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公开(公告)号:CN110564829B
公开(公告)日:2022-11-04
申请号:CN201910943149.6
申请日:2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种奶牛NCAM2基因CNV标记辅助检测泌乳性状的方法及其专用试剂盒:利用实时定量PCR技术,以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板,分别用两对引物P1、P2对牛NCAM2基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域进行扩增,最后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记,可加快奶牛优良产乳性能的选育进程。该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN112359120B
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN202011296046.4
申请日:2020-11-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MFN1基因CNV标记的方法及其应用:以云岭牛的血样基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增MFN1基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段,根据2*log22‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定云岭牛MFN1基因的拷贝数变异类型。与云岭牛生长数据的关联分析显示,MFN1基因不同拷贝数对个体生长发育有显著影响,其中缺失型个体的胸宽低于插入型个体。本发明在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记,可作为生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号:CN107400720A
公开(公告)日:2017-11-28
申请号:CN201710808013.5
申请日:2017-09-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种KLF3基因CNV标记辅助检测黄牛生长性状的方法及其专用试剂盒。基于实时荧光定量PCR技术,以黄牛基因组DNA为模板,扩增黄牛KLF3基因的拷贝数变异区域,并扩增牛通用转录因子BTF3基因作为内参,最后利用2-ΔΔCt方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立牛KLF3基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单,快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN111088327A
公开(公告)日:2020-05-01
申请号:CN202010006023.9
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种SIKE1基因CNV标记辅助检测黄牛体尺性状的方法及其应用:以黄牛血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增SIKE1基因CNV区域和内参基因BTF3的部分片段,根据定量结果并通过计算log22-ΔΔCt鉴定个体SIKE1基因的拷贝数变异类型。基于SIKE1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群,有利于加快云岭牛等的分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110592235A
公开(公告)日:2019-12-20
申请号:CN201910945253.9
申请日:2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测奶牛USP16基因CNV标记的方法及其应用:利用实时定量PCR技术,以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板,分别用引物对P1、P2扩增牛USP16基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域,最后利用2*2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记,可加快奶牛优良产乳性能的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107619857A
公开(公告)日:2018-01-23
申请号:CN201711003896.9
申请日:2017-10-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测肉牛KLF8基因CNV标记的方法及其应用:以肉牛品种郏县牛的血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增其KLF8基因CNV区域和内参基因BTF3,根据2*log2 2-ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型,鉴定其KLF8基因的拷贝数变异。与郏县牛生产数据的关联分析显示,KLF8不同拷贝数对郏县牛的生长发育有显著影响,其中缺失型个体的胸宽显著高于插入型和正常型个体。本发明在DNA水平上检测与肉牛生产性状密切相关的CNV,可作为肉牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号:CN111139303B
公开(公告)日:2022-07-05
申请号:CN202010006028.1
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CADM2基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以山羊的基因组DNA为模板,利用一对特异性PCR引物扩增山羊CADM2基因的拷贝数变异区域部分片段,并应用另外一对特异性PCR引物扩增山羊内参基因MC1R部分片段作为对照,最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。基于山羊CADM2基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立山羊遗传资源优势种群,有利于加快山羊分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN112359120A
公开(公告)日:2021-02-12
申请号:CN202011296046.4
申请日:2020-11-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MFN1基因CNV标记的方法及其应用:以云岭牛的血样基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增MFN1基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段,根据2*log22‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定云岭牛MFN1基因的拷贝数变异类型。与云岭牛生长数据的关联分析显示,MFN1基因不同拷贝数对个体生长发育有显著影响,其中缺失型个体的胸宽低于插入型个体。本发明在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记,可作为生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号:CN110564829A
公开(公告)日:2019-12-13
申请号:CN201910943149.6
申请日:2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种奶牛NCAM2基因CNV标记辅助检测泌乳性状的方法及其专用试剂盒:利用实时定量PCR技术,以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板,分别用两对引物P1、P2对牛NCAM2基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域进行扩增,最后利用2*2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记,可加快奶牛优良产乳性能的选育进程。该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN111088327B
公开(公告)日:2022-09-13
申请号:CN202010006023.9
申请日:2020-01-03
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6851 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种SIKE1基因CNV标记辅助检测黄牛体尺性状的方法及其应用:以黄牛血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR方法分别扩增SIKE1基因CNV区域和内参基因BTF3的部分片段,根据定量结果并通过计算log22‑ΔΔCt鉴定个体SIKE1基因的拷贝数变异类型。基于SIKE1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联,本发明提供的方法可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群,有利于加快云岭牛等的分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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