一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统

    公开(公告)号:CN101794346B

    公开(公告)日:2011-11-23

    申请号:CN200910252465.5

    申请日:2009-12-11

    Abstract: 本发明适用于基因工程领域,提供了一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统,所述方法包括下述步骤:将参考基因集中的参考基因定位到目标基因组上,形成基因拷贝座位;根据所述基因拷贝座位,将重叠的基因拷贝聚类到一起,形成模糊位点基因代表座位;根据所述模糊位点代表基因座位,利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。本发明实施例提供的染色体同线性同源区域的检测方法可自动检测到染色体同线性同源区域,且敏感度高,复杂度低,避免了目测时主观因素对染色体同线性同源区域检测的影响。

    一种单核苷酸多态性检测方法

    公开(公告)号:CN101539967B

    公开(公告)日:2010-12-01

    申请号:CN200810218343.X

    申请日:2008-12-12

    Abstract: 本发明适用于生物工程领域,提供了一种单核苷酸多态性检测方法,所述方法包括下述步骤:将高通量测序技术得到的测序片段比对到参考基因组序列上;根据测序得到的待测基因组中每个碱基的测序质量分数,得到待测基因组上对应位点的各种基因型的似然概率;根据所述似然概率和为每种基因型预设的先验概率,计算参考基因组上每个位点上每种基因型的后验概率,并将后验概率最高的基因型确定为待测基因组对应位点最有可能正确的基因型,得到待测基因组的一致序列;检测待测基因组的一致序列中与参考基因组序列不一致的位点,得到待测基因组中的多态性位点。本发明实施例由于考虑了先验概率对单核苷酸多态性检测结果的影响,从而使检测结果更准确。

    一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统

    公开(公告)号:CN101794346A

    公开(公告)日:2010-08-04

    申请号:CN200910252465.5

    申请日:2009-12-11

    Abstract: 本发明适用于基因工程领域,提供了一种染色体同线性同源区域的检测方法和系统,所述方法包括下述步骤:将参考基因集中的参考基因定位到目标基因组上,形成基因拷贝座位;根据所述基因拷贝座位,将重叠的基因拷贝聚类到一起,形成模糊位点基因代表座位;根据所述模糊位点代表基因座位,利用动态规划模糊位点定位算法检测染色体的同线性同源区域。本发明实施例提供的染色体同线性同源区域的检测方法可自动检测到染色体同线性同源区域,且敏感度高,复杂度低,避免了目测时主观因素对染色体同线性同源区域检测的影响。

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