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公开(公告)号：CN105368930B
公开(公告)日：2018-11-20
申请号：CN201510660486.6
申请日：2015-10-13
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明提供了一种测序基因分型技术中测序酶切组合的确定方法，包括以下步骤：(1)对目的基因组进行限制性内切酶酶切位点预测，统计不同酶切方式获得的酶切片段数目；(2)根据步骤(1)中所预测的各种酶切方式的酶切片段设计每种酶切片段两端的接头序列及PCR扩增引物序列；(3)分别针对不同酶切方式利用GBS技术构建测序文库；(4)利用步骤(3)构建的测序文库进行测序；(5)根据测序结果获得SNP标记位点；(6)根据不同酶切组合所获得的SNP标记位点个数、酶切片段大小确定针对目的基因组的特定酶切组合。
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公开(公告)号：CN105238859B
公开(公告)日：2018-03-16
申请号：CN201510657602.9
申请日：2015-10-13
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明属于基因工程技术领域，提供了一种获取鸡全基因组高密度SNP标记位点的方法，包括以下步骤：(1)预测用EcoRI与MseI的双酶切鸡基因组所获得的酶切片段分布情况；(2)根据EcoRI与MseI的酶切片段分布特点设计通用接头、条形码接头及PCR扩增引物；(3)构建简化基因组测序文库；(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序；(5)根据测序结果获得SNP标记位点。为不同品种的鸡利用双酶切GBS构建全基因组高密度SNP图谱提供了一种通用的策略，使得获取每个SNP标记位点的成本比传统芯片技术降低一个数量级，该方法技术稳定，重复性高。
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公开(公告)号：CN119753154A
公开(公告)日：2025-04-04
申请号：CN202411234648.5
申请日：2025-03-05
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与鸡多个周龄体重相关的SNP分子标记及其应用，具体涉及与鸡两周，四周，六周，八周龄，十周龄，十二周龄多个周龄体重相关的SNP位点，该SNP位点chr1：170585684位于RCBTB1内含子区，通过测定并记录鸡杂交群体个体的多个周龄体重，利用重测序技术对1164只鸡进行测序，进行全基因组关联分析，得到了一个影响不同周龄体重的SNP位点，统计该SNP位点在重测序的其他低体重鸡种与高体重鸡种中的SNP频率，发现其在低体重鸡种和高体重鸡种中存在显著差异，高体重鸡中T为优势等位基因，低体重鸡中C为优势等位基因，在体重低的群体中，通过选择该位点等位基因T的个体，可以提高育种群体的体重。
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公开(公告)号：CN118667968A
公开(公告)日：2024-09-20
申请号：CN202410839771.3
申请日：2024-06-26
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与鸡不同周龄胫长相关的SNP分子标记及应用。本发明公开了一个与鸡6周，8周和10周龄胫长相关的SNP位点，该位点位IGF2BP1基因内含子区，基因组位置为GRCg6a 104的chr27：6079608bp处。该SNP标记存在3种基因型，T/T、C/C和T/C，其中T/T对应较高的胫长和体重。在高胫长鸡中，T为优势等位基因，通过优选该SNP位点的T/T基因型，对鸡胫长性状进行早期选择，可以加快鸡的遗传育种。
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公开(公告)号：CN118667967A
公开(公告)日：2024-09-20
申请号：CN202410839761.X
申请日：2024-06-26
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与鸡多个屠体性状相关的遗传标记及其应用。本发明公开了一个与鸡屠体重，总胃重和肝脏重相关的SNP位点，该位点位于SETDB2基因上游，基因组位置为GRCg6a版本基因组1号染色体170526425核苷酸。该SNP标记存在3种基因型，T/T、C/C和T/C，其中T/T对应较高的鸡屠体重，总胃重和肝脏重等屠体性状。在高体重鸡中，T为优势等位基因，而在低体重鸡中，C为优势等位基因，通过优选该SNP位点的T/T基因型，对鸡屠体性状进行早期选择，可以加快鸡的遗传育种。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118621026A
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202410839680.X
申请日：2024-06-26
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与鸡体重增重性状相关的SNP分子标记及其应用，具体涉及与鸡4到6周龄体增重和6到8周龄体增重相关的SNP位点，该SNP位点位于SETDB2基因上游，GRCg6a基因组版本chr1:170526091，利用重测序技术对1066只鸡进行测序，进行全基因组关联分析，得到了一个影响不同发育阶段体增重的SNP(chr1：170526091)位点，统计该SNP位点在重测序的低体重鸡种与高体重鸡种中的SNP频率，发现其在低体重鸡种和高体重鸡种中存在显著差异，高体重鸡中G为优势等位基因，低体重鸡中A为优势等位基因，在体重低的群体中，通过选择该位点等位基因G的个体，可以提高育种群体的体重。
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公开(公告)号：CN118621024A
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202410839420.2
申请日：2024-06-26
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与鸡两周龄体重性状相关的SNP标记(chr1：170514458，位于CAB39L基因上游)及其应用，通过测定并记录鸡杂交群体鸡杂交个体的两周龄体重，利用重测序技术对1176只鸡进行测序，进一步进行全基因组关联分析，得到了一个影响两周龄体重的SNP(chr1：170514458)位点，统计该SNP位点在重测序的低体重鸡种与高体重鸡种中的SNP频率，发现其在低体重鸡种和高体重鸡种中存在显著差异，高体重鸡中G为优势等位基因，低体重鸡中T为优势等位基因，在体重低的群体中，通过选择该位点等位基因G的个体，可以提高育种群体的体重。
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公开(公告)号：CN110951889B
公开(公告)日：2021-09-21
申请号：CN201811124035.0
申请日：2018-09-26
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与鸡体重性状相关的单倍型分子标记及应用。所述单倍型分子标记由SNP1～SNP6共6个SNP位点组成，所述6个SNP位点位于鸡1号染色体末端169.195～169.209Mb范围内。本发明的单倍型分子标记用于区别高体重鸡个体和低体重鸡个体，当6个SNP按基因组顺序组成G、C、C、C、C、G纯合单倍型时，对应的鸡具有高体重性状。本发明检测单倍型分子标记的方法适用于中外鸡种鉴定，适用鸡种范围广。本方法能够早期、快速、低成本、有效地预测鸡体重性状，为鸡分子标记辅助选择育种提供了有效手段，在鸡种改良方面具有广阔的应用前景，并能够取得优异的经济价值。
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公开(公告)号：CN105631242B
公开(公告)日：2018-09-11
申请号：CN201510994122.1
申请日：2015-12-25
Applicant: 中国农业大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明提供了一种利用全基因组测序数据快速鉴定转基因事件的方法，该方法结合生物信息学分析手段鉴定转基因事，能快速有效的鉴定出外源片段插入到基因组的位置、方向、拷贝数、侧翼序列信息，以及转基因样本的纯合与杂合状态。与传统的Genome walking、实时定量PCR等实验方法相比，具有时间短、可重复性高、结果稳定且更容易解释等优势，是目前检测转基因事件方法中最全面的，可以在短时间内准确的分析出转基因事件对生物体的影响，对转基因动植物进行安全评价，推动转基因技术在农业上的应用。
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公开(公告)号：CN119753167A
公开(公告)日：2025-04-04
申请号：CN202510027873.X
申请日：2025-01-08
Applicant: 中国农业大学 , 中国科学院遗传与发育生物学研究所
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一个与鸡8周龄体重相关的SNP分子标记及其应用，属于分子生物学领域，该SNP位点在基因组的位置为3号染色体第10,617,483位核苷酸，SNP名为rs315282035。GWAS结果显示该SNP位点呈现G/A多态性，G对鸡8周龄的体重具有正向效应。对于这个位点，在其他高体重、低体重鸡群体中进行了基因型统计分析，GG基因型在高体重鸡的优势基因型。因此，可以优选该位点为GG基因型的鸡，有望进行高体重鸡的早期选择，从而加快鸡的遗传育种。
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