公开(公告)号：KR100610240B1

公开(公告)日：2006-08-09

申请号：KR1020050064754

申请日：2005-07-18

Applicant: 한국과학기술원

Inventor： 이도헌 ,  이필현 ,  김영훈

IPC: G06F19/20 ,  G06F19/12

Abstract: 본 발명은 유전자 수에 비해 실험 데이터가 부족한 경우에도 신뢰성 있는 유전자 상호작용 추론이 가능토록 한 베이지안 네트워크 학습을 이용한 유전자 회로 역공학 시스템 및 방법을 제공한다. 본 발명의 시스템은 생물주석정보 및 유전자간 상호정보를 이용하여 유전자간 유사성을 계산하는 제1, 제2 유사성 계산부; 마이크로어레이 발현 데이터로부터 실험조건에 따라 특이성을 가지는 유전자를 씨앗 유전자로 선택하는 씨앗 유전자 선택부; 상기 제1,2 유사성 계산부를 통하여 얻어진 결과를 바탕으로 상기 씨앗 유전자를 중심으로 한 영역을 확장해가면서 유사 유전자 그룹인 유전자 모듈을 형성하는 유전자 모듈 형성부; 상기 유전자 씨앗을 중심으로 형성된 각 유전자 모듈들에 대해서 병렬화된 베이지안 네트워크 학습을 수행하는 학습부; 상기 각 유전자 모듈들 간에 공통적으로 포함되어 있는 매개 유전자를 이용하여 상기 학습부에서 학습된 각 유전자 모듈을 하나의 네트워크로 통합하는 통합부로 구성됨을 특징으로 한다.
유전자 상호작용, 추론, 베이지안 네트워크, 유전자 네트워크

Abstract translation: 本发明提供了一种使用贝叶斯网络学习的遗传电路逆向工程系统和方法，即使当实验数据与基因数目相比不足时，也能够实现可靠的基因相互作用推论。 本发明的系统包括第一和第二相似度计算单元，用于计算使用生物注释信息的基因之间的相似性和基因之间的互信息; 种子基因选择单元，用于根据来自微阵列表达数据的实验条件选择具有特异性的基因作为种子基因; 基因模块形成单元，用于形成作为相似基因组的基因模块，同时基于通过第一和第二相似性计算单元获得的结果扩展种子基因周围的区域; 学习单元，用于对基因种子周围形成的每个基因模块进行并行贝叶斯网络学习; 以及整合单元，用于通过使用通常包括在各个基因模块中的中间基因将在学习单元中学习的每个基因模块整合到一个网络中。