원하는분자클론을상기기판으로부터추출하는단계; 상기추출한분자클론의염기서열과 DNA 바코드를화학적으로연결하는단계; 및상기 DNA 바코드가연결된염기서열을병렬적염기서열분석방법으로분석하는단계를포함하는분자클론추출및 확인방법이제공된다.
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公开(公告)号:KR101913735B1
公开(公告)日:2018-11-01
申请号:KR1020180051375
申请日:2018-05-03
Applicant: 주식회사 셀레믹스
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6848
Abstract: 본발명은차세대염기서열분석시료간 교차오염탐색용올리고뉴클레오티드를포함하는재조합벡터, 및상기재조합벡터를이용하여차세대염기서열분석시료간 교차오염을탐색할수 있는, 차세대염기서열분석법에관한것이다.
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公开(公告)号:KR1020130018575A
公开(公告)日:2013-02-25
申请号:KR1020120084303
申请日:2012-08-01
Applicant: 주식회사 셀레믹스
CPC classification number: C12N15/1093 , C12N15/1027 , C12N15/1031 , C12N15/1065 , C12Q1/6806 , C12Q1/6811 , C12Q2563/185 , G06F19/22
Abstract: PURPOSE: A method for preparing a nucleic acid molecule is provided to prepare an amplified product including a target nucleic acid sequence using a target oligonucleotide pool, and to synthesize the huge target nucleic acid molecule(more than 10 kb). CONSTITUTION: A method for preparing a nucleic acid molecule comprises: a step of providing nucleic acid fragments which constitute a part of the target nucleic acid molecule(S110); a step of tagging the nucleic acid fragments with barcode sequences(S120); a step of identifying the tagged nucleic acid fragments(S130); and a step of collecting desired nucleic acid fragments among the nucleic acid fragments(S140). The method further comprises a step of additionally amplifying the nucleic acid fragments when the nucleic acid fragments are derived from a DNA microarray. The length of the barcode sequence is 5-300 bp. The barcode sequence is tagged by PCR, emulsion PCR, or ligation. [Reference numerals] (AA) Start; (BB) End; (S110) Providing nucleic acid fragments; (S120) Tagging the nucleic acid fragments with barcode sequences; (S130) Confirming the sequence of the tagged nucleic acid fragments; (S140) Collecting desired nucleic acid fragments; (S150) Synthesizing long nucleic acid fragments by assembling the collected nucleic acid fragments
Abstract translation: 目的:提供一种制备核酸分子的方法,以使用靶寡核苷酸库制备包含靶核酸序列的扩增产物,并合成巨大的靶核酸分子(大于10kb)。 构成:制备核酸分子的方法包括:提供构成靶核酸分子的一部分的核酸片段的步骤(S110); 用条形码序列标记核酸片段的步骤(S120); 鉴定标记的核酸片段的步骤(S130); 以及在所述核酸片段中收集所需核酸片段的步骤(S140)。 该方法还包括当核酸片段衍生自DNA微阵列时另外扩增核酸片段的步骤。 条形码序列的长度为5-300bp。 条形码序列通过PCR,乳液PCR或连接进行标记。 (附图标记)(AA)开始; (BB)结束; (S110)提供核酸片段; (S120)用条码序列标记核酸片段; (S130)确认标记的核酸片段的序列; (S140)收集所需的核酸片段; (S150)通过组装所收集的核酸片段合成长核酸片段
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10.
公开(公告)号:KR1020170133270A
公开(公告)日:2017-12-05
申请号:KR1020170063294
申请日:2017-05-23
Applicant: 주식회사 셀레믹스
Abstract: 2 이상의이중가닥핵산분자를제공하는단계; 상기각 핵산분자의양 말단에어댑터를부착하는단계; 상기각 핵산분자를증폭하기위한프라이머쌍을제공하는단계로서, 상기프라이머쌍을이루는프라이머각각은 i) 상기어댑터에상보적인뉴클레오티드서열을갖는 3'-말단부위; ii) 초병렬시퀀싱을위한공통프라이머서열을갖는 5'-말단부위; 및 iii) 상기 3'-말단부위와 5'-말단부위사이에위치하는인덱스서열부위를포함하고, 상기프라이머쌍 중하나의인덱스서열은각 핵산분자에대해고유한분자고유서열이고나머지하나의인덱스서열은핵산분자가유래된시료를표시하는시료표시서열인것인단계; 및상기프라이머쌍을이용하여증폭반응을수행하여, 분자고유서열및 시료표시서열을포함하는상기각 핵산분자의증폭산물을생성하는단계를포함하는, 초병렬시퀀싱을위한라이브러리를제조하는방법이제공된다. 또한, 상기방법에의해제조된라이브러리를이용하는초병렬시퀀싱을통한핵산서열분석방법이제공된다.
Abstract translation: 提供至少两个双链核酸分子; 将接头连接到每个核酸分子的两端; 提供用于扩增每个核酸分子的一对引物,其中形成所述一对引物的每个引物对包含:i)具有与所述衔接子互补的核苷酸序列的3'末端区域; ii)具有用于超平行测序的共同引物序列的5'-末端区域; 并且iii)位于3'末端区域和5'末端区域之间的指标序列区域,其中所述引物对下的指标序列是每个核酸分子的独特分子序列, 核酸分子是代表衍生核酸分子的样品的样品展示序列; 并且使用引物对进行扩增反应以产生包含分子特异性序列和样品展示序列的每个核酸分子的扩增产物,以及用于产生超平行测序文库的方法 是的。 另外,提供了使用由上述方法产生的文库的使用超平行测序的核酸序列分析方法。
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