公开(公告)号：CN116070157B

公开(公告)日：2024-04-16

申请号：CN202310041103.1

申请日：2023-01-13

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 滕志霞 ,  李羽清 ,  汪国华

IPC: G06F18/2415 ,  G06F18/214 ,  G06F18/2431 ,  G06F18/25 ,  G16B30/00

Abstract: 基于级联森林和双流结构的circRNA识别方法，具体涉及一种利用级联森林基于RNA序列k‑mer生物特征和circRNA剪接位置特征的双流结构的circRNA识别方法，为了解决现有circRNA识别方法识别的结果不准确的问题。获取预处理后包含circRNA或lncRNA的RNA序列，获得每条RNA序列剪接位置序列的位置特征向量，以及RNA序列k‑mer信息的k‑mer特征向量，将二者分别输入位置森林和k‑mer森林中，分别输出位置类别概率向量和k‑mer类别概率向量，将位置类别概率向量和k‑mer类别概率向量分别与超参数u进行融合，将融合后的两个结果相加，得到RNA序列最终的类别概率向量，获得RNA序列是否为circRNA的识别结果。属于生物信息领域。

公开(公告)号：CN116070157A

公开(公告)日：2023-05-05

申请号：CN202310041103.1

申请日：2023-01-13

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 滕志霞 ,  李羽清 ,  汪国华

IPC: G06F18/2415 ,  G06F18/214 ,  G06F18/2431 ,  G06F18/25 ,  G16B30/00

Abstract: 基于级联森林和双流结构的circRNA识别方法，具体涉及一种利用级联森林基于RNA序列k‑mer生物特征和circRNA剪接位置特征的双流结构的circRNA识别方法，为了解决现有circRNA识别方法识别的结果不准确的问题。获取预处理后包含circRNA或lncRNA的RNA序列，获得每条RNA序列剪接位置序列的位置特征向量，以及RNA序列k‑mer信息的k‑mer特征向量，将二者分别输入位置森林和k‑mer森林中，分别输出位置类别概率向量和k‑mer类别概率向量，将位置类别概率向量和k‑mer类别概率向量分别与超参数u进行融合，将融合后的两个结果相加，得到RNA序列最终的类别概率向量，获得RNA序列是否为circRNA的识别结果。属于生物信息领域。