-
公开(公告)号：CN115058492A
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210798000.5
申请日：2022-07-07
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一种基于均分组合编码微球的空间转录组测序文库构建方法，包括如下步骤：基于均分组合理念的DNA编码微球的设计与制备；基于SCDB微球的转录组测序文库构建(SCDB‑seq)的设计；基于SCDB‑seq的空间转录组测序的设计与实现。本方法可以以单细胞分辨率(～10μm)对新鲜冰冻样本切片和福尔马林固定石蜡包埋样本切片上的微区进行可选择性的、高多路复用性的中通量(50～1000样本)空间转录组测序文库构建，能够可以选择性地获得组织切片中多个特定微区样本的基因表达谱；本方法实验操作量和试剂成本仅为已有同类方法的～1％和～13％，展现出良好的人力和试剂成本控制。
-
公开(公告)号：CN116555397A
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202310520424.X
申请日：2023-05-10
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6837 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种微针阵列及其应用，所述微针阵列包括含有探针的微针阵列，所述探针由5’端至3’端方向包括第一组探针和第二组探针，所述第一组探针中的每一个探针包括通用序列、第一空间编码序列和连接序列，所述第一组探针的核苷酸序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.10的一种或多种；所述第二组探针中的每一个探针包括连接序列、第二空间编码序列、UMI序列和捕获序列，所述第二组探针的核苷酸序列选自SEQ ID NO.11～SEQ ID NO.20的一种或多种。本发明的微针阵列，结合微针阵列和修饰有空间定位信息的探针，可在不对细胞造成损伤的情况下，实现高通量空间转录组学分析，并能够对同一组织或细胞进行连续时间层面上的组学分析。本发明的微针阵列用于空间组学分析，可有效地降低制备捕获mRNA探针所需的成本。
-
公开(公告)号：CN118516445A
公开(公告)日：2024-08-20
申请号：CN202410582447.8
申请日：2024-05-11
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/686 , C40B50/06 , C12N15/10
Abstract: 本发明公开了基于编码Tn5转座酶的多路复用空间转录组全长测序文库的构建方法（CBTi‑seq），本发明对Tn5转座子ME核心序列末端修饰编码序列标签，通过裸酶包埋制备编码Tn5转座酶，该转座酶能够在打断dsDNA的同时，将编码添加在片段末端，从而可以将多样本的内部片段收集至单管中，统一进行测序文库构建。并且不同编码Tn5转座酶可以根据实际需要，灵活组合使用，从而实现用更低的实验成本满足更高的通量需求，并且分开发出针对单个样本和多个样本的CBTi‑seq测序文库构建流程，通过与Smart‑seq2以及3’Targeting技术比对，证明CBTi‑seq技术的优越性。
-
公开(公告)号：CN117344001A
公开(公告)日：2024-01-05
申请号：CN202311305644.7
申请日：2023-10-10
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6869 , G01N15/14 , G01N15/01 , C12Q1/6806 , G01N30/02 , G01N30/60 , G01N30/72 , G01N1/28 , G01N1/40
Abstract: 一种基于磁性微球分离的单细胞多组学分析方法及其应用，包括制备磁性微球，通过冻融循环和裂解液对单细胞裂解，捕获裂解体系中的mRNA和分离出蛋白质，对捕获的mRNA进行逆转录、预扩增、cDNA纯化、Tn5转座酶打断、文库构建PCR和文库纯化以形成转录组文库并进行测序，同时对分离出的蛋白质进行变性、还原、烷基化、酶解消化以形成肽段来进行色谱分离与基于质谱技术的蛋白质组学鉴定。本发明能够实现在同一单细胞中同时对转录组和蛋白质组的深度非靶向分析，为无标记的单细胞多组学联合测定提供了新的分析工具。此外，本方法无需额外复杂定制精密器械或耗材，并可适用于市面大多数的测序仪及质谱仪器而无需改造。
-
-
-
Search Results
4
records
(took 0.019 seconds)
