公开(公告)号：CN102968575B

公开(公告)日：2016-03-02

申请号：CN201210427661.3

申请日：2012-10-31

Applicant: 东南大学

Inventor： 刘宏德 ,  谢建明 ,  孙啸

IPC: G06F19/10

Abstract: 一种基于核小体脱氧核糖核酸模版的核小体预测方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1获取待预测DNA序列，长度为T，计算待预测DNA序列弯曲度信号Signal。步骤2建立核小体DNA模版信号P，P的长度为147bp，两端区域宽为50bp，高为0.07，中间区域宽为47bp，高为0.05，卷积P和Signal得到信号S_covn，从S_covn中部取出长为T-10的信号S_covn_keep。步骤3计算S_covn_keep的连续小波变换W(a,b)，母函数为墨西哥帽函数；尺度范围为[2,8]。计算|W(a,b)|的最大值M_W(b)。M_W(b)中的峰即为核小体的二分点位置。

公开(公告)号：CN116474072A

公开(公告)日：2023-07-25

申请号：CN202310484127.4

申请日：2023-04-26

Applicant: 东南大学

Inventor： 丁佳宁 ,  刘宏德

IPC: A61K38/09 ,  A61K38/12 ,  A61K31/704 ,  A61K31/439 ,  A61P31/14

Abstract: 本发明公开了戈舍瑞林、奎奴普丁、伊达比星和/或瑞他莫林预防或治疗新型冠状病毒感染中的应用，所述药物为还包括其衍生物或含有上述药物的组合物。新型冠状病毒主蛋白酶(3CL蛋白酶)能够参与新型冠状病毒多聚蛋白的切割，对病毒的复制增殖过程起到重要作用，是新型冠状病毒的治疗靶点。该四种药物可以抑制3CL蛋白酶的活性，进而阻止新型冠状病毒的复制与病毒体合成，治疗新型冠状病毒感染。本发明通过分子对接技术在经FDA批准上市的所有小分子药物中筛选出上述四种药物，并与已经批准使用的Paxlovid有效成分Nirmatrelvir进行了对比，他们和Nirmatrelvir，与3CL蛋白酶具有相似的作用位点，间接验证其抑制作用。

公开(公告)号：CN107823643B

公开(公告)日：2019-09-10

申请号：CN201711070024.4

申请日：2017-11-03

Applicant: 东南大学

Inventor： 刘宏德 ,  罗坤

IPC: A61K45/00 ,  A61K31/44 ,  A61P25/28

Abstract: 本发明公开了鸟嘌呤核苷单磷酸还原酶1作为预防或治疗阿尔茨海默症的药物靶标的应用，所述药物为Lumacaftor或其衍生物或含有Lumacaftor的药物组合物。鸟嘌呤核苷单磷酸还原酶1(GMPR1)的水平在阿尔茨海默症患者中高于健康者，是阿尔茨海默症的治疗靶点。该Lumacaftor可以抑制GMPR1的活性，进而阻止神经元死亡，治愈阿尔茨海默症。本发明通过分子对接技术在所有已知药物中筛选出Lumacaftor，并在阿尔茨海默症模型小鼠中验证了其治疗效果。

公开(公告)号：CN111798925B

公开(公告)日：2024-04-19

申请号：CN202010600990.8

申请日：2020-06-28

Applicant: 东南大学

Inventor： 李华梅 ,  赵小粼 ,  刘宏德

IPC: G16B40/00 ,  G16B25/10 ,  G06F17/16

Abstract: 本发明涉及一种基于基因表达谱识别组织样本中细胞类型及组分的方法，包括1）获得基因表达矩阵中所有基因的特异性得分；2）利用获取得到的基因表达矩阵中所有基因的特异性得分并结合统计检验框架识别潜在的标记基因；3）利用互线性策略将识别的标记基因映射至标记基因所对应的细胞类型，并过滤掉低信度的标记基因，构建出可表征细胞类型特异性且具有最小条件数的标签矩阵；4）将加权最小二乘法纳入鲁棒线性模型，与标签矩阵相结合，构建解卷积模型，预测组织样本中的细胞组分。本发明提供了一种直接衡量基因在任意种条件下的特异性的方法，并建立了细胞类型识别算法，实现对细胞类型特异性基因的鉴定和组织样本中细胞组分的预测。

公开(公告)号：CN113160877A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110030502.9

申请日：2021-01-11

Applicant: 东南大学

Inventor： 孙啸 ,  张卓凡 ,  居胜红 ,  杨婧 ,  刘宏德

IPC: G16B15/30 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明公开了一种细胞特异性的G4‑DNA预测方法，属于基因技术领域。该方法包括以下步骤：(1)产生给定物种所有潜在的G4‑DNA序列集合；(2)收集该物种实验检测所获得的细胞特异性G4‑DNA数据；(3)计算对应细胞全基因组范围的染色质开放结构信号和甲基化分布信号；(4)建立G4‑DNA的细胞特异性染色质环境特征向量；(5)建立正负训练样本集合；(6)通过样本训练，建立细胞特异性的G4‑DNA预测分类器，其输入是潜在序列的特征向量，输出是正负样本分类结果。现有G4‑DNA预测方法只能识别体外形成的G4‑DNA或者具有体内活性的G4‑DNA，而本方法能够识别特定细胞中存在的G4‑DNA。

公开(公告)号：CN109272518B

公开(公告)日：2020-05-05

申请号：CN201810939184.6

申请日：2018-08-17

Applicant: 东南大学

Inventor： 刘宏德 ,  罗坤

IPC: G06T7/13 ,  G06T7/20 ,  G06T5/00

Abstract: 本发明公开了一种Morris水迷宫实验图像分析系统及方法，本发明主要实现三个功能：一，计算动物在四个象限中的穿越次数；二，识别动物探查方式；三，计算小鼠穿越热区图。主要通过以下步骤完成分析：图像边缘检测、圆形区域识别、目标象限识别、穿越次数计算、探查方式识别、穿越热区计算和可视化。本发明准确性高，功能齐全。