公开(公告)号：CN113913548B

公开(公告)日：2022-12-27

申请号：CN202111338138.9

申请日：2021-11-12

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 王刚 ,  孙敬贤 ,  潘俊松 ,  何欢乐 ,  蔡润 ,  陈岳 ,  高启帆

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了与黄瓜白粉病抗病和感病主效基因共分离的InDel分子标记及其应用，该InDel分子标记命名为InDel‑PHO1，由SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段组成；其中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段与抗病基因共分离，SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段与感病基因共分离。本发明的InDel分子标记具有高稳定性，可以简便、快速、高通量的应用于黄瓜苗期白粉病抗病单株的辅助筛选，为白粉病抗病性的分子标记辅助育种奠定基础，大大加快黄瓜白粉病抗病分子育种进程。

公开(公告)号：CN106811536B

公开(公告)日：2019-09-27

申请号：CN201710157376.7

申请日：2017-03-16

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 杨义 ,  何欢乐 ,  潘俊松 ,  蔡润 ,  朱文莹 ,  潘健 ,  杜慧

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及一个与ZYMV抗性基因共分离的InDel分子标记，命名为InDel‑zym1，由SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段组成；其中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段与抗性基因共分离，SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段与感病基因共分离。本发明的InDel分子标记具有高稳定性，可以简便、快速、高通量的应用于黄瓜苗期ZYMV抗性单株的辅助筛选；根据SEQ ID NO.5与SEQ ID No.6所示，由插入/缺失突变造成的抗性候选基因DNA长度的差异，还可以设计多对共显性的InDel标记作为ZYMV抗性筛选的分子标记。本发明的InDel标记为ZYMV抗性的分子标记辅助育种奠定了基础，这将大大加快黄瓜ZYMV抗性分子育种的进程。

公开(公告)号：CN105838812B

公开(公告)日：2019-09-27

申请号：CN201610341936.X

申请日：2014-08-06

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 何欢乐 ,  聂京涛 ,  蔡润 ,  潘俊松 ,  杨俊俊 ,  彭佳林

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一个与黄瓜白粉病抗性主效QTL共分离的SSR分子标记，命名为SSR‑N2。SSR‑N2的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明的SSR分子标记具有高稳定性，可以简便、快速地应用于黄瓜苗期白粉病抗性单株的辅助筛选，为白粉病抗性的分子标记辅助育种奠定了基础，这将大大加快黄瓜白粉病抗性分子育种的进程。同时，这个共分离的分子标记也为黄瓜白粉病抗性主效QTL的克隆奠定基础。

公开(公告)号：CN109234438A

公开(公告)日：2019-01-18

申请号：CN201811291457.7

申请日：2018-10-31

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 何欢乐 ,  温海帆 ,  潘俊松 ,  王刚 ,  陈岳 ,  张克岩 ,  吕铎

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q2600/13 ,  C12Q2600/156

Abstract: 本发明涉及与黄瓜无限生长型基因共分离的分子标记Indel-De3。分子标记Indel-De3具有序列表SEQ ID NO.1中的1373个核苷酸序列片段，以及序列表SEQ ID NO.2中的772个核苷酸序列片段，其中SEQ ID NO.1中的核苷酸序列与无限生长型基因共分离，SEQ ID NO.2中的核苷酸序列与有限生长型基因共分离。该分析标记由ME5所示的上游引物和EM6所示的下游引物扩增得到。ME5:5’-CCTCTCGATCCCAACACCAC-3’，EM6：5’-CAGGCAGGCAAGTTTTGGAC-3’。该分子标记Indel-De3具有高稳定性，可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜有限生长型/无限生长型类型的筛选。

公开(公告)号：CN105543219B

公开(公告)日：2018-03-13

申请号：CN201610043932.3

申请日：2016-01-22

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 蔡润 ,  王云莉 ,  潘俊松 ,  何欢乐

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明提供了两个与控制黄瓜表皮毛/果刺起始基因Tril紧密连锁的分子标记。分别命名为FlankT‑01、FlankT‑02，FlankT‑01由SEQ ID NO.1所示的290个核苷酸的片段和SEQ ID NO.2所示的293个核苷酸的片段组成。其中，SEQ ID NO.1与有表皮毛/果刺基因Tril连锁，SEQ ID NO.2与无表皮毛/果刺基因tril连锁。FlankT‑02由序列表中SEQ ID NO.3所示的187个核苷酸片段和SEQ ID NO.4所示的197个核苷酸组成。其中，SEQ ID NO.3与有表皮毛/果刺基因Tril连锁，SEQ ID NO.4与无表皮毛/果刺基因tril连锁。本发明的两个分子标记分别在Tril基因的两侧，将Tril基因定位在37.4Kb区间，且都具有较高稳定性，可以简便、快速地应用于黄瓜有无表皮毛/果刺类型的分子标记辅助育种筛选体系。

公开(公告)号：CN105543218B

公开(公告)日：2018-03-13

申请号：CN201610043923.4

申请日：2016-01-22

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 王云莉 ,  蔡润 ,  潘俊松 ,  何欢乐

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明提供了一个与控制黄瓜果刺有无基因Tril共分离的显性分子标记，命名为CoT‑01，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述CoT‑01与有果刺基因Tril连锁，无果刺基因tril不能扩增出特异性片段。本发明的分子标记和Tril基因位点共分离，对黄瓜微毛和无毛品系的区分有很大帮助；且具有高稳定性，可以在黄瓜苗期便可简便、快速地区分有无果刺表型，可应用于相关的分子标记辅助育种中。

公开(公告)号：CN107586870A

公开(公告)日：2018-01-16

申请号：CN201710861437.8

申请日：2017-09-21

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 蔡润 ,  潘俊松 ,  王刚 ,  何欢乐 ,  郭春立 ,  肖婷婷 ,  孙敬贤 ,  吕铎

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及与黄瓜果实软刺基因Ts紧密连锁的InDel分子标记，分别命名为InDel-Ts4和InDel-Ts5，分子标记InDel-Ts4具有序列表SEQ ID NO.1所示的229个核苷酸序列；分子标记InDel-Ts5具有序列表SEQ ID NO.2所示的177个核苷酸序列。分子标记InDel-Ts4由ME9所示的上游引物和EM10所示所示的下游引物组成；分子标记InDel-Ts5由ME11所示的上游引物和EM12所示的下游引物组成。此两个分子标记的特征是与软刺基因紧密连锁，以便分子标记辅助育种体系的建立。该分子标记具有高稳定性，可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜硬刺/软刺类型的筛选。

公开(公告)号：CN104152446B

公开(公告)日：2017-03-15

申请号：CN201410382306.8

申请日：2014-08-06

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 蔡润 ,  聂京涛 ,  潘俊松 ,  何欢乐 ,  杨俊俊 ,  彭佳林

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明提供了三个与黄瓜白粉病抗性主效QTL共分离的SSR分子标记，分别命名为SSR-N1、SSR-N2和SSR-N3。SSR-N1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；SSR-N2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；SSR-N3的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。本发明的三个SSR分子标记都具有高稳定性，可以简便、快速地应用于黄瓜苗期白粉病抗性单株的辅助筛选，为白粉病抗性的分子标记辅助育种奠定了基础，这将大大加快黄瓜白粉病抗性分子育种的进程。同时，这些共分离的分子标记也为黄瓜白粉病抗性主效QTL的克隆奠定基础。

公开(公告)号：CN104593517B

公开(公告)日：2016-11-02

申请号：CN201510088071.6

申请日：2015-02-26

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 蔡润 ,  潘健 ,  潘俊松 ,  何欢乐 ,  赵俊龙 ,  聂京涛 ,  郭春立 ,  曲美玲

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了两种与黄瓜表皮毛发育基因Mict紧密连锁的分子标记，一种命名为Flanking‑SNP‑01，另一种命名为Flanking‑SNP‑02。本发明中与黄瓜表皮毛发育基因Mict紧密连锁的两个分子标记对黄瓜表皮毛发育基因的最终克隆及黄瓜分子标记辅助育种体系的建立更有帮助；本发明的分子标记可以简便、快速、高通量的应用于黄瓜育种实践。

公开(公告)号：CN104152450A

公开(公告)日：2014-11-19

申请号：CN201410409203.6

申请日：2014-08-19

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 聂京涛 ,  蔡润 ,  潘俊松 ,  何欢乐 ,  曲美玲

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明提供了一个与黄瓜白粉病抗性主效基因共分离的InDel分子标记，命名为InDel-MLO1，由SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段组成；其中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段与抗病基因共分离，SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段与感病基因共分离。本发明的InDel分子标记具有高稳定性，可以简便、快速、高通量的应用于黄瓜苗期白粉病抗性单株的辅助筛选；根据SEQ ID NO.5与SEQ ID No.6所示，由插入/缺失突变造成的抗性候选基因DNA长度的差异，还可以设计多对共显性的InDel标记作为白粉病抗性筛选的分子标记。本发明的InDel标记为白粉病抗性的分子标记辅助育种奠定了基础，这将大大加快黄瓜白粉病抗性分子育种的进程。