公开(公告)号：CN116732143A

公开(公告)日：2023-09-12

申请号：CN202310675495.7

申请日：2017-11-08

Applicant: 哈佛学院院长及董事

Inventor： 庄小威 ,  J·R·莫菲特 ,  J·G·郝 ,  陆天

IPC: C12Q1/6841 ,  G16B25/00

Abstract: 本发明一般性涉及用于成像或测定例如细胞或组织内的核酸或其他所需靶标的系统和方法。在一个方面，将样品暴露于在样品中测定的多个核酸探针。但是，在一些情况下，背景荧光或脱靶结合可能使测定适当结合的核酸探针更加困难。因此，可以从样品中“清除”可能造成背景的样品的其他组分例如蛋白质、脂质和/或其他非靶标，以改善测定。然而，在某些实施方案中，可以例如使用样品中的聚合物或凝胶防止核酸或其他所需靶标也被清除。其他方面通常涉及包括此类系统的组合物或试剂盒，使用此类系统的方法等。

公开(公告)号：CN119433097A

公开(公告)日：2025-02-14

申请号：CN202411644725.4

申请日：2020-04-17

Applicant: 哈佛学院院长及董事

Inventor： 庄小威 ,  王翀 ,  陆天

IPC: C12Q1/6897 ,  C12Q1/6816 ,  C12N9/22 ,  C12N15/10 ,  C12N15/113 ,  G01N21/64

Abstract: 本发明涉及对细胞成像，用于确定细胞群体的表型和/或基因型或构建用于高通量筛选的基因型‑表型对应关系。可以使用CRISPR或其他技术操作细胞。核酸可使用慢病毒引入至细胞中。所述核酸可以含有：包含DNA或RNA识别序列的向导部分、报告基因部分和包含一个或多个读取序列的标识部分。所述向导部分可以用来改变细胞的表型，例如使用可以用CRISPR或其他技术靶向的序列，例如sgRNA序列，并且细胞的表型可以使用各种成像方式确定。所述标识部分可以使用MERFISH或其他合适的技术确定。另外，报告基因和读取序列的确定之间的关联或共定位可以大幅提高解码精确度。其他方面涉及用于该方法的组合物或装置、试剂盒等。

公开(公告)号：CN113994001A

公开(公告)日：2022-01-28

申请号：CN202080043174.X

申请日：2020-04-17

Applicant: 哈佛学院院长及董事

Inventor： 庄小威 ,  王翀 ,  陆天

IPC: C12N15/113 ,  C12N9/22

Abstract: 本发明总体上涉及对细胞成像，例如，用于确定细胞群体中的表型和/或基因型，例如，以构建用于高通量筛选的基因型‑表型对应关系。在一些情况下，可以例如使用CRISPR或其他技术对细胞进行操作。在某些实施方案中，核酸可以例如使用慢病毒引入至所述细胞中。所述核酸可以含有：包含DNA或RNA识别序列的向导部分、报告基因部分、和包含一个或多个读取序列的标识部分。所述向导部分可以用来改变所述细胞的表型，例如，使用可以使用CRISPR或其他技术靶向的序列，例如sgRNA序列，并且在一些情况下，所述细胞的表型可以使用各种成像方式来确定。所述标识部分可以使用MERFISH或其他合适的技术确定。另外，在一些情况下，报告基因和读取序列的确定之间的关联或共定位可以大幅度提高解码精确度，例如，因降低背景信号的错误标识导致。其他方面总体上涉及用于在此类方法中使用的组合物或装置，用于在此类方法中使用的试剂盒，或类似物。

公开(公告)号：CN113994001B

公开(公告)日：2024-12-06

申请号：CN202080043174.X

申请日：2020-04-17

Applicant: 哈佛学院院长及董事

Inventor： 庄小威 ,  王翀 ,  陆天

IPC: C12N15/113 ,  C12N9/22

Abstract: 本发明涉及对细胞成像，用于确定细胞群体的表型和/或基因型或构建用于高通量筛选的基因型‑表型对应关系。可以使用CRISPR或其他技术操作细胞。核酸可使用慢病毒引入至细胞中。所述核酸可以含有：包含DNA或RNA识别序列的向导部分、报告基因部分和包含一个或多个读取序列的标识部分。所述向导部分可以用来改变细胞的表型，例如使用可以用CRISPR或其他技术靶向的序列，例如sgRNA序列，并且细胞的表型可以使用各种成像方式确定。所述标识部分可以使用MERFISH或其他合适的技术确定。另外，报告基因和读取序列的确定之间的关联或共定位可以大幅提高解码精确度。其他方面涉及用于该方法的组合物或装置、试剂盒等。

公开(公告)号：CN110140175A

公开(公告)日：2019-08-16

申请号：CN201780082228.1

申请日：2017-11-08

Applicant: 哈佛学院院长及董事

Inventor： 庄小威 ,  J·R·莫菲特 ,  J·G·郝 ,  陆天

IPC: G16B25/00 ,  C12Q1/6841

Abstract: 本发明一般性涉及用于成像或测定例如细胞或组织内的核酸或其他所需靶标的系统和方法。在一个方面，将样品暴露于在样品中测定的多个核酸探针。但是，在一些情况下，背景荧光或脱靶结合可能使测定适当结合的核酸探针更加困难。因此，可以从样品中“清除”可能造成背景的样品的其他组分例如蛋白质、脂质和/或其他非靶标，以改善测定。然而，在某些实施方案中，可以例如使用样品中的聚合物或凝胶防止核酸或其他所需靶标也被清除。其他方面通常涉及包括此类系统的组合物或试剂盒，使用此类系统的方法等。