一种猪circRNA序列及其应用、成环鉴定方法

    公开(公告)号:CN113846097A

    公开(公告)日:2021-12-28

    申请号:CN202111035863.9

    申请日:2021-09-06

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明基于最常见的一类肠道炎症性疾病——仔猪细菌性腹泻(PDW),其中F18大肠杆菌(E.coli F18)是引起断奶仔猪细菌性腹泻的主要病原,而地方品种猪对其抗性的调控机制有待系统阐明。前期通过组学测序筛选出1个大肠杆菌F18感染调控的关键候选RNA—circRNA_27388,由于circRNA_27388本体基因为FUT8,因此将其命名为circ_FUT8,在此基础上,本研究对circ_FUT8序列进行成环鉴定,为后续验证circRNA功能及调控机制奠定基础。

    一种与仔猪细菌性腹泻抗性相关的lncRNA标志物及其应用

    公开(公告)号:CN113832235A

    公开(公告)日:2021-12-24

    申请号:CN202111035954.2

    申请日:2021-09-06

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明通过组学测序筛选出1个大肠杆菌F18感染调控的关键候选lncRNA‑FUT3‑AS1,序列为SEQ ID NO:1,在此基础上,本研究围绕FUT3‑AS1功能与调控机制开展深入分析,首先利用qPCR和Northern blot技术检测了FUT3‑AS1在梅山猪与苏太猪F18大肠杆菌敏感型与抗性型断奶仔猪十二指肠中的表达差异情况,成功建立lncRNA‑FUT3‑AS1沉默的猪小肠上皮细胞,干扰效率达到68%,且通过细菌计数、革兰氏染色、扫描电镜以及间接免疫荧光等一系列检测手段发现,沉默lncRNA‑FUT3‑AS1可以显著地降低F18大肠杆菌对IPEC‑J2细胞的黏附能力。由此表明,lncRNA‑FUT3‑AS1在断奶仔猪抵抗F18大肠杆菌侵染过程中发挥了重要的抗性调控功能,其表达水平下调降低了小肠上皮细胞对F18大肠杆菌的黏附能力,有助于提高仔猪对F18大肠杆菌侵染的抵抗能力。

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