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公开(公告)号:CN116162684A
公开(公告)日:2023-05-26
申请号:CN202310128111.X
申请日:2023-02-17
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/70 , C12R1/93
Abstract: 本申请涉及基因测序技术领域,尤其涉及一种去除扩增子测序中扩增产物残余污染的方法及其应用,所述方法包括:在构建待测样本的测序文库的第一步PCR反应体系中加入DNA Spike‑ins,后以第一多重扩增引物进行第一步PCR扩增,得到第一扩增产物;向所述第一扩增产物中加入第二步PCR反应体系和第二PCR扩增引物,并进行第二步PCR扩增,得到测序文库;DNA Spike‑ins依据待测样本中目标生物的基因组标记位点的序列设计并合成;第一步PCR反应体系包括dUTP和UDG;第二步PCR反应体系包括dUTP;通过在第一步PCR反应体系中加入DNA Spike‑ins,减少扩增产物残余污染的扩增,再在每步PCR反应体系中加入dUTP,并在第一步PCR反应体系中加入UDG,能降解含尿嘧啶的PCR产物,去除扩增产物残余污染。
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公开(公告)号:CN116334282A
公开(公告)日:2023-06-27
申请号:CN202310239485.9
申请日:2023-03-07
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本申请涉及生物技术领域,尤其涉及一种用于推断水中尸体溺死地的引物组及制备方法和应用;所述引物组包括:如SEQ ID NO:1~12所示的6组引物对;通过针对硅藻的叶绿体中基因组进行设计,且引物组中各引物对之间相互不冲突,使得后续检测阶段,只需经过一次高通量测序和分析,就能得到多个检测结果,再针对检测结果的关联分析,进而准确推断水中尸体的溺死地;由于引物组是针对多个硅藻叶绿体的标记位点进行设计的,避免了单个标记位点的漏检与单纯形态学的误判,同时降低了单个标记检测与形态学观察的繁琐工作量,因此不仅可以提高检测过程中的效率和特异性,还能提高检测的准确度。
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公开(公告)号:CN116287463A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310249665.5
申请日:2023-03-15
Applicant: 江汉大学 , 北京中科基因技术股份有限公司
Abstract: 本申请涉及基因检测领域,尤其涉及一种猪蓝耳病病原体PRRSV检测用探针组、试剂盒和制备方法及应用;所述探针组的核苷酸序列如SEQ ID NO.1~53所示;该探针组是通过分析由PRRSV美洲株和欧洲株代表株组成的目标基因组库序列,并在毒株基因组间的保守区域和变异区域内设计的、且能完全覆盖PRRSV美洲株和欧洲株全基因组的探针组;所述探针组能特异的捕获待测样本中的PRRSV序列,使得PRRSV得以富集,以实现在免培养的基础上对PRRSV高灵敏度的检测、基因组水平的变异监测和分型。
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公开(公告)号:CN116555488A
公开(公告)日:2023-08-08
申请号:CN202310276079.X
申请日:2023-03-21
Applicant: 江汉大学 , 北京中科基因技术股份有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本申请涉及生物技术领域,尤其涉及一种检测猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及应用;所述MNP标记位点为在PRRSV基因组上筛选的具有亚型特异性的、且在亚型内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域;所述MNP标记位点包括MNP‑1至MNP‑5的5个标记位点;并根据发现的MNP标记位点设计多重引物组合物,可以利用设计的多重引物组合物进行多重PCR扩增,并融合二代测序平台进行扩增产物的测序,满足对PRRSV的2个亚型高通量、高效率、高准确性和高灵敏度的检测的需求。
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公开(公告)号:CN116287313A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310299142.1
申请日:2023-03-24
Applicant: 江汉大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本申请涉及生物技术领域,尤其涉及一种禽类鉴别用的MNP标记位点、引物组合物、试剂、试剂盒及应用;所述MNP标记位点为在每种禽类基因组上筛选的具有物种特异性的、且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域;所述MNP标记位点包括MNP‑1至MNP‑15的15个标记位点;并根据发现的MNP标记位点设计多重引物组合物,可以利用设计的多重引物组合物进行多重PCR扩增,并融合二代测序平台进行扩增产物的测序,满足一次性对5种禽类及其肉制品高通量、高效率、高准确性的鉴定和区分,为处理肉类掺假问题提供技术支持。
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