一种猪链球菌小种分离鉴定方法

    公开(公告)号:CN107805660A

    公开(公告)日:2018-03-16

    申请号:CN201711296885.4

    申请日:2017-12-08

    Applicant: 江汉大学

    CPC classification number: C12Q1/6869 C12N1/02 C12Q2535/122

    Abstract: 本发明公开了一种猪链球菌小种分离鉴定方法,属于小种鉴定技术领域。提取样品中的微生物的总核酸并构建高通量测序文库;寻找基因组上的变异位点;通过滑动平移筛选高多态性位点,并在候选位点两侧设计多重扩增引物;利用固体培养基分离样品中的单菌落并做进一步纯化,以获得单克隆菌落;提取菌落的基因组DNA后利用上述步骤设计的引物进行扩增并测序;基于测序结果单克隆菌落进行分型,具有不同基因型的菌落作为不同的小种进行后续研究。本方法不需要预先知道样品中的小种数量以及丰度等信息,也无需传统的筛选过程中所需要生理生化鉴定试验,只需通过高通量测序和扩增即可分离培养出样品中的全部小种,过程简单、快速且流程规范。

    莱茵衣藻LRR基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用

    公开(公告)号:CN107760693A

    公开(公告)日:2018-03-06

    申请号:CN201711228404.6

    申请日:2017-11-29

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了莱茵衣藻LRR基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用,属于生物技术领域与环境污染治理领域。本发明通过将含巴龙霉素抗性基因的aphⅧ片段随机插入衣藻中得到了明显抗氯化镉的莱茵衣藻突变藻株,进一步鉴定发现突变藻株的抗镉性是由于aphⅧ片段(SEQ ID NO:3)插入到LRR基因(CDS序列如SEQ ID NO:1所示)中造成的。通过降低莱茵衣藻LRR基因的表达、使LRR基因失活或缺失LRR基因能够提高莱茵衣藻的镉耐受性;通过基因工程手段获得的镉耐受性增强的莱茵衣藻藻株可应用于镉污染水域的监控与治理中,使用镉耐受性增强的莱茵衣藻藻株来治理镉污染水环境,操作简单易行,成本低。

    莱茵衣藻相关基因的RNAi载体及其构建方法和应用

    公开(公告)号:CN104388455B

    公开(公告)日:2018-01-16

    申请号:CN201410591912.0

    申请日:2014-10-29

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种莱茵衣藻相关基因的RNAi载体及其构建方法和应用,所述RNAi载体含有一个莱茵衣藻嵌合组成型表达启动子HSP70A/RBCS2、内含子和3’UTR和潮霉素筛选标记表达框序列,莱茵衣藻嵌合组成型表达启动子HSP70A/RBCS2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,3’UTR的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,潮霉素筛选标记表达框序列的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。本发明利用PCR技术把目的基因的部分cDNA片段先构建到中间载体pEASY‑T1上,然后再通过两次酶切相继把目标基因的正向和反向片段连接到莱茵衣藻RNAi骨架载体上,简化了载体构建步骤,缩短了载体构建时间,提高了效率,同时可以直接应用到衣藻其它基因的功能研究方面。

    一种莱茵衣藻富硒突变体的筛选方法

    公开(公告)号:CN106520756A

    公开(公告)日:2017-03-22

    申请号:CN201611031014.5

    申请日:2016-11-16

    Applicant: 江汉大学

    CPC classification number: C12N15/01 C12Q1/6858 C12Q2521/301

    Abstract: 本发明公开了一种莱茵衣藻富硒突变体的筛选方法,所述筛选方法包括:根据不同SeO2浓度对莱茵衣藻生长的影响,获取合适的富硒突变体筛选浓度;获得莱茵衣藻突变体,筛选富硒突变体;鉴定筛选出的富硒突变体的突变基因。本发明提供的筛选方法,步骤简单、筛选效率高;能够快速、准确的筛选出能在高硒浓度生长的衣藻突变体;通过RESDA-PCR可以鉴定出突变基因及插入突变位点。

    一种高通量环状RNA测序的方法

    公开(公告)号:CN104388548B

    公开(公告)日:2017-01-18

    申请号:CN201410604748.2

    申请日:2014-10-31

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种高通量环状RNA测序的方法,属于分子生物学领域。该方法包括:人工合成外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA;对外源环状ERCC-0013-RNA进行质量控制;将外源线性ERCC-0004-RNA和外源环状ERCC-0013-RNA按等摩尔比混合,得到混合外源RNA;向待测序样本的总RNA中加入混合外源RNA,得到第一混合物;去除第一混合物中的核糖体RNA,得到第二混合物;对第二混合物进行3’末端生物素标记,并去除标记上生物素的套索RNA及线性RNA,得到第三混合物;去除第三混合物中的线性RNA,得到第四混合物;对第四混合物进行标准的高通量转录组测序并对测序数据进行生物学分析。本发明能够准确反映出生物体内的基因在特定条件下的表达情况,降低了的成本。

    一种棉花转基因成分的检测方法

    公开(公告)号:CN105567835A

    公开(公告)日:2016-05-11

    申请号:CN201610066274.X

    申请日:2016-01-29

    CPC classification number: C12Q1/6869 C12Q2535/122 C12Q2537/143

    Abstract: 本发明公开了一种棉花转基因成分的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括:确定转基因成分、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;进行抽样并混合,得到混合样品;提取混合样品的基因组并加入外源标准基因,得到混合核酸;构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;获得待测样品中转基因成分的测序片段的数量、内源标准基因的测序片段的数量和外源标准基因的测序片段的数量;根据外源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功并计算待测样品种中转基因成分的含量;根据转基因成分的含量判断待测样品中是否含有转基因成分。该方法能够同时定量检测待测样品中的任意多种转基因成分。

    一种白叶枯菌小种分离鉴定方法

    公开(公告)号:CN108004335B

    公开(公告)日:2021-07-02

    申请号:CN201711294441.7

    申请日:2017-12-08

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种白叶枯菌小种分离鉴定方法,属于小种鉴定技术领域。提取样品中的微生物的总核酸并构建高通量测序文库;寻找基因组上的变异位点;通过滑动平移筛选高多态性位点,并在在候选位点两侧设计多重扩增引物;利用固体培养基分离样品中的单菌落并做进一步纯化,以获得单克隆菌落;提取菌落的基因组DNA后利用上述步骤设计的引物进行扩增并测序;基于测序结果单克隆菌落进行分型,具有不同基因型的菌落作为不同的小种进行后续研究。本方法不需要预先知道样品中的小种数量以及丰度等信息,也无需传统的筛选过程中所需要生理生化鉴定试验,只需通过高通量测序和扩增即可分离培养出样品中的全部小种,过程简单、快速且流程规范。

    一种逆境诱导型启动子、逆境诱导型启动子植物表达载体及诱导目标基因表达方法

    公开(公告)号:CN107881172B

    公开(公告)日:2021-06-08

    申请号:CN201610868854.0

    申请日:2016-09-30

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明涉及一种逆境诱导型启动子序列,包含SEQ ID NO:1的1388bp的DNA核苷酸序列,属于植物基因工程技术领域。本发明还提供了一种逆境诱导型启动子植物表达载体及使植物在低温、干旱和盐诱导下表达目标基因的方法,可将目标基因替换GUS基因插入到含有本发明启动子的植物表达载体中,将该重组载体导入目标植物;SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3为PCR引物,分别包含EcoRⅠ和HindⅢ酶切位点,所述引物适用于扩增含SEQ ID NO:1的DNA序列;本发明可用于启动冷、干旱和盐胁迫下外源基因的高效表达,适用于植物遗传育种改良研究。

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