公开(公告)号：CN118516445A

公开(公告)日：2024-08-20

申请号：CN202410582447.8

申请日：2024-05-11

Applicant: 东南大学

Inventor： 赵祥伟 ,  党开同 ,  何立勇 ,  王文甲

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/686 ,  C40B50/06 ,  C12N15/10

Abstract: 本发明公开了基于编码Tn5转座酶的多路复用空间转录组全长测序文库的构建方法（CBTi‑seq），本发明对Tn5转座子ME核心序列末端修饰编码序列标签，通过裸酶包埋制备编码Tn5转座酶，该转座酶能够在打断dsDNA的同时，将编码添加在片段末端，从而可以将多样本的内部片段收集至单管中，统一进行测序文库构建。并且不同编码Tn5转座酶可以根据实际需要，灵活组合使用，从而实现用更低的实验成本满足更高的通量需求，并且分开发出针对单个样本和多个样本的CBTi‑seq测序文库构建流程，通过与Smart‑seq2以及3’Targeting技术比对，证明CBTi‑seq技术的优越性。

公开(公告)号：CN117344001A

公开(公告)日：2024-01-05

申请号：CN202311305644.7

申请日：2023-10-10

Applicant: 东南大学

Inventor： 赵祥伟 ,  何立勇 ,  党开同 ,  王文甲

IPC: C12Q1/6869 ,  G01N15/14 ,  G01N15/01 ,  C12Q1/6806 ,  G01N30/02 ,  G01N30/60 ,  G01N30/72 ,  G01N1/28 ,  G01N1/40

Abstract: 一种基于磁性微球分离的单细胞多组学分析方法及其应用，包括制备磁性微球，通过冻融循环和裂解液对单细胞裂解，捕获裂解体系中的mRNA和分离出蛋白质，对捕获的mRNA进行逆转录、预扩增、cDNA纯化、Tn5转座酶打断、文库构建PCR和文库纯化以形成转录组文库并进行测序，同时对分离出的蛋白质进行变性、还原、烷基化、酶解消化以形成肽段来进行色谱分离与基于质谱技术的蛋白质组学鉴定。本发明能够实现在同一单细胞中同时对转录组和蛋白质组的深度非靶向分析，为无标记的单细胞多组学联合测定提供了新的分析工具。此外，本方法无需额外复杂定制精密器械或耗材，并可适用于市面大多数的测序仪及质谱仪器而无需改造。