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公开(公告)号:CN107586869A
公开(公告)日:2018-01-16
申请号:CN201710860785.3
申请日:2017-09-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及与黄瓜果实软刺基因Ts共分离的InDel-Ts3分子标记及其应用。该分子标记由ME7所示的上游引物和EM8所示的下游引物组成。该分子标记具有序列表SEQ ID NO.1所示的244个核苷酸序列,以及序列表SEQ ID NO.2所示的234个核苷酸序列,其中SEQ ID NO.1中的核苷酸序列与软刺基因共分离,SEQ ID NO.2中的核苷酸序列与硬刺基因共分离。与现有技术相比,该分子标记具有高稳定性,可以简便、快速、高通量地应用于世界各地黄瓜硬刺/软刺类型的筛选。
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公开(公告)号:CN106811536A
公开(公告)日:2017-06-09
申请号:CN201710157376.7
申请日:2017-03-16
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一个与ZYMV抗性基因共分离的InDel分子标记,命名为InDel‑zym1,由SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段组成;其中SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列片段与抗性基因共分离,SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列片段与感病基因共分离。本发明的InDel分子标记具有高稳定性,可以简便、快速、高通量的应用于黄瓜苗期ZYMV抗性单株的辅助筛选;根据SEQ ID NO.5与SEQ ID No.6所示,由插入/缺失突变造成的抗性候选基因DNA长度的差异,还可以设计多对共显性的InDel标记作为ZYMV抗性筛选的分子标记。本发明的InDel标记为ZYMV抗性的分子标记辅助育种奠定了基础,这将大大加快黄瓜ZYMV抗性分子育种的进程。
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公开(公告)号:CN105543219A
公开(公告)日:2016-05-04
申请号:CN201610043932.3
申请日:2016-01-22
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13
Abstract: 本发明提供了两个与控制黄瓜表皮毛/果刺起始基因Tril紧密连锁的分子标记。分别命名为FlankT-01、FlankT-02,FlankT-01由SEQ ID NO.1所示的290个核苷酸的片段和SEQ ID NO.2所示的293个核苷酸的片段组成。其中,SEQ ID NO.1与有表皮毛/果刺基因Tril连锁,SEQ ID NO.2与无表皮毛/果刺基因tril连锁。FlankT-02由序列表中SEQ ID NO.3所示的187个核苷酸片段和SEQ ID NO.4所示的197个核苷酸组成。其中,SEQ ID NO.3与有表皮毛/果刺基因Tril连锁,SEQ ID NO.4与无表皮毛/果刺基因tril连锁。本发明的两个分子标记分别在Tril基因的两侧,将Tril基因定位在37.4Kb区间,且都具有较高稳定性,可以简便、快速地应用于黄瓜有无表皮毛/果刺类型的分子标记辅助育种筛选体系。
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公开(公告)号:CN104593518A
公开(公告)日:2015-05-06
申请号:CN201510088116.X
申请日:2015-02-26
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明提供了三种与黄瓜表皮毛发育基因Mict共分离的分子标记,第一种命名为Cosegregated-SNP-01,第二种命名为Cosegregated-SNP-02,第三种命名为Cosegregated-SNP-03。本发明中与黄瓜表皮毛发育基因Mict共分离的三个分子标记对黄瓜表皮毛发育基因的最终克隆及黄瓜分子标记辅助育种体系的建立更有帮助;本发明的分子标记可以简便、快速、高通量的应用于黄瓜育种实践。
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公开(公告)号:CN102925435B
公开(公告)日:2014-08-20
申请号:CN201210382890.8
申请日:2012-10-10
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12N15/11
Abstract: 两个与黄瓜果瘤基因Tu紧密连锁的分子标记,第一个命名为Y32,由SEQ ID NO.1所示的DNA片段和SEQ ID NO.2所示的DNA片段组成;其中SEQ ID NO.1所示的DNA片段与果瘤基因Tu连锁,SEQ ID NO.2所示的DNA片段与无瘤基因tu连锁。第二个命名为Y46,由SEQ ID NO.3所示的DNA片段和SEQ ID NO.4所示的DNA片段组成;其中SEQ ID NO.3所示的DNA片段与果瘤基因Tu连锁,SEQ ID NO.4所示的DNA片段与无瘤基因tu连锁。本发明的两个分子标记Y32和Y46与已经公开的SCAR标记C_SC69和SSR标记16203相比,与Tu基因位点的连锁更加紧密,已经将Tu基因定位在50Kb区间,对关于有瘤/无瘤的黄瓜分子标记辅助育种体系的建立更有帮助。
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公开(公告)号:CN103173463A
公开(公告)日:2013-06-26
申请号:CN201310086923.9
申请日:2013-03-18
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12N15/84 , A01H5/00
Abstract: 本发明提供了一种黄瓜乙烯信号转导途径CTR1基因,命名为CsCTR1,其DNA序列如SEQID NO.1所示。其编码的蛋白的氨基酸残基序列如SEQID NO.2所示。CsCTR1开放阅读框2559bp,编码852个氨基酸。将其插入表达载体,得到一个过量表达载体。用该表达载体转化拟南芥CTR1突变株进行功能互补,得到CsCTR1转基因纯株系。本发明不仅为研究黄瓜乙烯信号转导途径CTR1的转录和表达奠定了基础,同时也为功能性研究CTR1在乙烯调控黄瓜生长发育过程中的作用提供了基础。
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公开(公告)号:CN103098714A
公开(公告)日:2013-05-15
申请号:CN201310064149.1
申请日:2013-02-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: A01H4/00
Abstract: 一种提高黄瓜子叶节离体再生及转化率的方法,包括以下步骤:(1)选择两片子叶刚脱离种壳的黄瓜子叶节为外置体;(2)在黄瓜子叶节基部轻轻划上伤口;(3)将黄瓜子叶节接到芽诱导培养基中培养;(4)经过芽诱导、伸长、生根,最后获得完整植株。本发明的方法提供了提高黄瓜子叶节再生及转化效率的最佳苗态和芽诱导培养基,优化了黄瓜S52的子叶节再生体系,方法简单、易操作;同时培养出来的不定芽数目多、质量好、健壮、玻璃化低,再生率高,再生周期短。为黄瓜遗传转化和分子改良提供了坚实的技术支撑,对利用现代基因工程技术创新黄瓜种质和新品种将具有重要的现实意义。
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公开(公告)号:CN102140457B
公开(公告)日:2012-08-22
申请号:CN201110044264.3
申请日:2009-05-14
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12N15/11
Abstract: 本发明涉及基因工程技术领域的与黄瓜单性花控制基因M紧密连锁的分子标记,第一种分子标记由序列表中SEQ ID NO.1所示的223个核苷酸和SEQ ID NO.2所示的221个核苷酸组成;第二种分子标记由序列表中SEQ ID NO.3所示的155个核苷酸和SEQ ID NO.4所示的157个核苷酸组成;第三种分子标记由序列表中SEQ ID NO.5所示的110个核苷酸和SEQ IDNO.6所示的108个核苷酸组成。本发明的3个分子标记与M基因位点连锁更加紧密,对关于单性花/两性花的黄瓜分子标记辅助育种体系的建立更有帮助;本发明的分子标记可以简便、快速、高通量地应用于黄瓜育种实践。
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公开(公告)号:CN101591708A
公开(公告)日:2009-12-02
申请号:CN200910052887.8
申请日:2009-06-11
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及植物基因工程技术领域的黄瓜SNP标记及其检测方法,具体为:鉴定黄瓜SNP位点的方法:选取纯合黄瓜亲本,测序,确定候选SNP位点;杂交获得F1代单株,测序;检测F1代测序结果的峰型图,确定出现杂合峰的候选位点。在黄瓜F2代分离群体中确定SNP标记的多态性单株的方法:选取纯合黄瓜亲本,得到F2代分离群体;选取F2代中隐性表型单株,等量混合其DNA,构建隐性基因池;利用SNP引物进行扩增并测序,检测测序结果的峰型图;对隐性基因池单株分别利用SNP引物进行扩增并测序,检测测序结果的峰型图。一种黄瓜SNP标记,具有SEQ ID NO:1所示的序列。本发明缩短了SNP标记的开发和验证时间,减少了标记的检测成本。
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公开(公告)号:CN101580876A
公开(公告)日:2009-11-18
申请号:CN200910053311.3
申请日:2009-06-18
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及基因工程技术领域的与黄瓜单性花基因M共分离的分子标记。第一种与黄瓜单性花基因M共分离的分子标记,具有SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示序列;第二种与黄瓜单性花基因M共分离的分子标记,具有SEQ ID NO:3所示序列。本发明第一次将基因组DNA序列与M基因建立起联系,因而对关于单性花/两性花的黄瓜分子标记辅助育种体系的建立更有帮助;本发明的分子标记可以简便、快速、高通量地应用于黄瓜育种实践。
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