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公开(公告)号:CN118879831A
公开(公告)日:2024-11-01
申请号:CN202411245048.9
申请日:2024-09-06
Applicant: 安徽农业大学
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种适用于ATAC‑seq测序的玉米胚乳提核方法。包括以下步骤:(1)从玉米种子中取大约5g胚乳,研磨成粉末。(2)将10mL体积的蔗糖缓冲液添加到每份样品中,充分混匀,通过100um孔筛过滤。(3)将上面的滤液通过38um孔网。再将产物以700*g离心5分钟,收集上清液。(4)将上清液通过38um筛网过滤并以2000*g离心5分钟,去除上清液,将沉淀悬浮在10mL蔗糖提取缓冲液中。(5)再次通过38um筛孔过滤,2000*g离心5‑10分钟。去除上清液,将沉淀重悬于5mL pbs。取10‑20uL使用DAPI等体积染色10分钟,在荧光显微镜下观察。本发明制备得到的胚乳细胞核数量多、活性高,可以克服储藏组织淀粉含量高的影响,为后续单细胞测序、CUT&TAG、ATAC‑seq等相关研究提供有力的技术支持,提取效果也会对实验数据产生重要影响。