公开(公告)号：CN119252349A

公开(公告)日：2025-01-03

申请号：CN202411322726.7

申请日：2024-09-23

Applicant: 金华职业技术大学

Inventor： 史宇晨 ,  刘睿菲 ,  孔慧梅 ,  于倩 ,  吴湘杰 ,  胡静

IPC: G16B40/20 ,  G16B20/00 ,  G06F18/2135 ,  G06F18/241

Abstract: 本发明涉及单细胞转录组数据辅助AD分析分类的方法。从AD患者和年龄匹配的健康对照中获取脑组织样本，使用细胞分离技术对脑组织进行处理；然后采用高通量单细胞转录组测序平台对分离出的单细胞进行测序，进行数据质量控制，去除低质量细胞和低表达基因；对基因表达数据进行标准化处理，使用Log2转换和Z‑score标准化，消除不同样本间的技术偏差；使用主成分分析PCA、t‑SNE、UMAP的降维算法对高维数据进行降维处理；利用包括DESeq2、EdgeR的差异表达分析识别出AD患者和健康对照间显著差异的基因；采用GSEA进行基因集富集分析和采用包括KEGG、GO进行通路分析，确定与AD相关的关键基因通路和生物过程；将新样本的单细胞转录组数据输入训练好的分类模型，进行AD分类预测。