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公开(公告)号:CN103145824B
公开(公告)日:2015-07-22
申请号:CN201310048169.X
申请日:2013-02-07
Applicant: 深圳华大基因研究院
IPC: C07K14/47 , C12N15/12 , C12N15/63 , C12N5/10 , C12N15/877 , A01K67/027 , C12Q1/02 , A61K49/00
Abstract: 本发明属于基因工程领域。涉及一种突变型隐色素基因1和突变型隐色素基因1的转基因猪。本发明还涉及突变型隐色素基因1的核苷酸、核酸构建体、转基因动物细胞或其培养物以及制备非人转基因动物的方法。具体地,所述突变型隐色素基因1的氨基酸序列如SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3所示。本发明制得的转基因猪出现了明显的生物节律紊乱和炎症因子高表达,具有作为筛选治疗和/预防和/或辅助治疗和/或调节生物节律紊乱的药物或者筛选治疗和/预防和/或辅助治疗炎症的药物的潜力。
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公开(公告)号:CN102533741B
公开(公告)日:2014-09-24
申请号:CN201110409456.X
申请日:2011-12-09
Applicant: 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明涉及猪假attp位点及其用途。更具体地,本发明涉及一种分离的可被ΦC31整合酶识别的寡核苷酸,一种适于转化猪细胞的载体,一组适于转化猪细胞的载体,一种转基因猪细胞或其培养物,一种制备转基因猪细胞的方法,以及一种确定猪基因组中假attp位点序列。其中,分离的可被ΦC31整合酶识别的寡核苷酸,其包含如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列。其能够有效地在ΦC31整合酶的介导下,在猪细胞中引入外源基因。
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公开(公告)号:CN102533960B
公开(公告)日:2014-04-30
申请号:CN201010619689.8
申请日:2010-12-31
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/6806 , C12Q1/6851 , C12Q1/6869 , C12Q1/6876 , C12Q2600/166 , C12Q2531/119 , C12Q2545/101
Abstract: 本发明公开了一种单细胞基因组分析方法和试剂盒。所述方法包括:a、获取完整细胞基因组DNA;b、进行单细胞全基因组扩增;c、对扩增产物进行定量检测及定性检测,所述定性检测是指,采用Housekeeping?Gene检测方法,对单细胞全基因组的扩增产物进行检测。所述试剂盒含有所述单细胞的Housekeeping?Gene的特异性引物。本发明的方法可以全面完整地分析单细胞基因组的遗传变异信息,并对于全新物种的单细胞基因组研究提供了有效的研究策略;而引入的定性及定量检测筛选步骤,可去除大量不合格的扩增样品,从而控制下游上机测序文库的质量,能从很大程度上避免不必要的浪费。
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公开(公告)号:CN102558343A
公开(公告)日:2012-07-11
申请号:CN201110459720.0
申请日:2011-12-31
Applicant: 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC: C07K14/72 , C12N15/12 , C12N15/63 , C12N5/10 , C12N15/85 , C12N15/873 , A01K67/027 , C12Q1/02 , A61K49/00
Abstract: 本发明涉及突变型生长激素受体及其应用。更具体地,本发明涉及分离的突变型生长激素受体、分离的寡核苷酸、构建体、转基因动物细胞或其培养物、制备转基因动物细胞的方法、制备非人转基因动物的方法、非人转基因动物或其后代以及筛选治疗侏儒症的药物的方法。其中,与野生型生长激素受体相比,所述突变型生长激素受体至少缺失胞内区段的氨基酸序列。借助该突变型生长激素受体的表达,能够有效地干扰动物生长轴通路,从而可以抑制动物的生长,使得动物的体型比野生型动物小。
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公开(公告)号:CN102534811A
公开(公告)日:2012-07-04
申请号:CN201010591448.7
申请日:2010-12-16
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12Q1/6806 , C12Q2521/501 , C12Q2523/301 , C12Q2525/307
Abstract: 本发明属于分子生物学领域,涉及一种DNA文库及其制备方法、一种DNA测序方法和装置。具体地,所述DNA文库的制备方法包括如下步骤:一种DNA文库的制备方法,包括如下步骤:1)将样本基因组DNA随机打断为20-50kb的DNA片段;2)下述的步骤A或B:A.将打断的DNA片段两个末端进行补平,并加上捕获标记,然后分离20-50kb的DNA片段;或B.分离打断的20-50kb的DNA片段,然后将DNA片段两个末端进行补平,并加上捕获标记;3)将分离的DNA片段进行环化,得到环状DNA,并除去未环化的DNA片段;4)将环状DNA打断为100-2,000bp的DNA片段;5)从步骤4)中得到的DNA片段中分离带有捕获标记的DNA片段,得到捕获片段。本发明具有简单快速等优点。
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公开(公告)号:CN102409089A
公开(公告)日:2012-04-11
申请号:CN201110301714.2
申请日:2011-10-08
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12Q1/6827 , C12Q2525/186 , C12Q2533/101 , C12Q2563/167
Abstract: 本发明涉及检测DNA样品中预定位点的突变的引物、试剂盒、方法及应用。检测DNA样品中预定位点的突变的方法包括以下步骤:使用扩增引物对DNA样品进行PCR扩增反应,使用延伸引物以及ddNTP,以所述扩增产物为模板,进行寡核苷酸延伸反应,以便获得在所述延伸引物的3’端连接一个碱基的延伸产物;以及基于延伸产物的分子量,确定所述预定位点的突变类型。可以有效地确定在预定位点是否发生了突变,以及所发生突变的类型。
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公开(公告)号:CN101794346B
公开(公告)日:2011-11-23
申请号:CN200910252465.5
申请日:2009-12-11
Applicant: 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明适用于基因工程领域,提供了一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统,所述方法包括下述步骤:将参考基因集中的参考基因定位到目标基因组上,形成基因拷贝座位;根据所述基因拷贝座位,将重叠的基因拷贝聚类到一起,形成模糊位点基因代表座位;根据所述模糊位点代表基因座位,利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。本发明实施例提供的染色体同线性同源区域的检测方法可自动检测到染色体同线性同源区域,且敏感度高,复杂度低,避免了目测时主观因素对染色体同线性同源区域检测的影响。
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公开(公告)号:CN101539967B
公开(公告)日:2010-12-01
申请号:CN200810218343.X
申请日:2008-12-12
Applicant: 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明适用于生物工程领域,提供了一种单核苷酸多态性检测方法,所述方法包括下述步骤:将高通量测序技术得到的测序片段比对到参考基因组序列上;根据测序得到的待测基因组中每个碱基的测序质量分数,得到待测基因组上对应位点的各种基因型的似然概率;根据所述似然概率和为每种基因型预设的先验概率,计算参考基因组上每个位点上每种基因型的后验概率,并将后验概率最高的基因型确定为待测基因组对应位点最有可能正确的基因型,得到待测基因组的一致序列;检测待测基因组的一致序列中与参考基因组序列不一致的位点,得到待测基因组中的多态性位点。本发明实施例由于考虑了先验概率对单核苷酸多态性检测结果的影响,从而使检测结果更准确。
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公开(公告)号:CN101794346A
公开(公告)日:2010-08-04
申请号:CN200910252465.5
申请日:2009-12-11
Applicant: 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明适用于基因工程领域,提供了一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统,所述方法包括下述步骤:将参考基因集中的参考基因定位到目标基因组上,形成基因拷贝座位;根据所述基因拷贝座位,将重叠的基因拷贝聚类到一起,形成模糊位点基因代表座位;根据所述模糊位点代表基因座位,利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。本发明实施例提供的染色体同线性同源区域的检测方法可自动检测到染色体同线性同源区域,且敏感度高,复杂度低,避免了目测时主观因素对染色体同线性同源区域检测的影响。
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