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公开(公告)号:CN101103272A
公开(公告)日:2008-01-09
申请号:CN200580046716.4
申请日:2005-10-17
Applicant: 索尼株式会社
CPC classification number: G06F19/20 , C12Q1/6837 , C12Q2600/158 , G06F19/24 , C12Q2545/101 , C12Q2537/143
Abstract: 本发明提供了获取高度可靠且高度精确的指标的方法,所述指标使单独测定的基因表达量归一化,以进行对比和验证,所述方法旨在提高基因表达量归一化的可靠性和精确度。本发明还提供了基因表达量的归一化方法,其利用为获取指标而测的基因表达量,将为基因表达分析而测的基因表达量归一化,其中利用相关性函数来确定为获取指标而测的基因表达量之间的相关性,并用所得相关性作指标,将为基因表达分析而测的基因表达量归一化。可以在两种以上实验条件下采集细胞(31),并获得所述细胞(31)在每一实验条件下的基因表达量gn,以所述实验条件(图标34-38)下的基因表达量之间的相关性作为函数值,并选择多个接近恒定值的函数值进行组合,获得所述相关性函数。
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公开(公告)号:CN101163958B
公开(公告)日:2011-08-31
申请号:CN200680013415.6
申请日:2006-04-12
Applicant: 索尼株式会社
IPC: G01N21/64
CPC classification number: G01N21/6452 , C12Q1/6816 , G01N21/253 , C12Q2565/501
Abstract: 本发明涉及一种不使结构变复杂而能够以低成本正确地测量DNA芯片的杂交的生物体信息处理装置和方法。将点边界461的内部的具有面积的碎片463设为点内区域522,将除去碎片463的点边界461的内部的区域设为点内区域521。对各点内区域521、522根据其可靠度设定标志f。不利用可靠度低的点内区域的数据。本发明可应用于测量DNA芯片的荧光强度的装置。
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公开(公告)号:CN101163958A
公开(公告)日:2008-04-16
申请号:CN200680013415.6
申请日:2006-04-12
Applicant: 索尼株式会社
IPC: G01N21/64
CPC classification number: G01N21/6452 , C12Q1/6816 , G01N21/253 , C12Q2565/501
Abstract: 本发明涉及一种不使结构变复杂而能够以低成本正确地测量DNA芯片的杂交的生物体信息处理装置和方法、程序以及记录介质。将点边界461的内部的具有面积的碎片463设为点内区域522,将除去碎片463的点边界461的内部的区域设为点内区域521。对各点内区域521、522根据其可靠度设定标志f。不利用可靠度低的点内区域的数据。本发明可应用于测量DNA芯片的荧光强度的装置。
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公开(公告)号:CN101156069A
公开(公告)日:2008-04-02
申请号:CN200680011155.9
申请日:2006-03-29
Applicant: 索尼株式会社
Inventor: 大户康纪
IPC: G01N33/53 , G01N27/447 , C12M1/00 , G01N37/00 , C12N15/09
CPC classification number: G01N27/44713 , B01F13/0077 , B01L3/502753 , B01L2300/0636 , B01L2300/0803 , B01L2300/0816 , B01L2300/0861 , B01L2400/0421 , C12Q2565/628
Abstract: 本发明涉及生物反应执行系统和生物反应执行方法,它们能够在向其中滴入了含有目标基因的溶液的、位于DNA芯片上的流动通道中产生电场并使得目标基因发生电泳迁移,本发明还涉及DNA芯片、信息处理系统和信息处理方法、计算机程序以及记录介质。交流电电源单元41向电磁感应产生器单元42提供交流电,电磁感应产生器单元42根据如此提供的交流电产生电磁感应,并在流动通道附近产生磁场,在此,所述流动通道是在所安装的DNA芯片43上生成的,并向其中滴入含有目标基因的溶液。同时,取消为消除如此生成的磁场而产生的电场之一,保留其它的电场。由于目标基因是带电的,因此有可能用仅保持在一个方向上的电场来使目标基因在于DNA芯片43上生成的流动通道中发生电泳迁移。
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公开(公告)号:CN101120251A
公开(公告)日:2008-02-06
申请号:CN200580048098.7
申请日:2005-11-18
Applicant: 索尼株式会社
CPC classification number: G06F19/20 , C12Q1/68 , C12Q1/6837 , G06F19/22 , C12Q2545/113
Abstract: 本发明的目的是提出新的基因表达量的分析和校正手段,提高基因表达量归一化的精确度。本发明提供基因表达量归一化方法,其包括:测定样品所含的在基因组中以基本上恒定比例存在的重复序列,从而获取所述样品中的细胞数,并将该细胞数作为对从同一样品获得的基因表达量进行归一化的指标。例如,从同一样品32分别获取DNA样品33和RNA样品34,将DNA样品33作为获取细胞数用的样品,将RNA样品34作为获取基因表达量用的样品,从而可以获取同一样品32中所含的细胞数和基因表达量。藉此,通过将获取的基因表达量换算为与一定细胞数相当的值,可以将其归一化为与其它基因表达量可比较的值。
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