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公开(公告)号:CN108707663A
公开(公告)日:2018-10-26
申请号:CN201810356012.6
申请日:2018-04-19
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q2600/178
Abstract: 本申请公开了一种用于癌症样本miRNA测序定量结果评价的试剂及其制备方法和应用。本申请的试剂包括SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.8所示序列的RNA中的至少一种。本申请的试剂,将其定量的加入待测RNA样品中,并通过测序定量分析所加入的试剂的量,将定量分析结果与实际加入量进行比较,以此评价整个miRNA测序定量结果的准确性和可靠性;该方法简便、易用,能够有效的评价miRNA测序定量结果的可信度。本申请的试剂各方面特性都与真实的miRNA十分接近,因此,采用本申请的试剂能够更真实、准确、可靠的反映人源miRNA测序定量结果的实际情况,从而对癌症样本miRNA测序定量结果作出更准确、可靠的评价。
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公开(公告)号:CN109385468B
公开(公告)日:2022-08-16
申请号:CN201710684356.5
申请日:2017-08-11
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了检测链特异性效率的成套试剂与方法。本发明公开的检测链特异性效率的成套试剂由SEQ ID NO:1‑6所示的RNA组成,检测链特异性效率的方法,包括:向待建库的RNA中添加本发明的成套试剂,后进行链特异性转录组文库构建,然后进行高通量测序,将测序数据与成套试剂的序列进行比对,计算成套试剂的正义比对读段数目占成套试剂的总读段数目的比例,该比例即为链特异性系数,根据链特异性系数确定链特异性效率。本发明的检测链特异性效率的方法与成套试剂可以用于指示mRNA或非编码RNA等链特异性转录组测序数据的可信程度,确保分析结果的可靠性。
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公开(公告)号:CN108707663B
公开(公告)日:2022-03-08
申请号:CN201810356012.6
申请日:2018-04-19
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本申请公开了一种用于癌症样本miRNA测序定量结果评价的试剂及其制备方法和应用。本申请的试剂包括SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.8所示序列的RNA中的至少一种。本申请的试剂,将其定量的加入待测RNA样品中,并通过测序定量分析所加入的试剂的量,将定量分析结果与实际加入量进行比较,以此评价整个miRNA测序定量结果的准确性和可靠性;该方法简便、易用,能够有效的评价miRNA测序定量结果的可信度。本申请的试剂各方面特性都与真实的miRNA十分接近,因此,采用本申请的试剂能够更真实、准确、可靠的反映人源miRNA测序定量结果的实际情况,从而对癌症样本miRNA测序定量结果作出更准确、可靠的评价。
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公开(公告)号:CN109385468A
公开(公告)日:2019-02-26
申请号:CN201710684356.5
申请日:2017-08-11
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了检测链特异性效率的成套试剂与方法。本发明公开的检测链特异性效率的成套试剂由SEQ ID NO:1-6所示的RNA组成,检测链特异性效率的方法,包括:向待建库的RNA中添加本发明的成套试剂,后进行链特异性转录组文库构建,然后进行高通量测序,将测序数据与成套试剂的序列进行比对,计算成套试剂的正义比对读段数目占成套试剂的总读段数目的比例,该比例即为链特异性系数,根据链特异性系数确定链特异性效率。本发明的检测链特异性效率的方法与成套试剂可以用于指示mRNA或非编码RNA等链特异性转录组测序数据的可信程度,确保分析结果的可靠性。
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公开(公告)号:CN109593835B
公开(公告)日:2023-12-12
申请号:CN201710910929.1
申请日:2017-09-29
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 电泳分析设备,成本更低,更易推广和普及。本申请公开了一种用于微量FFPE RNA样本评估的方法、试剂盒及应用。本申请的用于微量FFPE RNA样本评估方法,包括选取靶标片段,采用靶标片段的特异性引物和探针,对微量FFPE RNA样本进行实时荧光PCR;并采用标准曲线进行相对定量,获得靶标片段的相对浓度和丰度,以此评估微量FFPE RNA样本的可用性。本申请的方法,打破目前主流检测工具2100Bioanalyzer的局限,采用实时荧光PCR和标准曲线进行相对定(56)对比文件Sangjung Park.Development of RT-qPCR-based molecular diagnostic assays fortherapeutic target selection of breastcancer patients《.Yonsei University healthsystem repository》.2014,第1-104页.Alessandro K. Lee.A NEW TUMORSUPPRESSOR GENE CANDIDATE REGULATED BYTHE NON-CODING RNA PCA3 IN HUMAN PROSTATECANCER《.The Texas Medical CenterLibrary》.2010,第1-137页.
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公开(公告)号:CN109593835A
公开(公告)日:2019-04-09
申请号:CN201710910929.1
申请日:2017-09-29
Applicant: 深圳华大基因股份有限公司
IPC: C12Q1/6851 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6851 , C12Q2537/143 , C12Q2545/114 , C12Q2563/107
Abstract: 本申请公开了一种用于微量FFPE RNA样本评估的方法、试剂盒及应用。本申请的用于微量FFPE RNA样本评估方法,包括选取靶标片段,采用靶标片段的特异性引物和探针,对微量FFPE RNA样本进行实时荧光PCR;并采用标准曲线进行相对定量,获得靶标片段的相对浓度和丰度,以此评估微量FFPE RNA样本的可用性。本申请的方法,打破目前主流检测工具2100Bioanalyzer的局限,采用实时荧光PCR和标准曲线进行相对定量,判断其样本质量,与2100Bioanalyzer方法相比,本申请的方法可直接展示靶标片段的丰度和可用性情况,并且,无需额外购买昂贵的毛细管电泳分析设备,成本更低,更易推广和普及。
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