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公开(公告)号：CN104751016B
公开(公告)日：2018-03-27
申请号：CN201510181373.8
申请日：2015-04-16
Applicant: 大连大学
IPC: G06F19/22 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及DNA标签的构造方法，具体讲是涉及一种基于变邻域搜索的DNA标签的构造方法，其首先生成全部的DNA标签，然后根据部分约束条件去除部分不满足要求的DNA标签，构造出DNA标签全部解空间。接着利用DNA标签间的最大编辑距离之和来构造初始邻域解空间，然后根据该局部DNA标签集合，得到剩余DNA标签解空间。在剩余解空间中，同样的依据最大距离之和构造下一个邻域，找出该邻域内的DNA标签集合，与之前的DNA标签集合合并，再利用排除算法消除部分不符合要求的解。以此类推，直到搜索完全部解空间，合并每个邻域生成的DNA标签集合，最终构造出的完整的DNA标签集合。该方法在确保局部最优解准确性的同时，提高了计算的效率。
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公开(公告)号：CN107679364A
公开(公告)日：2018-02-09
申请号：CN201710873093.2
申请日：2017-09-25
Applicant: 大连大学
IPC: G06F19/16
CPC classification number: G06F19/16
Abstract: 本发明涉及蛋白质结构预测领域，设计了一种基于改进随机分形搜索算法（ISFS）的蛋白质结构预测方法。该方法将随机分形搜索算法引入蛋白质结构预测中，并对其中的扩散过程和更新过程进行改进。在扩散过程中，利用Levy飞行来替代高斯分布，加强全局搜索能力；在更新过程中，引入反馈信息，使搜索跳出局部最优。与随机分形搜索算法（SFS）相比，提出的方法在解决各种非线性函数方面（如蛋白质结构预测问题）具有较高的性能。从实验得出的数据和与其他方法的比较结果来看，该方法可以更加全面的搜索出相应的蛋白质最小自由能量值，从而能得到更稳定的蛋白质结构。
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公开(公告)号：CN104766350B
公开(公告)日：2017-12-22
申请号：CN201510179120.7
申请日：2015-04-16
Applicant: 大连大学
IPC: G06T9/00
Abstract: 本发明设计了一种基于剪接模型和超混沌系统的图像加密方法，涉及图像加密领域。其将混沌系统以及DNA计算中的剪接模型引入到图像的加密过程中。首先利用十进制转换成四进制的方式将一个像素值分解为四个0到3之间的整数，然后利用碱基A,G,C,T对得到的四个整数分别进行编码，这样一个原始灰度图像就可以被拆分成四个部分，可以对这四个部分分别进行操作；除此之外，该方法充分利用剪接模型的基本思想形成剪接操作，然后将剪接操作应用于置乱图像的像素值中。模拟结果和安全分析表明，该方法不仅具有较大的密钥空间，高度的敏感性，而且还能抵抗穷举攻击，统计攻击以及差分攻击等，具有良好的加密效果。
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公开(公告)号：CN114067916B
公开(公告)日：2025-02-11
申请号：CN202111299658.3
申请日：2021-11-04
Applicant: 大连大学
Abstract: 本发明公开了基于权重和混合突变策略的藤壶算法的DNA存储编码优化方法，其具体为：构建满足约束条件的最优DNA编码序列，首先要构建出一定数量的DNA序列作为初始集合，对初始集合中DNA序列的适应度进行评价排序。其次，利用已经得到的初始集合，用基于权重和混合突变策略的藤壶算法进行不断地迭代搜索和优化，得到适应度较高的DNA序列。然后，判断DNA序列是否满足约束条件，如果满足则加入DNA编码集合。最后，输出最优DNA编码集合。该方法可以搜索出数量较优的DNA编码集合。
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公开(公告)号：CN118782143A
公开(公告)日：2024-10-15
申请号：CN202410768990.7
申请日：2024-06-14
Applicant: 大连大学
IPC: G16B30/00 , G06F18/22 , G06F18/23213
Abstract: 本发明公开了基于非冗余德布鲁因图的DNA存储数据重建方法及系统，涉及DNA存储技术领域；包括将莱文斯坦距离小于等于设定阈值的DNA序列划分到同一个聚类子图；将DNA序列之间具有最小莱文斯坦距离的节点连边，度数最大的节点代表该聚类子图中的骨干序列；将骨干序列作为测序数据对齐的模板序列，构造束搜索图；根据束搜索算法进行错误纠正和筛选最佳优选路径，得到共识序列；构造非冗余德布鲁因图；删除权值低于设定阈值的边所连接的节点；根据非冗余德布鲁因图中节点信息以及共识序列进行路径选择；路径选择后的序列即为重建后的序列。本发明能够在保持数据完整性的同时，尽可能减小对存储密度的影响，从而实现更为高效和可靠的DNA数据存储。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118101850A
公开(公告)日：2024-05-28
申请号：CN202410351016.0
申请日：2024-03-26
Applicant: 大连大学
Abstract: 本发明公开了一种基于彩色交通图像的视觉安全加密方法及系统，涉及压缩感知、图像加密和视觉安全技术领域；其将要加密的彩色交通图像进行DWT稀疏化处理，随后对稀疏化后的彩色交通图像进行三维螺旋置乱，然后对改进的二维Logistic混沌系统产生的测量矩阵进行SVD分解与列向量单位化的方式进行优化，随后对置乱后的图像进行压缩测量并由此得到压缩图像，最后对载体图像进行IWT分解，将压缩图像嵌入载体图像最低有效位中。解密过程即为加密过程的逆过程。本发明具有良好的视觉安全性，加密图像的视觉质量均在42dB以上，且可以抵抗各种常见攻击，在交通图像的安全传输与存储中具有很高的实用价值。
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公开(公告)号：CN112331258B
公开(公告)日：2024-02-23
申请号：CN202011235712.3
申请日：2020-11-06
Applicant: 大连大学
Abstract: 本发明公开了一种基于DNA笼状结构的人工神经元计算模型构建方法，包括：构造带有rA修饰的笼状结构、将笼状结构作为人工神经元模型的输入层，采用E6 DNAzyme作为神经元的权重；构建归一化模块，利用E6 DNAzyme Z1、Z2、Z3作为神经元的权重；利用E6 DNAzyme酶切带rA修饰的笼状结构构造归一化模块，酶切反应产生的不同输出作为归一化反应的输入，通过归一化反应实现加权和过程；通过链置换的可逆反应和链置换的反应速率构造线性阈值处理模块，即神经元的阈值函数；连接归一化模块和阈值处理模块，使归一化输出优先与“Threshold门”反应，反应完之后再与“Output门”反应，最终产生真正的输出，即最后连接各个模块构成人工神经元模型。
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公开(公告)号：CN116486923A
公开(公告)日：2023-07-25
申请号：CN202310549371.4
申请日：2023-05-16
Applicant: 大连大学
IPC: G16B40/30 , G16B50/30 , G06F18/23 , G06F16/901
Abstract: 本发明公开了一种动态更新哈希索引的DNA存储聚类方法，包括在初始序列三个位置选取DNA片段，并将这三个DNA片段通过计算哈希码方式转化为对应的哈希值，再映射到三个哈希表中。在后续待聚类的序列中，同样在这三个位置选取DNA片段，分别计算哈希码并进行冲突检测，进而判断是否属于同一个簇；当簇中序列数量达到5条时，对核心索引集进行一次更新，以避免错误的索引导致序列错误分流。本发明动态更新哈希索引的DNA存储聚类方法，因为索引的及时更新使得簇内序列的相似性得到显著提高，避免错误的索引导致的序列被错误分流。这种方法的优点在于提高了聚类的准确性和可靠性，为大规模的DNA数据存储和提供了良好的支持。
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公开(公告)号：CN111339635B
公开(公告)日：2023-06-30
申请号：CN202010051588.9
申请日：2020-01-17
Applicant: 大连大学
IPC: G06F30/20 , G06N3/006 , G06F111/04
Abstract: 本发明公开了基于阻尼因子的多元宇宙算法的DNA存储编码优化方法，其具体为：构造满足组合约束条件的最优DNA编码序列，首先要构造出一定个数的DNA序列作为初始种群，对种群的适应度进行评价排序。其次，利用已经得出的DNA编码序列，用含有阻尼因子的更新公式和Lévy飞行搜索进行优化，得到适应度较高的DNA存储编码序列。然后，通过约束比对根据约束判断是否加入备选解集合。最后，输出最优DNA存储编码序列。该方法可以搜索出数量较优的DNA存储编码序列。
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公开(公告)号：CN114023392A
公开(公告)日：2022-02-08
申请号：CN202111301348.0
申请日：2021-11-04
Applicant: 大连大学
Abstract: 本发明公开了一种DNA存储的码字设计方法，其具体为：将存储信息转换为DNA序列，首先要将信息转换为二进制数据。其次，构建最小方差霍夫曼树，利用它对二进制数据进行压缩。然后，将压缩后的二进制数据以4位为一组进行不重叠分块，得到至多16种组合，根据组合的概率依次从字典中选择码字进行映射，得到DNA序列。最后，求得DNA序列的GC含量，如果GC含量高于60％或者低于40％，会对映射关系进行调整，使得它在40％到60％之间；再进一步检查DNA序列中是否含有均聚物超过3的情况，如果存在就进行替换修改。本发明不仅具有高的编码率和结构简单的特点，而且编码完成的DNA序列还满足GC含量在40％到60％之间和均聚物运行长度不超过3的约束条件。
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