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公开(公告)号：CN119724342A
公开(公告)日：2025-03-28
申请号：CN202411792332.8
申请日：2024-12-06
Applicant: 北京擎科生物科技股份有限公司
Abstract: 本申请提供一种基于人工智能对糖基转移酶进行分子改造方法，包括：获取酶突变体的描述信息以形成基础数据集；对基础数据集进行理化性质分析，得到分析结果集；计算突变位点的保守程度量化值和不同突变对序列的影响程度量化值，以构建位置特异性打分矩阵；从打分矩阵中提取位置特异性打分值与频数，确定功能区段，并进行加权处理；基于突变体的三维结构重建模型，进行三维结构预测和能量计算，得到能量值；计算突变体与野生型之间的能量变化值；对突变体蛋白进行分子对接和动力学模拟分析，得到相互作用模式和强度的量化描述以及动力学模拟特征数据；构建模型训练集以训练预测突变体酶活的变化的机器学习模型。
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公开(公告)号：CN119649907A
公开(公告)日：2025-03-18
申请号：CN202411576081.X
申请日：2024-11-06
Applicant: 北京擎科生物科技股份有限公司
Abstract: 本申请提供一种基于人工智能的酶改造方法，包括：对AlphaFold2模型进行训练得到糖基转移酶三级结构预测模型；基于活性点位识别模型，对蛋白质和核酸序列数据库和非冗余蛋白质特征序列数据库进行多序列比对，得到比对结果；初始化一个与比对结果长度相等的矩阵，以构建PSSM矩阵以及筛选出潜在突变位点；根据筛选出的潜在突变位点，构建初始突变库以形成虚拟筛选突变库；基于糖基转移酶三级结构预测模型对虚拟筛选突变库中的序列进行结构重建，以预测糖基转移酶三级结构并对其进行分子对接和动力学模拟，以分析蛋白与配体的结合口袋以及确定其中氨基酸残基与配体的动态相互作用、每个氨基酸残基与配体的接触数量以对糖基转移酶三级结构进行改造。
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