一种粪便微生物耐药性基因的检测方法

    公开(公告)号:CN105586415A

    公开(公告)日:2016-05-18

    申请号:CN201610060946.6

    申请日:2016-01-29

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种粪便微生物耐药性基因的检测方法。所述方法包括:确定耐药性基因、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;向待测样品中加入外源核酸,得到混合样品并提取基因组;向基因组中加入外源标准基因,获得混合核酸;扩增混合核酸,利用扩增产物构建高通量测序文库并进行高通量测序,得到测序片段组;分析所述测序片段组,并根据获得的外源标准基因和内源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功;若实验成功,则计算耐药性基因的含量;根据耐药性基因的含量判定待测样品是否含有耐药性基因。所述方法可以一次性定量检测任意微生物中的任意多种希望检测的耐药性基因,且检测不需要培养与纯化微生物,速度快,结果准确可靠。

    一种水稻微生物耐药性基因的检测方法

    公开(公告)号:CN105586414A

    公开(公告)日:2016-05-18

    申请号:CN201610060910.8

    申请日:2016-01-29

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种水稻微生物耐药性基因的检测方法。所述方法包括:确定耐药性基因、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;向待测样品中加入外源核酸,得到混合样品并提取基因组;向基因组中加入外源标准基因,获得混合核酸;扩增混合核酸,利用扩增产物构建高通量测序文库并进行高通量测序,得到测序片段组;分析所述测序片段组,并根据获得的外源标准基因和内源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功;若实验成功,则计算耐药性基因的含量;根据耐药性基因的含量判定待测样品是否含有耐药性基因。所述方法可以一次性定量检测任意微生物中的任意多种希望检测的耐药性基因,且检测不需要培养与纯化微生物,速度快,结果准确可靠。

    一种微生物耐药性基因的检测方法

    公开(公告)号:CN105567832A

    公开(公告)日:2016-05-11

    申请号:CN201610061081.5

    申请日:2016-01-29

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 彭海

    Abstract: 本发明公开了一种微生物耐药性基因的检测方法。所述方法包括:确定耐药性基因、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;向待测样品中加入外源核酸,得到混合样品并提取基因组;向基因组中加入外源标准基因,获得混合核酸;扩增混合核酸,利用扩增产物构建高通量测序文库并进行高通量测序,得到测序片段组;分析所述测序片段组,并根据获得的外源标准基因和内源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功;若实验成功,则计算耐药性基因的含量;根据耐药性基因的含量判定待测样品是否含有耐药性基因。所述方法可以一次性定量检测任意微生物中的任意多种希望检测的耐药性基因,且检测不需要培养与纯化微生物,速度快,结果准确可靠。

    一种利用miRNA1430基因预报水稻白叶枯病的方法

    公开(公告)号:CN104141004B

    公开(公告)日:2016-03-09

    申请号:CN201410309693.2

    申请日:2014-06-30

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 王沁 张继 彭海

    Abstract: 本发明公开了一种利用miRNA1430基因预报水稻白叶枯病的方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:选取待测水稻和对照水稻,选取的所述对照水稻为未感染白叶枯病但与待测水稻在相同条件下栽培的水稻;分别分离所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因;分别检测所述待测水稻和所述对照水稻中的总miRNA基因中的miRNA1430基因的表达量,所述miRNA1430基因的序列如序列表中SEQ ID NO:1所示;根据所述待测水稻和所述对照水稻中的miRNA1430基因的表达量,判断实验是否成功,若成功,进一步判定所述待测植株是否感染白叶枯病。本发明提供的预测方法获得了成功,可以在水稻白叶枯病症出现前数天实现准确预报,为早防早治赢得了时间,减少了白叶枯病对水稻造成的损失。

    一种植物亲本来源真实性及其比例测试新方法

    公开(公告)号:CN104805196A

    公开(公告)日:2015-07-29

    申请号:CN201510162770.0

    申请日:2015-04-08

    Abstract: 本发明公开了一种植物亲本来源真实性及其比例测试新方法,属于生物技术领域。所述方法包括:获得不同植物品种间的变异位点;根据所述变异位点确定测试区域;提取抽样样本的DNA;制备测试区域PCR引物;构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,获得测序片段组;分析测序片段组,获得待测品种基因型和亲本基因型;根据待测品种基因型和亲本基因型,判断待测品种的亲本来源的真实性并计算亲本来源的比例。所述方法能够准确、快速且简单地判断亲本来源真实性及其比例。

    一种测试水稻品种实质性派生关系的方法

    公开(公告)号:CN104805193A

    公开(公告)日:2015-07-29

    申请号:CN201510150611.9

    申请日:2015-03-31

    Abstract: 本发明公开了一种测试水稻品种实质性派生关系的方法。该方法包括:获得变异位点;确定测试区域;抽样提取并获得抽样样本的DNA;制备引物;利用所述引物分别对两个抽样样本的DNA进行扩增,分别得到两个待测水稻品种在测试区域的扩增产物用于构建两个待测水稻品种的高通量测序文库;对两个高通量测序文库分别进行高通量测序,分别得到两个所述待测水稻品种的测序片段组;分析两个测序片段组,分别获得两个待测水稻品种基因型;比较两个待测水稻品种基因型,获得待测水稻品种间差异基因型的比例;根据待测水稻品种间差异基因型的比例,判断两个待测水稻品种的实质性派生关系。该方法能够准确、快速且简单地判断待测水稻品种间的实质性派生关系。

    一种测试油菜品种实质性派生关系的方法

    公开(公告)号:CN104805192A

    公开(公告)日:2015-07-29

    申请号:CN201510150605.3

    申请日:2015-03-31

    Abstract: 本发明公开了一种测试油菜品种实质性派生关系的方法。该方法包括:利用所述引物分别对两个抽样样本的DNA进行扩增,分别得到两个待测油菜品种在测试区域的扩增产物用于构建两个待测油菜品种的高通量测序文库;对两个高通量测序文库分别进行高通量测序,分别得到两个所述待测油菜品种的测序片段组;分析两个测序片段组,分别获得两个待测油菜品种基因型;比较两个待测油菜品种基因型,获得待测油菜品种间差异基因型的比例;根据待测油菜品种间差异基因型的比例,判断两个待测油菜品种的实质性派生关系。该方法能够准确、快速且简单地判断待测油菜品种间的实质性派生关系。

    一种测定杂交玉米新品种的特异性、一致性与稳定性的方法

    公开(公告)号:CN104805190A

    公开(公告)日:2015-07-29

    申请号:CN201510150506.5

    申请日:2015-03-31

    Abstract: 本发明公开了一种测定杂交玉米新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。所述方法包括:获得变异位点;确定待测玉米品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测玉米品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测玉米品种特异性、一致性和稳定性。所述方法能够准确、完整地判断待测玉米品种的特异性、稳定性与一致性,且测试速度更快。

    一种测定杂交水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法

    公开(公告)号:CN104805182A

    公开(公告)日:2015-07-29

    申请号:CN201510148540.9

    申请日:2015-03-31

    CPC classification number: C12Q1/6895 C12Q1/6869 C12Q2600/156 C12Q2539/113

    Abstract: 本发明公开了一种测定杂交水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。所述方法包括:获得变异位点;确定待测水稻品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测水稻品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测水稻品种特异性、一致性和稳定性。所述方法能够准确、完整地判断待测水稻品种的特异性、稳定性与一致性,且测试速度更快。

    莱茵衣藻相关基因的RNAi载体及其构建方法和应用

    公开(公告)号:CN104388455A

    公开(公告)日:2015-03-04

    申请号:CN201410591912.0

    申请日:2014-10-29

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种莱茵衣藻相关基因的RNAi载体及其构建方法和应用,所述RNAi载体含有一个莱茵衣藻嵌合组成型表达启动子HSP70A/RBCS2、内含子和3’UTR和潮霉素筛选标记表达框序列,莱茵衣藻嵌合组成型表达启动子HSP70A/RBCS2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,3’UTR的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,潮霉素筛选标记表达框序列的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。本发明利用PCR技术把目的基因的部分cDNA片段先构建到中间载体pEASY-T1上,然后再通过两次酶切相继把目标基因的正向和反向片段连接到莱茵衣藻RNAi骨架载体上,简化了载体构建步骤,缩短了载体构建时间,提高了效率,同时可以直接应用到衣藻其它基因的功能研究方面。

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