一种基于属性优化蛋白质网络的功能模块挖掘方法

    公开(公告)号:CN109376842B

    公开(公告)日:2022-04-05

    申请号:CN201810946353.9

    申请日:2018-08-20

    Applicant: 安徽大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于属性优化蛋白质网络的功能模块挖掘方法,包括:S1、提取蛋白质候选节点对;S2、通过蛋白质候选节点对的提取初始化种群及种群中每个个体的功能模块集合并根据模块度Qg和属性密度SAg计算每个个体的适应度值;S3、种群个体间进行交叉变异,产生子代种群;S4、子代个体继承父代个体的功能模块集合,并根据每一个子代个体和父代个体基因值之间的差异,调整子代个体的功能模块,得到子代种群每个个体的功能模块集合并计算每个个体的适应度值;S5、根据父代种群和子代种群个体的适应度值进行环境选择得到新的种群;S6、重复执行步骤S3‑S5,直到执行到最大迭代次数时,输出种群的帕累托最优解集中每个个体的功能模块集合。

    一种基于属性优化蛋白质网络的功能模块挖掘方法

    公开(公告)号:CN109376842A

    公开(公告)日:2019-02-22

    申请号:CN201810946353.9

    申请日:2018-08-20

    Applicant: 安徽大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于属性优化蛋白质网络的功能模块挖掘方法,包括:S1、提取蛋白质候选节点对;S2、通过蛋白质候选节点对的提取初始化种群及种群中每个个体的功能模块集合并计算每个个体的适应度值;S3、种群个体间进行交叉变异,产生子代种群;S4、子代个体继承父代个体的功能模块集合,并根据每一个子代个体和父代个体基因值之间的差异,调整子代个体的功能模块,得到子代种群每个个体的功能模块集合并计算每个个体的适应度值;S5、根据父代种群和子代种群个体的适应度值进行环境选择得到新的种群;S6、重复执行步骤S3-S5,直到执行到最大迭代次数时,输出种群的帕累托最优解集中每个个体的功能模块集合。

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