公开(公告)号：CN109448783B

公开(公告)日：2022-05-13

申请号：CN201810890699.1

申请日：2018-08-07

Applicant: 清华大学

Inventor： 陈阳 ,  陈凤玲 ,  李贵鹏 ,  张奇伟

IPC: G16B15/00 ,  G16B25/00 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q1/6883

Abstract: 本发明涉及染色质结构的分析方法，具体涉及一种分析染色质拓扑结构域边界的分析方法。

公开(公告)号：CN113466187B

公开(公告)日：2022-11-08

申请号：CN202110388049.9

申请日：2021-04-12

Applicant: 清华大学

Inventor： 高军涛 ,  关美玲 ,  王淼妍 ,  张昊 ,  陈龙 ,  杨旭三 ,  席鹏 ,  张奇伟

IPC: G01N21/64 ,  G01N21/01

Abstract: 本发明涉及一种对荧光各向异性进行偏振超分辨成像的系统及方法。该系统应用光学锁相探测技术和线性二向色系统获取偏振调制图像序列，该方法包括以下内容：S1、对采集的受旋转偏振光调制的荧光图像序列通过频域锁相处理，提取调制频率相同的信号，得到只保留背景和调制频率信息的序列图像IOLID；S2、对序列图像IOLID进行解调即三维解卷积，同时得到超分辨ac图像G'ac、重构dc图像G'dc和超分辨重构图像G'，并通过相位提取即可得到偶极子取向分布图像。本发明OLID‑SDOM揭示了部分样品中以前从未观察到的荧光各向异性，表明其有潜力观察动态分子结构，相比于传统显微镜其空间分辨率加倍，成像时对生物标本没有限制。

公开(公告)号：CN108300767A

公开(公告)日：2018-07-20

申请号：CN201810136518.6

申请日：2018-02-09

Applicant: 清华大学

Inventor： 陈阳 ,  梁征宇 ,  李贵鹏 ,  钱敏平 ,  张奇伟

IPC: C12Q1/6806 ,  C12N15/10 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明涉及一种核酸复合体中核酸区段相互作用的分析方法，本发明具体采用识别四碱基位点的限制性内切酶进行酶切，后续配合采用两步连接法，整体流程简便易行，实现了对核酸相互作用区段的高效和高灵敏度的检测。

公开(公告)号：CN108220394A

公开(公告)日：2018-06-29

申请号：CN201810011140.7

申请日：2018-01-05

Applicant: 清华大学

Inventor： 陈阳 ,  李炎剑 ,  贺毅 ,  张奇伟

IPC: C12Q1/6809

Abstract: 本发明涉及一种运用多种基因组分析技术，例如RNA‑seq、ChIP‑seq或Hi‑C等手段，对经历状态转变(例如细胞分化)的样品的目标特性进行多方面表征和分析，从而识别出基因调控性染色质相互作用的方法，特别涉及一种鉴定在样品状态转变过程中，与样品状态转变相关的染色质相互作用和相关基因的方法。

公开(公告)号：CN113466187A

公开(公告)日：2021-10-01

申请号：CN202110388049.9

申请日：2021-04-12

Applicant: 清华大学

Inventor： 高军涛 ,  关美玲 ,  王淼妍 ,  张昊 ,  陈龙 ,  杨旭三 ,  席鹏 ,  张奇伟

IPC: G01N21/64 ,  G01N21/01

Abstract: 本发明涉及一种对荧光各向异性进行偏振超分辨成像的系统及方法。该系统应用光学锁相探测技术和线性二向色系统获取偏振调制图像序列，该方法包括以下内容：S1、对采集的受旋转偏振光调制的荧光图像序列通过频域锁相处理，提取调制频率相同的信号，得到只保留背景和调制频率信息的序列图像IOLID；S2、对序列图像IOLID进行解调即三维解卷积，同时得到超分辨ac图像G'ac、重构dc图像G'dc和超分辨重构图像G'，并通过相位提取即可得到偶极子取向分布图像。本发明OLID‑SDOM揭示了部分样品中以前从未观察到的荧光各向异性，表明其有潜力观察动态分子结构，相比于传统显微镜其空间分辨率加倍，成像时对生物标本没有限制。

公开(公告)号：CN108300767B

公开(公告)日：2021-08-20

申请号：CN201810136518.6

申请日：2018-02-09

Applicant: 清华大学

Inventor： 陈阳 ,  梁征宇 ,  李贵鹏 ,  钱敏平 ,  张奇伟

IPC: C12Q1/6806 ,  C12N15/10 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明涉及一种核酸复合体中核酸区段相互作用的分析方法，本发明具体采用识别四碱基位点的限制性内切酶进行酶切，后续配合采用两步连接法，整体流程简便易行，实现了对核酸相互作用区段的高效和高灵敏度的检测。

公开(公告)号：CN108220394B

公开(公告)日：2021-03-23

申请号：CN201810011140.7

申请日：2018-01-05

Applicant: 清华大学

Inventor： 陈阳 ,  李炎剑 ,  贺毅 ,  张奇伟

IPC: C12Q1/6809

Abstract: 本发明涉及一种运用多种基因组分析技术，例如RNA‑seq、ChIP‑seq或Hi‑C等手段，对经历状态转变(例如细胞分化)的样品的目标特性进行多方面表征和分析，从而识别出基因调控性染色质相互作用的方法，特别涉及一种鉴定在样品状态转变过程中，与样品状态转变相关的染色质相互作用和相关基因的方法。

公开(公告)号：CN109825498B

公开(公告)日：2020-10-09

申请号：CN201910197017.3

申请日：2019-03-15

Applicant: 清华大学

Inventor： 张旭 ,  高军涛 ,  张奇伟

IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q1/6834

Abstract: 本发明涉及针对目标核酸靶标的探针的制备方法。该方法包括：a)获取感兴趣的靶DNA序列；b)使用转座酶，将所述靶DNA序列进行片段化的同时，在片段化的DNA序列两端加上接头序列；和c)利用所述接头序列，获取所述片段化的DNA序列，以产生探针。采用本发明提供的方法能够以kb级的分辨率，高效、简便、准确的标记基因组位置。

公开(公告)号：CN109825498A

公开(公告)日：2019-05-31

申请号：CN201910197017.3

申请日：2019-03-15

Applicant: 清华大学

Inventor： 张旭 ,  高军涛 ,  张奇伟

IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/6841 ,  C12Q1/6834

Abstract: 本发明涉及针对目标核酸靶标的探针的制备方法。该方法包括：a)获取感兴趣的靶DNA序列；b)使用转座酶，将所述靶DNA序列进行片段化的同时，在片段化的DNA序列两端加上接头序列；和c)利用所述接头序列，获取所述片段化的DNA序列，以产生探针。采用本发明提供的方法能够以kb级的分辨率，高效、简便、准确的标记基因组位置。

公开(公告)号：CN108197431B

公开(公告)日：2022-04-05

申请号：CN201810069870.2

申请日：2018-01-24

Applicant: 清华大学

Inventor： 陈阳 ,  那第尔 ,  张奇伟

IPC: G16B20/00

Abstract: 本发明涉及一种不同状态的样品中染色质相互作用差异的分析方法，更具体涉及一种结合近邻相互作用的信息进行差异性染色质相互作用分析的方法。