一种纤毛组装调控基因及其编码蛋白、获取方法和应用

    公开(公告)号:CN108424909B

    公开(公告)日:2021-11-30

    申请号:CN201810210290.0

    申请日:2018-03-14

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明提供了一种纤毛组装调控基因及其编码蛋白、获取方法和应用,所述基因来源于莱茵衣藻,所述基因名称为XAP5,所述基因包含如SEQ ID NO:1所示的cDNA序列;或者包含SEQ ID NO:2所示的编码蛋白质序列的多核苷酸;又或者包含与SEQ ID NO:1所限定的cDNA序列具有90%以上的同源性并且编码相同功能蛋白的核苷酸序列。本发明通过电击转化法将aphⅧ片段随机插入到衣藻中,获得了纤毛组装缺陷型突变藻株af1‑x,通过鉴定得到纤毛组装调控关键基因XAP5,构建衣藻表达载体,并导入af1‑x衣藻中,研究发现突变藻株的功能得到了互补,纤毛能够正常地进行组装。本发明XAP5基因及其编码蛋白可进一步用于纤毛的组装调控机制的研究以及纤毛相关疾病的研究和治疗等方面。

    一种猪链球菌小种分离鉴定方法

    公开(公告)号:CN107805660B

    公开(公告)日:2021-11-26

    申请号:CN201711296885.4

    申请日:2017-12-08

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种猪链球菌小种分离鉴定方法,属于小种鉴定技术领域。提取样品中的微生物的总核酸并构建高通量测序文库;寻找基因组上的变异位点;通过滑动平移筛选高多态性位点,并在在候选位点两侧设计多重扩增引物;利用固体培养基分离样品中的单菌落并做进一步纯化,以获得单克隆菌落;提取菌落的基因组DNA后利用上述步骤设计的引物进行扩增并测序;基于测序结果单克隆菌落进行分型,具有不同基因型的菌落作为不同的小种进行后续研究。本方法不需要预先知道样品中的小种数量以及丰度等信息,也无需传统的筛选过程中所需要生理生化鉴定试验,只需通过高通量测序和扩增即可分离培养出样品中的全部小种,过程简单、快速且流程规范。

    一种白叶枯菌小种分离鉴定方法

    公开(公告)号:CN108004335A

    公开(公告)日:2018-05-08

    申请号:CN201711294441.7

    申请日:2017-12-08

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种白叶枯菌小种分离鉴定方法,属于小种鉴定技术领域。提取样品中的微生物的总核酸并构建高通量测序文库;寻找基因组上的变异位点;通过滑动平移筛选高多态性位点,并在候选位点两侧设计多重扩增引物;利用固体培养基分离样品中的单菌落并做进一步纯化,以获得单克隆菌落;提取菌落的基因组DNA后利用上述步骤设计的引物进行扩增并测序;基于测序结果单克隆菌落进行分型,具有不同基因型的菌落作为不同的小种进行后续研究。本方法不需要预先知道样品中的小种数量以及丰度等信息,也无需传统的筛选过程中所需要生理生化鉴定试验,只需通过高通量测序和扩增即可分离培养出样品中的全部小种,过程简单、快速且流程规范。

    一种小麦条斑病菌小种分离鉴定方法

    公开(公告)号:CN107828904A

    公开(公告)日:2018-03-23

    申请号:CN201711295741.7

    申请日:2017-12-08

    Applicant: 江汉大学

    CPC classification number: C12Q1/689 C12Q2600/156

    Abstract: 本发明公开了一种小麦条斑病菌小种分离鉴定方法,属于小种鉴定技术领域。提取样品中的微生物的总核酸并构建高通量测序文库;寻找基因组上的变异位点;通过滑动平移筛选高多态性位点,并在候选位点两侧设计多重扩增引物;利用固体培养基分离样品中的单菌落并做进一步纯化,以获得单克隆菌落;提取菌落的基因组DNA后利用上述步骤设计的引物进行扩增并测序;基于测序结果单克隆菌落进行分型,具有不同基因型的菌落作为不同的小种进行后续研究。本方法不需要预先知道样品中的小种数量以及丰度等信息,也无需传统的筛选过程中所需要生理生化鉴定试验,只需通过高通量测序和扩增即可分离培养出样品中的全部小种,过程简单、快速且流程规范。

    莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用

    公开(公告)号:CN107760695A

    公开(公告)日:2018-03-06

    申请号:CN201711230079.7

    申请日:2017-11-29

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因在调控莱茵衣藻镉耐受性中的应用。本发明通过将含巴龙霉素抗性基因的aphⅧ片段(SEQ ID NO:3)随机插入衣藻中得到了对镉显著敏感的莱茵衣藻突变藻株,进一步鉴定发现突变藻株的镉敏感性是由于aphⅧ片段插入到Cre03.g157400.t1.2基因(CDS序列如SEQ ID NO:1所示)中造成的。通过降低莱茵衣藻Cre03.g157400.t1.2基因的表达、使该基因失活或缺失该基因能够降低莱茵衣藻的镉耐受性;通过基因工程手段获得的镉敏感型莱茵衣藻藻株可应用于镉污染水域的监控与检测中。本发明为污水的监控与检测提供了新的方向。

    一种油菜转基因成分的检测方法

    公开(公告)号:CN105624298A

    公开(公告)日:2016-06-01

    申请号:CN201610061083.4

    申请日:2016-01-29

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种油菜转基因成分的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括:确定转基因成分、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;进行抽样并混合,得到混合样品;提取混合样品的基因组并加入外源标准基因,得到混合核酸;构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;获得待测样品中转基因成分的测序片段的数量、内源标准基因的测序片段的数量和外源标准基因的测序片段的数量;根据外源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功并计算待测样品种中转基因成分的含量;根据转基因成分的含量判断待测样品中是否含有转基因成分。该方法能够同时定量检测待测样品中的任意多种转基因成分。

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