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公开(公告)号：CN109337998B
公开(公告)日：2021-07-27
申请号：CN201811212231.3
申请日：2018-10-11
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与玉米株高紧密连锁的InDel6和SSR229分子标记开发方法及其应用，标记序列：InDel6 5′‑TGTGGACGTGACACGCTT‑3′、5′‑TCAGCCTTCGTCCACAGAC‑3′；SSR229 5′‑GGGTCTTTCGCTGAATAACACT‑3′、5′‑CAACCCTCACTACTAAAGCCGA‑3′。本发明公开了上述标记在玉米株高标记辅助选择中的应用，方法：(1)标记对BC、F2群体基因型鉴定；(2)根据(1)鉴定结果，分选高秆、矮秆株，结合表型验证基因型。本发明的分子标记表现稳定，检测简易，不需酶切，电泳条带清晰，实验成本低廉，提高了玉米株型改良的效率。
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公开(公告)号：CN112159822A
公开(公告)日：2021-01-01
申请号：CN202011061777.0
申请日：2020-09-30
Applicant: 扬州大学
Abstract: 本发明属于基因编辑技术领域，具体涉及一种PS转座酶与CRISPR/dCpf1融合蛋白表达载体及其介导的定点整合方法，本发明通过DNA重组技术，制成转座酶和切割缺陷型Cas酶(dCpf1)的融合表达系统，该系统表达的融合蛋白与转座子介导的基因片段、crRNA形成的复合物在crRNA引导下与靶位点特异性结合，在靶位点进行定点整合，从而可以实现基因大片段高效定点整合，同时该技术由于去除了CRISPR系统基因切割功能，避免了脱靶效应的产生。
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公开(公告)号：CN110257425A
公开(公告)日：2019-09-20
申请号：CN201910366530.0
申请日：2019-05-05
Applicant: 扬州大学
IPC: C12N15/85
Abstract: 本发明公开一种PS转座子系统及其介导的基因转移方法，包括可插入目的基因盒的两个末端重复序列的转基因供体质粒和提供转座活性的转座酶辅助质粒。通过PS转座子系统将目的基因导入受体基因组。本发明提供的基于PS转座子系统的基因转移方法，经过细胞和胚胎水平验证能够高效介导基因转移，可应用于多个生物技术领域：1）使用本发明中给出的方法可有效地将目的基因盒插入到宿主基因组中，提高基因转移效率；2）与基因捕获技术结合可以有效开展动物基因功能研究；3）可以介导进行人类基因治疗等。
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公开(公告)号：CN110257481B
公开(公告)日：2023-07-28
申请号：CN201910384029.7
申请日：2019-05-09
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6809
Abstract: 本发明公开了一种基于比较基因组学的转座子插入多态TIP分子标记的挖掘方法，包括以下步骤：（1）选取目标基因或待研究的基因组片段为参考序列。（2）将参考序列在NCBI的WGS数据库中猪的基因组测序数据进行Blast比对，获取不同品种基因组中的同源序列，并对上述序列进行手动校对和拼接。（3）根据猪转座子数据对参考序列和拼接序列进行转座子注释以及多序列比对。（4）挑选序列间存在的超过100个碱基且对应转座子的Indel位点，作为候选TIP位点。（5）以不同品种的池DNA为模板进行PCR扩增检测，选取带型清楚且存在多态性的TIP位点。该方法可以迅速找到目标区域或基因中便于检测、结果清晰易判断的分子标记。
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公开(公告)号：CN110157811A
公开(公告)日：2019-08-23
申请号：CN201910409360.X
申请日：2019-05-16
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与猪背膘厚关联的GHR基因内SINE转座子多态分子标记、检测方法及应用。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其来自GHR基因，该序列的200到493位点存在一个反向SINE转座子的插入多态性位点，该位点表现为SINE+/+、SINE+/-或SINE-/-三种基因型，纯合插入基因型（SINE+/+）的个体背膘厚显著小于纯合无插入基因型（SINE-/-）的个体。本发明的GHR基因内SINE转座子多态分子标记可以用于家系选育的早期选择，也可在选配中提供分子依据。将会对背膘性状的选育提供强有力的辅助作用，加快育种进程，减少育种成本。本发明的GHR基因内SINE转座子多态分子标记为筛选猪的背膘厚提供了新的方法。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110257425B
公开(公告)日：2022-07-15
申请号：CN201910366530.0
申请日：2019-05-05
Applicant: 扬州大学
IPC: C12N15/85
Abstract: 本发明公开一种PS转座子系统及其介导的基因转移方法，包括可插入目的基因盒的两个末端重复序列的转基因供体质粒和提供转座活性的转座酶辅助质粒。通过PS转座子系统将目的基因导入受体基因组。本发明提供的基于PS转座子系统的基因转移方法，经过细胞和胚胎水平验证能够高效介导基因转移，可应用于多个生物技术领域：1）使用本发明中给出的方法可有效地将目的基因盒插入到宿主基因组中，提高基因转移效率；2）与基因捕获技术结合可以有效开展动物基因功能研究；3）可以介导进行人类基因治疗等。
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公开(公告)号：CN110157811B
公开(公告)日：2022-06-14
申请号：CN201910409360.X
申请日：2019-05-16
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与猪背膘厚关联的GHR基因内SINE转座子多态分子标记、检测方法及应用。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，其来自GHR基因，该序列的200到493位点存在一个反向SINE转座子的插入多态性位点，该位点表现为SINE+/+、SINE+/‑或SINE‑/‑三种基因型，纯合插入基因型（SINE+/+）的个体背膘厚显著小于纯合无插入基因型（SINE‑/‑）的个体。本发明的GHR基因内SINE转座子多态分子标记可以用于家系选育的早期选择，也可在选配中提供分子依据。将会对背膘性状的选育提供强有力的辅助作用，加快育种进程，减少育种成本。本发明的GHR基因内SINE转座子多态分子标记为筛选猪的背膘厚提供了新的方法。
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公开(公告)号：CN112430622A
公开(公告)日：2021-03-02
申请号：CN202011155827.1
申请日：2020-10-26
Applicant: 扬州大学
Abstract: 本发明属于基因编辑领域，特别涉及一种FokI和dCpf1融合蛋白表达载体及其介导的定点基因编辑方法，本发明将CRISPR/Cpf1编辑系统中经突变失活的dCpf1蛋白与FokI核酸酶融合在一起，构建一种高效的gRNA介导的基因定点编辑系统。该方法利用dCpf1的定点作用与核酸酶FokI的剪切作用，通过二聚体的形式进行剪切，可以提高该基因编辑系统的特异性，并达到较低的脱靶率。相对于Cas9蛋白而言，Cpf1蛋白有更大的优势被用来进行基因编辑等操作。本发明提供了一种更便捷，更高效的融合蛋白介导的基因定点编辑方法。
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公开(公告)号：CN110257481A
公开(公告)日：2019-09-20
申请号：CN201910384029.7
申请日：2019-05-09
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6809
Abstract: 本发明公开了一种基于比较基因组学的转座子插入多态TIP分子标记的挖掘方法，包括以下步骤：（1）选取目标基因或待研究的基因组片段为参考序列。（2）将参考序列在NCBI的WGS数据库中猪的基因组测序数据进行Blast比对，获取不同品种基因组中的同源序列，并对上述序列进行手动校对和拼接。（3）根据猪转座子数据对参考序列和拼接序列进行转座子注释以及多序列比对。（4）挑选序列间存在的超过100个碱基且对应转座子的Indel位点，作为候选TIP位点。（5）以不同品种的池DNA为模板进行PCR扩增检测，选取带型清楚且存在多态性的TIP位点。该方法可以迅速找到目标区域或基因中便于检测、结果清晰易判断的分子标记。
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公开(公告)号：CN109337998A
公开(公告)日：2019-02-15
申请号：CN201811212231.3
申请日：2018-10-11
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了与玉米株高紧密连锁的InDel6和SSR229标记及其应用，标记核苷酸序列为：InDel6正向引物5′-TGTGGACGTGACACGCTT-3′、反向引物5′-TCAGCCTTCGTCCACAGAC-3′；SSR229正向引物5′-GGGTCTTTCGCTGAATAACACT-3′、反向引物5′-CAACCCTCACTACTAAAGCCGA-3′。本发明还公开了上述标记在玉米株高分子标记辅助选择育种中的应用。具体方法是：(1)采用分子标记，对BC、F2群体株进行基因型鉴定；(2)根据(1)中基因型鉴定的结果，进行高秆、矮秆分类，结合表型结果进行基因型鉴定的验证。本发明的分子标记表现稳定，检测简易，不需酶切，电泳条带清晰，实验成本低廉，提高了玉米株型改良的效率，加快了玉米理想株型育种的进程。
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