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公开(公告)号:CN108018607B
公开(公告)日:2021-04-27
申请号:CN201610962942.7
申请日:2016-10-28
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C40B20/04 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种提升测序平台文库拆分率的标签序列混库方法和装置。所述方法包括:将多个标签序列中每个位置的A、C碱基替换为同一个符号,将G、T碱基替换为另一个符号,从而将每个标签序列转换成由两种符号表示的序列;选取标签序列转换后两两标签序列在大于2个位置有差异的序列进行混库。本发明的方法对标签序列的碱基作转化处理,并且设定两两混库的差异标准,根据设置的标签序列混库组合规则,确保标签序列测序成功率达到100%,标签序列的拆分率达到90%以上。
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公开(公告)号:CN108949905B
公开(公告)日:2022-05-17
申请号:CN201710378056.4
申请日:2017-05-23
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12N15/10 , C40B40/06 , C40B50/06
Abstract: 本发明提出了一种对照文库,该对照文库由多个构建体构成,多个构建体分别含有:插入片段,该插入片段来自于人类基因组DNA的至少一部分;以及测序接头序列,该测序接头序列形成在所述插入片段的两侧末端,其中,插入片段中的A、T、G和C碱基的含量均在20~30%之间。根据本发明实施例的对照文库,实现了对照文库成本的大幅降低,将其应用于碱基不平衡文库测序,碱基不平衡文库测序的质量和产量的得到显著提升。
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公开(公告)号:CN108949905A
公开(公告)日:2018-12-07
申请号:CN201710378056.4
申请日:2017-05-23
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12N15/10 , C40B40/06 , C40B50/06
CPC classification number: C12Q1/6806 , C12N15/1093 , C12Q1/6869 , C40B40/06 , C40B50/06 , C12Q2525/191
Abstract: 本发明提出了一种对照文库,该对照文库由多个构建体构成,多个构建体分别含有:插入片段,该插入片段来自于人类基因组DNA的至少一部分;以及测序接头序列,该测序接头序列形成在所述插入片段的两侧末端,其中,插入片段中的A、T、G和C碱基的含量均在20~30%之间。根据本发明实施例的对照文库,实现了对照文库成本的大幅降低,将其应用于碱基不平衡文库测序,碱基不平衡文库测序的质量和产量的得到显著提升。
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公开(公告)号:CN108018607A
公开(公告)日:2018-05-11
申请号:CN201610962942.7
申请日:2016-10-28
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C40B20/04 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种提升测序平台文库拆分率的标签序列混库方法和装置。所述方法包括:将多个标签序列中每个位置的A、C碱基替换为同一个符号,将G、T碱基替换为另一个符号,从而将每个标签序列转换成由两种符号表示的序列;选取标签序列转换后两两标签序列在大于2个位置有差异的序列进行混库。本发明的方法对标签序列的碱基作转化处理,并且设定两两混库的差异标准,根据设置的标签序列混库组合规则,确保标签序列测序成功率达到100%,标签序列的拆分率达到90%以上。
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