公开(公告)号：CN114187969A

公开(公告)日：2022-03-15

申请号：CN202111392177.7

申请日：2021-11-19

Applicant: 厦门大学

Inventor： 胡桓 ,  卢雨儿 ,  陈玲玲 ,  程烽 ,  帅建伟

IPC: G16B40/00 ,  G06N3/04

Abstract: 本发明公开了一种处理单细胞多模态组学数据的深度学习方法及系统，包括：对多组学测序中捕获的转录组数据和蛋白质数据进行归一化处理；对归一化处理后的转录组数据进行降维；采用第一编码器对降维后的转录组数据进行特征提取；采用第一解码器还原降维后的单细胞转录组数据；对解码后的转录组数据进行升维；采用第二编码器对归一化处理后的蛋白质数据进行特征提取；采用第二解码器还原蛋白质数据；多模态组学数据整合，采用混合编码器混合编码后的转录组信息和蛋白质信息；采用混合解码器还原转录组特征信息和蛋白质特征信息。本发明从多组学的角度来捕获和表征细胞异质性，从而能对多种模式的数据进行综合分析。

公开(公告)号：CN114187969B

公开(公告)日：2024-08-02

申请号：CN202111392177.7

申请日：2021-11-19

Applicant: 厦门大学

Inventor： 胡桓 ,  卢雨儿 ,  陈玲玲 ,  程烽 ,  帅建伟

IPC: G16B40/00 ,  G06N3/0455

Abstract: 本发明公开了一种处理单细胞多模态组学数据的深度学习方法及系统，包括：对多组学测序中捕获的转录组数据和蛋白质数据进行归一化处理；对归一化处理后的转录组数据进行降维；采用第一编码器对降维后的转录组数据进行特征提取；采用第一解码器还原降维后的单细胞转录组数据；对解码后的转录组数据进行升维；采用第二编码器对归一化处理后的蛋白质数据进行特征提取；采用第二解码器还原蛋白质数据；多模态组学数据整合，采用混合编码器混合编码后的转录组信息和蛋白质信息；采用混合解码器还原转录组特征信息和蛋白质特征信息。本发明从多组学的角度来捕获和表征细胞异质性，从而能对多种模式的数据进行综合分析。