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公开(公告)号：CN108763868A
公开(公告)日：2018-11-06
申请号：CN201810305435.5
申请日：2018-04-08
Applicant: 中南大学
IPC: G06F19/22
Abstract: 本发明提供一种DNA序列中重复区的识别方法和识别装置，其中方法包括：对构造的n‑item序列，在DNA序列中识别所述n‑item序列的出现次数；将出现次数大于预设阈值的n‑item序列作为重复区，并构造所有作为重复区的n‑item序列的n‑item序列集合；若所述n‑item序列集合中n‑item序列的个数不唯一，则根据预设规则对所述n‑item序列集合中两两之间的n‑item序列构造(n+1)‑item序列。本发明实施例只需要对构造出的DNA子序列进行识别，识别对象相比现有技术大大降低，其次获得重复区的过程也可以在识别过程中通过统计出现次数获得，识别效率得到了进一步提高，再通过预设规则从重复区中构造更长的DNA子序列，不需要将重复区先与单个碱基组合再逐个遍历整个DNA序列，能够大大提高基因组重复区的识别效率。
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