Abstract:
인간 유전체 정보에 있어서 중요한 가장 기본적인 데이터인 대립 유전자 카운팅(allele counting)값을 고속으로 추출해 내는 장치 및 방법을 제시한다. 제시된 장치는 인간 유전체 데이터를 포함하는 하나 이상의 BAM 파일을 입력받는 BAM 파일 입력부, 및 BAM 파일을 근거로 대립 유전자의 수를 카운팅하는 카운팅부를 포함한다.
Abstract:
PURPOSE: A system and a method for providing a health care service based on an IPTV are provided to collect health data of a PHD standard health care device around through a health care set-top in an IPTV, thereby providing a healthcare service to users through an existing IPTV communication network. CONSTITUTION: At least one health devices(120,130,140) collects personal health data. A healthcare set-top(220) is loaded in an IPTV(Internet Protocol Television)(200). The healthcare set top changes the individual health data of a PHD(Personal Health Device) standard into CDA(Clinical Document Architecture) standard data. The healthcare set-top transmits the CDA standard data to a healthcare server(320) through an IPTV communication network. The health care server is installed in the IPTV data center(300). The health care server manages collectively the CDA format data.
Abstract:
An apparatus and a method for assigning a bio pathway of a gene list by using gene homologue information are provided to enable a chip analyzer to determine a function of a cluster easily by automatically giving a bio pathway name of a gene cluster list resulted from clustering chip experiment data. An apparatus for assigning a bio pathway of a gene list includes a homologue/uniqueness gene list generator(110), a vocabulary assigning unit(120), a statistical similarity probability calculator(130) and a pathway assigning unit(140). The homologue/uniqueness gene list generator generates a homologue or uniqueness gene list by selecting genes owned and not owned by a comparison species among a gene list of a target species. The vocabulary assigning unit assigns vocabularies of a GO(Gene Ontology) and a KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) to the homologue/uniqueness gene list. The statistical similarity probability calculator calculates hyper geometric distribution similarity probability in the homologue/uniqueness gene list for each vocabulary of the GO and the KEGG. The pathway assigning unit selects the vocabulary of the GO and the KEGG having the minimum hyper geometric distribution similarity probability for each gene list, and assigns the selected vocabulary to the bio pathway name.
Abstract:
본 발명은 유전자의 발현 패턴 데이터와 단백질 상호작용 데이터를 이용하여 생물학적으로 같은 특정 목적을 수행하는 패스웨이를 예측하는 방법 및 시스템에 관한 것이다. 본 발명에 따른 유전자의 패스웨이 예측 방법은 유전자의 발현 패턴 데이터로부터 유전자 간 패스웨이 추출 알고리즘을 통해 부분 패스웨이를 생성하고, 이 부분 패스웨이를 매칭시켜 그래프 구조로 표시하는 제 1 단계, 유전자의 단백질 상호작용 데이터로부터 패스웨이 추출 알고리즘을 통해 부분 패스웨이를 생성하고, 이 부분 패스웨이를 매칭시켜 그래프 구조로 표시하는 제 2 단계, 및 제 1 단계의 그래프 구조와 제 2 단계의 그래프 구조를 그래프 매칭 알고리즘을 통해 융합하여 그래프 구조로 표시하는 제 3 단계를 포함한다. 이와 같이 본 발명에 따른 패스웨이 예측 방법은 질병 발병 기전이나 경로에 대한 것을 생물학적인 많은 실험을 통한 것이 아니라, 해당 mRNA 발현 패턴과 기존에 밝혀져 있는 단백질 상호작용 데이터를 통해서 예측함으로 시간과 비용을 효율적으로 줄일 수 있으며, 또한, 두 가지 이상의 생물학적 데이터를 사용함으로써 예측 결과의 신뢰성이 향상될 수 있다. 유전자, 발현 패턴, 단백질 상호작용, 패스웨이, 예측
Abstract:
The present invention relates to a sequence fragment alignment method and, more specifically, to a method for aligning genomic sequence fragments by using a many-core process. A sequence fragment alignment system by the present invention, which aligns a set of sequence fragments of a genome being decoded with respect to a reference sequence, comprises: a main memory which stores the reference sequence and a set of the sequence fragments; a main processor which divides the reference sequence to generate first and second reference sequence fragments; and a many-core module (120) which aligns a set of the sequence fragments in parallel with respect to each of the first and second reference sequence fragments. The sequence fragment alignment system and sequence fragment alignment method by the present invention divides a reference sequence and aligns sequence fragments of a genome at a high speed in a many-core environment. [Reference numerals] (110) Main module; (120) Many-core module; (AA) First reference sequence fragments; (BB,DD) Set of sequence fragments; (CC) N^th reference sequence fragments; (EE) First cluster of sequence fragments; (FF) Second cluster of sequence fragments; (GG) m^th cluster of sequence fragments; (SB111) First kernel; (SB11N) N^th kernel; (SB121) First grid; (SB12N) N^th grid; (SB130) Common block; (SB131) First block; (SB132) Second block; (SB13m) m^th block
Abstract:
본 발명은 보행 패턴 분석 방법에 관한 것으로서, 다수의 FSR(Force Sensing Resistor) 센서에서 발 압력값을 측정하여 출력하는 단계; 다수의 압력 국부 영역 중 각각의 압력 국부 영역에 포함된 FSR 센서들의 출력값의 합이 최대값을 가지는 최대 압력 국부 영역을 검색하는 단계; 상기 검출된 최대 압력 국부 영역에 대해 압력 중심점(Center of Pressure) 계산을 수행하는 단계; 및 상기 계산된 압력 중심점을 압력중심점 이동 궤적에 추가하여 보행 패턴을 분석하는 단계를 포함한다. 여기서, 상기 다수의 FSR 센서의 출력값에서 오류인 섬(Island)을 제거하는 단계를 더 포함할 수 있다. COG, COP, 보행 패턴, FSR, 압력 국부 영역