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公开(公告)号：CN109661407A
公开(公告)日：2019-04-19
申请号：CN201780042662.7
申请日：2017-06-06
Applicant: 西北大学
CPC classification number: C07K16/46 , A61K2039/505 , A61P19/02 , A61P35/00 , A61P37/00 , C07K16/32 , C07K2317/24 , C07K2317/55 , C07K2317/565 , C07K2317/73 , C07K2317/92 , C07K2317/94 , C07K2319/00 , C07K2319/61 , C12N9/18 , C12Y201/01037 , C12Y301/01074 , C12Y301/21002 , C12Y302/01021 , C12Y304/11018 , C12Y304/24024 , C12Y305/02006
Abstract: 本公开提供了包含第一融合蛋白、第二融合蛋白和连接体的构建体，其中所述第一融合蛋白和所述第二融合蛋白各自包含亲和试剂和活性酶，并且所述连接体包含对不可逆抑制第一和第二融合蛋白活性酶具有特异的第一和第二官能团。本公开还提供了一种方法，包括(a)将包括亲和试剂和活性酶的第一融合蛋白与连接体接触，所述连接体包括对不可逆地抑制所述第一融合蛋白活性酶具有特异性的官能团，从而将所述第一融合蛋白与所述连接体偶联，以及(b)将包括亲和试剂和活性酶的第二融合蛋白与所述连接体接触，所述连接体包括对不可逆地抑制所述第二融合蛋白活性酶具有特异性的官能团，从而将所述第二融合蛋白与所述连接体偶联。
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公开(公告)号：CN106589134A
公开(公告)日：2017-04-26
申请号：CN201610996972.X
申请日：2016-11-11
Applicant: 仪宏
IPC: C07K19/00
CPC classification number: C12N9/16 , C07K14/195 , C07K2319/33 , C12N9/0071 , C12N9/1007 , C12N9/2497 , C12N9/78 , C12Y114/11 , C12Y201/01037 , C12Y301/21004 , C12Y302/02021 , C12Y305/04005
Abstract: 本发明涉及生物技术，具体而言，本发明涉及一种嵌合蛋白pAgoE及其构建方法和应用，同时，本发明还涉及一种使用向导的嵌合蛋白pAgoE及其构建方法和应用，以及基于嵌合蛋白pAgoE的具有基因组靶向编辑功能的嵌合蛋白。所述的嵌合蛋白pAgoE含有具有基因组靶向定位功能的pAgo结构域，以及与所述pAgo结构域连接的、具有基因组切割或修饰活性的效应结构域E。本发明的嵌合蛋白pAgoE，是将具有基因组靶向定位功能的pAgo结构域，以及具有基因组切割或修饰活性等催化活性的效应结构域融合，构建了嵌合蛋白(pAgoE)，该嵌合蛋白pAgoE同时保持了pAgo结构域中原有的具有靶向定位功能的基因组(DNA)的靶向结合能力以及效应结构域E的基因组催化或修饰能力，以便为效应结构域E发挥作用提供空间位置保障基础。
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公开(公告)号：CN107109433A
公开(公告)日：2017-08-29
申请号：CN201580057762.8
申请日：2015-10-23
Applicant: 圣拉斐尔医院有限责任公司 , 特莱索恩基金会
CPC classification number: C12N9/1007 , A61K35/12 , A61K38/1709 , A61K38/45 , A61K48/005 , C07K14/4703 , C07K2319/80 , C12N2740/16043 , C12Y201/01037 , C12Y201/01043 , C12N15/85
Abstract: 产品，所述产品包含两种或更多种人工转录阻抑物(ATR)或编码其的多核苷酸，所述人工转录阻抑物(ATR)选自(a)、(b)、(c)或(d)组：(a)包含可操作连接至KRAB域或其同源物的DNA结合域的ATR；(b)包含可操作连接至DNMT3A、DNMT3B或DNMT1域或其同源物的DNA结合域的ATR；(c)包含可操作连接至DNMT3L域或其同源物的DNA结合域的ATR；和(d)包含可操作连接至SETDB1域或其同源物的DNA结合域的ATR，其中至少两种ATR选自不同的(a)、(b)、(c)或(d)组。
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公开(公告)号：CN102618476B
公开(公告)日：2013-09-04
申请号：CN201210080124.6
申请日：2012-03-23
Applicant: 中国科学院微生物研究所
CPC classification number: C12N15/70 , C12N1/20 , C12N9/1007 , C12N15/74 , C12N15/75 , C12R1/19 , C12Y201/01037
Abstract: 本发明公开了一种克服靶细菌限制修饰障碍导入外源DNA的方法。本发明提供的方法，包括如下步骤：1)将靶细菌基因组中所有DNA甲基转移酶编码基因在自身限制修饰系统缺失的大肠杆菌中共表达，得到重组菌A；2)将外源DNA分子导入所述重组菌A进行体内修饰，得到甲基化修饰的外源DNA分子；3)将所述甲基化修饰的外源DNA分子导入所述靶细菌中。本发明的实验证明，本发明与现有的克服细菌限制修饰障碍，实现遗传操作的方法相比转化率高。
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公开(公告)号：CN102618476A
公开(公告)日：2012-08-01
申请号：CN201210080124.6
申请日：2012-03-23
Applicant: 中国科学院微生物研究所
CPC classification number: C12N15/70 , C12N1/20 , C12N9/1007 , C12N15/74 , C12N15/75 , C12R1/19 , C12Y201/01037
Abstract: 本发明公开了一种克服靶细菌限制修饰障碍导入外源DNA的方法。本发明提供的方法，包括如下步骤：1)将靶细菌基因组中所有DNA甲基转移酶编码基因在自身限制修饰系统缺失的大肠杆菌中共表达，得到重组菌A；2)将外源DNA分子导入所述重组菌A进行体内修饰，得到甲基化修饰的外源DNA分子；3)将所述甲基化修饰的外源DNA分子导入所述靶细菌中。本发明的实验证明，本发明与现有的克服细菌限制修饰障碍，实现遗传操作的方法相比转化率高。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：US11912994B2
公开(公告)日：2024-02-27
申请号：US17214320
申请日：2021-03-26
Applicant: The General Hospital Corporation
Inventor： Jeannie T. Lee , Anand Minajigi , Lieselot Carrette
IPC: C12N15/113 , C12N9/10 , C12Q1/6883 , C12N9/90
CPC classification number: C12N15/113 , C12N9/1007 , C12N9/90 , C12Q1/6883 , C12Y201/01037 , C12Y599/01002 , C12N2310/113 , C12N2310/14 , C12N2310/20 , C12N2310/3231 , C12N2310/531 , C12N2320/34 , C12Q2600/156 , C12N2310/14 , C12N2310/531
Abstract: Methods for reactivating genes on the inactive X chromosome that include administering one or both of a DNA methyltransferase (DNMT) Inhibitor and/or a topoisomerase inhibitor, e.g., etoposide and/or 5′-azacytidine (aza), optionally in combination with an inhibitor of XIST RNA and/or an Xist-interacting protein, e.g., a chromatin-modifying protein, e.g., a small molecule or an inhibitory nucleic acid (such as a small inhibitory RNA (siRNAs) or antisense oligonucleotide (ASO)) that targets XIST RNA and/or a gene encoding an Xist-interacting protein, e.g., a chromatin-modifying protein.
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公开(公告)号：US20230183662A1
公开(公告)日：2023-06-15
申请号：US17552076
申请日：2021-12-15
Applicant: Zhejiang University
Inventor： Yuejin Hua , Shengjie Li , Liangyan Wang , Jianling Cai , Xiaoting Hua
IPC: C12N9/10
CPC classification number: C12N9/1007 , C12Y201/01037
Abstract: A DNA methyltransferase is derived from Deinococcus radiodurans and has a typical conservative structural domain of DNA methyltransferase. The DNA methyltransferase includes: an AdoMet binding region containing a “FxGxG” conservative sequence, a target sequence recognition region and a catalytic region containing a “TSPPY” conservative sequence sequentially from N-terminal to C-terminal; and belongs to α-type DNA methyltransferase category. The recognized substrate DNA conservative sequence is 5′-CCGCGG-3′, a methylation modified position is N4 site of second cytosine to generate a 4mC type modified base, and an optimum temperature for methylated reaction is in a range of 25-37° C. The DNA methyltransferase can specific-recognize the conservative motif of “CCGCGG” and methylate the N4 site of the second cytosine to produce the 4mC modified base, which is a N4-Cytosine DNA methyltransferase.
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公开(公告)号：US20180179525A1
公开(公告)日：2018-06-28
申请号：US15821632
申请日：2017-11-22
Applicant: Flagship Pioneering, Inc.
Inventor： Laura Gabriela Lande , David Arthur Berry , Rahul Karnik
IPC: C12N15/113 , C12N15/63 , C12N15/90
CPC classification number: C12N15/113 , A01K2217/056 , A01K2227/706 , A01K2267/0318 , A61K35/12 , C07K2319/00 , C07K2319/85 , C12N9/00 , C12N9/1007 , C12N9/22 , C12N9/80 , C12N15/63 , C12N15/85 , C12N15/87 , C12N15/90 , C12N2310/14 , C12N2310/20 , C12Y201/01037 , C12Y201/01043 , C12Y305/01098
Abstract: The present disclosure provides compositions with a modulating gene expression and methods for modulating transcription.
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公开(公告)号：US20120252072A1
公开(公告)日：2012-10-04
申请号：US13439069
申请日：2012-04-04
Applicant: JANET WESTPHELING , DaeHwan Chung , Jennifer Huddleston , Joel A. Farkas
Inventor： JANET WESTPHELING , DaeHwan Chung , Jennifer Huddleston , Joel A. Farkas
CPC classification number: C12N9/22 , C12N9/1007 , C12P19/34 , C12Y201/01037 , C12Y301/21004
Abstract: The present invention relates to the discovery of a novel restriction/modification system in Caldicellulosiruptor bescii. The discovered restriction enzyme is a HaeIII-like restriction enzyme that possesses a thermophilic activity profile. The restriction/modification system also includes a methyltransferase, M.CbeI, that methylates at least one cytosine residue in the CbeI recognition sequence to m4C. Thus, the invention provides, in various aspects, isolated CbeI or M.CbeI polypeptides, or biologically active fragments thereof; isolated polynucleotides that encode the CbeI or M.CbeI polypeptides or biologically active fragments thereof, including expression vectors that include such polynucleotide sequences; methods of digesting DNA using a CbeI polypeptide; methods of treating a DNA molecule using a M.CbeI polypeptide; and methods of transforming a Caldicellulosiruptor cell.
Abstract translation: 本发明涉及在Caldicellulosiruptor bescii中发现新的限制/修饰系统。 所发现的限制酶是具有嗜热活性分布的HaeIII样限制酶。 限制/修饰系统还包括甲基转移酶M.CbeI，其将CbeI识别序列中的至少一个胞嘧啶残基甲基化为m4C。 因此，本发明在各个方面提供了分离的CbeI或M.CbeI多肽或其生物活性片段; 编码CbeI或M.CbeI多肽或其生物活性片段的分离的多核苷酸，包括包括这种多核苷酸序列的表达载体; 使用CbeI多肽消化DNA的方法; 使用M.CbeI多肽处理DNA分子的方法; 和转化Caldicellulosiruptor细胞的方法。
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公开(公告)号：JP2015515268A
公开(公告)日：2015-05-28
申请号：JP2015502066
申请日：2013-02-21
Applicant: 中国科学院微生物研究所
CPC classification number: C12N15/70 , C12N1/20 , C12N9/1007 , C12N15/74 , C12N15/75 , C12R1/19 , C12Y201/01037
Abstract: 本発明は、標的細菌の制限修飾バリアを乗り越えて外来性DNAを導入する方法を開示した。本発明が提供する方法は、1)標的細菌ゲノム中の全てのDNAメチルトランスフェラーゼコード遺伝子を自己制限修飾系が欠失する大腸菌の中で共発現させ、組換え菌Aを得るステップ、2)外来性DNA分子を前記組換え菌Aに導入し、in vivo修飾を行い、メチル化修飾した外来性DNA分子を得るステップ、及び3)前記メチル化修飾した外来性DNA分子を前記標的細菌の中に導入するステップを含む。本発明の実験から、本発明は、従来の細菌制限修飾バリアを乗り越え、遺伝操作を実現する方法に比べて、形質転換率が高いことが証明された。
Abstract translation: 本发明公开了一种用于将外源DNA的方法克服了靶细菌的限制修饰屏障。 本发明所提供的方法，1）中的所有DNA甲基编码基因靶细菌基因组共表达在大肠杆菌自限制修饰系统缺乏，以获得重组细菌A，2）门诊 引入性DNA分子与重组细菌的，在活体内修饰执行步骤得到的甲基化修饰的外源DNA分子，以及3）的甲基化修饰在所述外源性DNA分子靶细菌 包括引入的步骤。 本发明中，本发明的实验克服常规细菌限制修饰屏障，相比于实现遗传操作的方法中，已经证实转化率是高的。
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